轉(zhuǎn)錄組rnaseq術(shù)語解釋-文庫吧資料
2025-04-14 04:52本頁面
【正文】 的相互關(guān)系提供準確、高效的篩選手段。其共同特點是都能從基因組上轉(zhuǎn)錄而來，不需要翻譯成蛋白即可在 RNA 水平上行使各自的生物學功能。指不編碼蛋白質(zhì)的RNA。36. small RNA對長度在1840bp的短 RNA 進行序列、結(jié)構(gòu)、表達、功能上的分析，主要進行miRNA，siRNA，piRNA 幾種類型 sRNA 的分析；可與 mRNA 關(guān)聯(lián)分析。34. de Bruijn graph使用 TRINITY 軟件拼接時，在“chrysalis”步驟中會將 ponent通過 overlap 關(guān)系構(gòu)建成 de Bruijn圖，便于獲取可變剪切的序列。33. ponentTRINITY 軟件拼接過程中，由于contig的構(gòu)造方法，使得各個contig之間不可能共享k個以上序列，因此這些 inchwormcontigs不能很好的表征各種可變剪切形式和同源基因等情況，軟件中“chrysalis”這一步驟將那些有重疊的contigs聚類，構(gòu)成ponents。之后將所有Contig按照序列長度由短到長進行排序，如獲得Contig1，Contig2，Contig3……..。32. Contig N50Reads拼接后會得到長度不同的Contigs。30. Contig高通量測序中利用軟件將具有一定長度overlap的reads連成更長的片段，這些通過reads overlap關(guān)系得到的不含N的組裝片段稱之為Contig。越接近1，說明兩個重復(fù)樣品相關(guān)性越強。其中，1表示變量完全正相關(guān)，0表示無關(guān)，1表示完全負相關(guān)。與生物學重復(fù)相比，技術(shù)重復(fù)不是完全獨立的，取平均值不能去除共有的系統(tǒng)偏差。26. 生物學重復(fù)（Biological Replicates）可以定義為使用來自不同抽提的RNA樣本進行雜交，例如，同一來源獨立制備的樣本，或者不同來源的樣本（不同組織或者一個細胞系的不同培養(yǎng)物）。24. 差異表達轉(zhuǎn)錄本（DifferentiallyExpressed Transcript，DET）指表達水平存在顯著差異的轉(zhuǎn)錄本。23. RNA編輯（RNA editing）是指在mRNA水平上改變遺傳信息的過程。21. 轉(zhuǎn)換(transition)同類型（嘌呤和嘌呤，或嘧啶和嘧啶）堿基之間的相互替換稱為轉(zhuǎn)換。但通常所說的SNP并不包括后兩種情況。19. SNP（Single Nucleotide Polymorphism）即單核苷酸多態(tài)性，主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。分子標記能對不同發(fā)育時期的個體、組織器官甚至細胞作檢測，數(shù)量極多，遍及整個基因組，多態(tài)性高，遺傳穩(wěn)定，不受環(huán)境及基因表達與否的影響。17. 插入片段大?。╥nsert size）通過檢測雙端序列在基因組上的起止位置，可以得到插入片段的實際長度，決定了測序的長度，是信息分析的重要參數(shù)。16. CDS（Coding sequ
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