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質(zhì)粒plasmppt課件-文庫吧資料

2025-05-10 12:55本頁面
  

【正文】 均等地分配到兩個(gè)子細(xì)胞中,分配后的質(zhì)??赡茉诜峙涞鞍椎淖饔孟?,定位于細(xì)胞的特定區(qū)域。 細(xì)菌質(zhì)粒 DNA的分配模型圖 質(zhì)粒 DNA在位于細(xì)胞中央的復(fù)制體 (replisome)的作用下進(jìn)行復(fù)制。 因此 , SopB蛋白必須維持在適當(dāng)?shù)臐舛?, 才能保證 F質(zhì)粒在細(xì)胞內(nèi)的穩(wěn)定性 。 sopA和 sopB構(gòu)成一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位,其產(chǎn)物 SopA和SopB兩種蛋白協(xié)同抑制 sopAB操縱子的轉(zhuǎn)錄,屬于自體阻遏蛋白。質(zhì)粒的復(fù)制與分配是分開獨(dú)立進(jìn)行的,而且 par區(qū)還會使無親緣關(guān)系的其他質(zhì)粒保持穩(wěn)定。 par區(qū)叫做分配區(qū) (partition region)或分配座位 (partition locus): 是指在細(xì)胞分裂過程中使質(zhì)??截悢?shù)均等的分配到子 細(xì)胞中的質(zhì)粒 DNA序列。 對低拷貝質(zhì)粒而言,需要某種特定機(jī)制,將細(xì)胞分裂與質(zhì)粒復(fù)制協(xié)調(diào)起來,以保證每個(gè)細(xì)胞至少獲得一個(gè)拷貝。 要使質(zhì)粒能夠保持穩(wěn)定的遺傳,至少需要滿足下面兩個(gè)方面的條件: 在細(xì)胞分裂過程中,質(zhì)粒分配到子細(xì)胞的途徑可分為: 隨機(jī)分配 (random distribution) 主動分配 (active distribution) 這些質(zhì)粒的穩(wěn)定性是通過兩種機(jī)制來實(shí)現(xiàn)的: ( 1) 質(zhì)粒編碼的基因產(chǎn)物 , 如質(zhì)粒編碼的致死蛋白來抑制不含質(zhì)粒的子細(xì)胞 。 細(xì)菌種類 質(zhì)粒不相容群 代表性質(zhì)粒 革蘭氏陰性細(xì)菌 IncFⅠ F, R386, R455, ColV IncFⅡ R1, R100 IncFⅢ Col1BK98 IncFⅣ R124 IncA RA1 IncC R40a, R55 IncH R27, R726 IncI ColIbP9, R144, R483, R64, R621a IncM R69, R466b IncN R46, R15, N3, pKM101 IncO R16, R723 IncP RP1, RP4, R68, R751, R690, RK2 IncQ RSF1010, pKT212, pKT230, pGSS IncW R7K, R388, pSA747 IncX R6K 革蘭氏陽性細(xì)菌 pT181 pT181, pC221, pS194, pC223, pUB112, pE194 pUB110 pBC110, pBC16 pSN2 pSN2, pE12, pIM13 五、質(zhì)粒的穩(wěn)定性 (細(xì)胞分裂中的質(zhì)粒分配 ) 質(zhì)粒的不穩(wěn)定性( plasmid instability)包括兩個(gè)方面: 分離的不穩(wěn)定性( segregation instability):指在細(xì)胞分裂過程中,有一個(gè)細(xì)胞沒有獲得質(zhì)粒DNA,并最終增殖成為無質(zhì)粒的優(yōu)勢群體 結(jié)構(gòu)的不穩(wěn)定性( structural instability):指由于轉(zhuǎn)座作用或重組作用引起的質(zhì)粒 DNA的重排或缺失。 帶有不同復(fù)制子的質(zhì)粒屬于不同的不相容群,它們可以共存于同一細(xì)菌中。 ? 在細(xì)菌中已區(qū)分出大量的不相容群( Inc),同一種不相容群的質(zhì)粒享有調(diào)節(jié)它們復(fù)制子的共同機(jī)制。 例如, F質(zhì)粒和 ColE1質(zhì)粒二者是相容的,也就是說,它們分別屬于不同的不相容群( different inpatibility group)。對于高拷貝數(shù)質(zhì)粒而言,質(zhì)粒在子代細(xì)胞中的丟失需要多次分裂才能實(shí)現(xiàn)。由于性狀相近的質(zhì)粒通常具有相同或相似的復(fù)制調(diào)控機(jī)制,其阻遏物 (抑制物或重復(fù)序列 )亦相似,在調(diào)控時(shí),它們也能隨機(jī)地與其中的任一質(zhì)粒的復(fù)制區(qū)結(jié)合而阻遏了其復(fù)制過程,并進(jìn)而使之在子代細(xì)胞中丟失。 一般來說,同種質(zhì)粒衍生物是不相容的,而不同質(zhì)粒的 衍生物則可能是相容性的,也可能是不相容性的。 四、 不相容性和質(zhì)粒的類群 質(zhì)粒不相容性: 是指親緣關(guān)系相近的兩種質(zhì)粒,在非選擇性條件下常不能穩(wěn)定地存在于同一個(gè)細(xì)胞中,經(jīng)過若干代的培養(yǎng),只含有同一種質(zhì)粒的細(xì)胞越來越多,而含有兩種質(zhì)粒的細(xì)胞相對減少。 ?重復(fù)子質(zhì)粒的復(fù)制不僅受 RepA蛋白濃度的控制,而且受質(zhì)粒濃度,更確切地說重復(fù)子序列濃度的控制。 ?重復(fù)子能與復(fù)制必需的 RepA蛋白競爭性結(jié)合,從而抑制了質(zhì)粒的復(fù)制和拷貝數(shù)的增加。 ?copA自身啟動子帶動下從 repA基因的互補(bǔ)鏈進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,因此其 RNA與 repA的翻譯起始區(qū)重疊但轉(zhuǎn)錄方向相反,二者之間形成雙鏈結(jié)構(gòu),被染色體編碼的切割雙鏈 RNA的RNaseⅢ 降解。 ?質(zhì)粒復(fù)制起始所必需的 RepA蛋白能在兩個(gè)啟動子的作用下轉(zhuǎn)錄。例 如,rom /rop基因的缺失可使較早期組建的載體 pBR322在每個(gè)細(xì)菌細(xì)胞中的質(zhì)粒拷貝數(shù)從 15~20個(gè)增至 500個(gè)以上,在 rom/rop基因中插入一段外源DNA片段,則可導(dǎo)致致死性的大量質(zhì)粒 DNA復(fù)制。它促使這兩種 RNA分子的互補(bǔ)結(jié)合物由不穩(wěn)定的中間體變?yōu)楦€(wěn)定的結(jié)構(gòu)。該二聚體每個(gè)亞單位含有由一個(gè)轉(zhuǎn)角連接的兩個(gè) α螺旋,因而此二聚體是由 4個(gè) α螺旋組成的呈雙重對稱的緊密束狀結(jié)構(gòu)。 ROM蛋白通過促進(jìn) RNAⅠ 和 RNAⅡ 雜交體的形成,增強(qiáng) RNAⅠ 的負(fù)調(diào)節(jié)作用。 ColE1質(zhì)粒復(fù)制起點(diǎn)結(jié)構(gòu) 與 RNA I的配對有可能引起引物 RNA 二級結(jié)構(gòu)的改變 ,從而阻止了 3’OH 的產(chǎn)生( RNaseH 不能切割 ) 。 ?這一平衡的改變主要由 RNAⅠ 來控制, RNAⅠ 是由RNAⅡ 基因的反義鏈編碼的 108個(gè)堿基小分子轉(zhuǎn)錄物。 ?質(zhì)粒 DNA的合成依賴于復(fù)制起點(diǎn)處穩(wěn)定的 DNARNA II雜交體的形成。 ?colE1復(fù)制子不能影響質(zhì)粒復(fù)制所必需的宿主酶的活性,因此,一旦 DNA合成啟動后,便不能改變其速度或進(jìn)程。所得的 555個(gè)核苷酸的成熟 RNA II被 DNA聚合酶 I用作引物啟動前導(dǎo)鏈的合成。此約 750個(gè)核苷酸的起始轉(zhuǎn)錄物的 5’端折疊成復(fù)雜的二級結(jié)構(gòu),從而使 RNA產(chǎn)生一個(gè)富 G環(huán),后者與位于模板鏈復(fù)制起點(diǎn)上游 20個(gè)核苷酸處的質(zhì)粒 DNA富 C區(qū)正好匹配。 RNAⅡ 分子在轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)附近同互補(bǔ)的模板 DNA形成一種雜交分子,被 RNaseH酶所切割,從而釋放出 3′OH末端,作為供 DNA聚合酶 Ⅰ 合成 DNA的引物??刂拼朔N質(zhì)粒 DNA復(fù)制啟動的兩種關(guān)鍵因素 RNAI和 RNAⅡ ,以及另一種負(fù)調(diào)控因子Rop蛋白,都是由 ColE1 DNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的。其復(fù)制不需任何質(zhì)粒編碼的蛋白質(zhì),而是完全依賴于宿主提供的壽命較長的酶和蛋白質(zhì),包括分子伴侶、 DNA聚合酶 I和 Ⅲ , DNA依賴的 RNA聚合酶、核糖核酸酶 H (RNase H), DNA促旋酶和拓?fù)洚悩?gòu)酶 I。 ?屬于這一類復(fù)制調(diào)控的質(zhì)粒有 ColE pT18p15A、 pMB RSF10 CloDF1 R1等。 目前關(guān)于質(zhì)粒的調(diào)控大致可以分為兩種類型: 抑制物 靶位調(diào)控( inhibitortarget regulation) 重復(fù)子 競爭結(jié)合調(diào)控( iteronbinding regulation) 1. 抑制物 靶位調(diào)控 ?特點(diǎn)是依賴一小段反向轉(zhuǎn)錄的 RNA作為抑制物,通過與目標(biāo) RNA的互補(bǔ)結(jié)合阻止質(zhì)粒復(fù)制的起始。 三、 質(zhì)粒復(fù)制的調(diào)控 質(zhì)粒的復(fù)制機(jī)理與細(xì)菌染色體的基本相同,但二者之間的復(fù)制調(diào)控則有區(qū)別。 相反, RP RK2和 RSFl010及從 G+細(xì)菌中分離的滾環(huán)復(fù)制的質(zhì)粒都屬于廣寄主范圍 (broad host range)質(zhì)粒。質(zhì)粒的寄主范圍通常是由 ori區(qū)決定的。 ?ori區(qū)域常決定了質(zhì)粒的許多特性 , 如質(zhì)粒的寄主范圍和質(zhì)粒的拷貝數(shù) 。 2. 復(fù)制起點(diǎn) (
點(diǎn)擊復(fù)制文檔內(nèi)容
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