【正文】 是單拷貝的， mRNA有 3′poly A。 ? 基因之間串聯(lián)重復(fù)排列； ? 多個不同的 tRNA基因組成一個串聯(lián)重復(fù)，各重復(fù)單元中 tRNA基因可以不相同，并單獨轉(zhuǎn)錄。 ? 非洲爪蟾卵母細(xì)胞的 5sRNA基因：富含 AT的序列，由不同的 15bp序列重復(fù)而成，（ CAAAGTTTGAGTTTT）這段序列的串連數(shù)不同，非轉(zhuǎn)錄的間隔區(qū)的長度會有所改變。 rRNA基因家族（ gene cluster） 5S rRNA 基因家族 ? 在所有染色體上都有，分布頻率較高。 ? 大多數(shù)真核生物 rRNA基因家族 集中分布在一條或幾條染色體上，以核仁區(qū)含量最高。 ? 功能：可能與基因轉(zhuǎn)錄 、 調(diào)控 、 加工有關(guān) 。 每個重復(fù)單元的長度為300bp， 含一個 Alu酶切位點 ， 因而得名 。 在基因家族結(jié)構(gòu)中經(jīng)常會看到基因簇結(jié)構(gòu)。 ? （占主體） 應(yīng)用： ? 1. 生物進(jìn)化 ? 2. DNA指紋圖譜（親子鑒定） ? 3. RFLP分析 檢測基因缺失、突變、擴(kuò)增 （三） 基因家族 gene family ? ? 在真核生物基因組中來源相同、結(jié)構(gòu)相似、功能相關(guān)的一組成串排列在一起的基因，稱 為基因家族（ gene family）。 分類 ? 衛(wèi)星 DNA按重復(fù)單元核苷酸的多少，可分為兩類： ? 小衛(wèi)星 DNA(minisatellite DNA )， 由幾百個核苷酸對的單元重復(fù)組成。 ? 重復(fù)單位常存在序列變異，反映衛(wèi)星 DNA可能在經(jīng)過串聯(lián)重復(fù)后發(fā)生突變、重復(fù)和缺失而得以進(jìn)化。由于這類序列的堿基組成不同于其他部份 （一般富含 A/T片斷，浮密度較?。?可用等密度梯度離心法將其與主體 DNA分開，因而稱為衛(wèi)星 DNA或隨體 DNA。 ? 在多數(shù)真核生物的基因組 DNA中，都含有 20%以上的高度重復(fù)序列，其特征之一是兩條鏈的不對稱性，它們構(gòu)成衛(wèi)星DNA。在基因組中有幾百到幾百萬個拷貝（重復(fù)次數(shù) 102 ~ 106 ） ，它們的長度差異很大，短的只有幾個 bp，長的有幾十個到幾百個 bp或更長。 ? 長周期分散的重復(fù)序列 5000bp ? 分兩種 ? 短周期分散的重復(fù)序列 100 ~ 300bp，主要存在于人、爪蟾、海膽等生物中，例如，Alu家族等。各家族成員有的重復(fù)串聯(lián)在一起，有的分散于非重復(fù)序列中相間排列。 一般無 RNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物（非編碼序列） ， 一般認(rèn)為與基因的表達(dá)調(diào)控有關(guān) (包括轉(zhuǎn)錄調(diào)控序列 ， 復(fù)制控制序列 ， 轉(zhuǎn)錄后的加工等 )。 ? 原因： 突變失活，啟動子缺陷。 ? 幾個基因都有功能 , 編碼同一個蛋白質(zhì)或 tRNA。 2. 輕度重復(fù)序列 ? 基因組中有 210個 拷貝，是慢速復(fù)性的一部分。在 β鏈基因中，又由幾個內(nèi)含子隔開，串聯(lián)在 11號染色體上。由幾個肽段的基因組成一個蛋白質(zhì)的全部基因，有些肽段的基因僅由內(nèi)含子隔開，而另一些肽段的基因則分布于幾條染色體上。 ? 真核生物的單拷貝基因是分散分布于整條染色體或不同染色體之中的。 ? 單拷貝序列又稱為非重復(fù)序列 ，在一個基因組中只有一個拷貝， 在 DNA復(fù)性曲線中，它是最慢速復(fù)性的部分 。 ? 來自不同生物的 DNA，如果反應(yīng)條件和DNA片段大小相同，則復(fù)雜度越大，復(fù)性速度就越慢，而 C0t1／ 2 值就越大。例如，（ ATAT） n的復(fù)雜度為 2，（ ATGC） n的復(fù)雜度為 4，噬菌體 T4是由 2 105不重復(fù)核苷酸對的 DNA分子組成，其復(fù)雜度為 2 105。 includes Alu sequences 2 and VNTRs or mini (micro) satellites Satellite (tandem) ~10% Highly repeated, low plexity sequences usually located in centromeres and telomeres 1 Some genes are repeated a few times to thousandsfold and thus would be in the repetitive DNA fraction。 ? 真核生物基因組的突出特點： ? 重復(fù)性、基因家族、不連續(xù)性。 2 turns of DNA plus spacer ? also includes H1 histone ? DNA與蛋白質(zhì)結(jié)合， 形成核小體，再纏繞成染色質(zhì)（染色體）； Nucleofilament structure ? 3. 基因組一般為雙倍體 （ diploid） ； ? 4. 基因為單順反子 。 Nucleosome structure Nucleosome core (left) ? 146 bp DNA。 （二） 大腸桿菌基因組結(jié)構(gòu)： ? 1. 基因組 DNA在 4000kb，估計有 3500個基因，已確定的基因有 900個，已確定有 260個基因具有操縱子結(jié)構(gòu)（ 75個操縱子中），每個基因平均長度 1000bp； ? 2. 已確定的基因中，多數(shù)是與代謝有關(guān)的酶、核糖體蛋白； ? 3. 大多數(shù)基因是隨機(jī)分布的，兩條單鏈作為模板的概率基本相等； ? 4. 多數(shù)基因都是單拷貝。 第二節(jié) 原核生物基因組結(jié)構(gòu) （一）細(xì)菌基因組的結(jié)構(gòu)特點： ? 1. 擬核（類核）結(jié)構(gòu)； ? 2. 存在 多順反子結(jié)構(gòu)； ? 3. 除 RNA基因外，基本是單拷貝的； ? 利于核糖體的快速組裝，短時間內(nèi)合成大量核糖體。 多順反子 mRNA:可編碼兩條或兩條以上蛋白質(zhì)分子的 mRNA的分子 。 ? 目前，在少數(shù)原核生物（大腸桿菌、病毒）中發(fā)現(xiàn)，在少數(shù)真核生物中也發(fā)現(xiàn)了類似的基因重疊現(xiàn)象（果蠅）。 5’… GCTGGTGGAAAATGAGGAAATTCAAT… 3’ DNA序列 Leu Val Glu Asn Glu Glu Ile Gln K蛋白 Ala Gly Gly Lys Ter A蛋白 FMetArg Lys Phe Asn C蛋白 噬菌體 G4一段 DNA序列內(nèi) A、 C、 K基因三重重疊 基因 讀框相同 ，只是起始部位不同 重疊基因 ? 實質(zhì)： 兩個基因雖共用一段核苷酸序列，但其讀碼結(jié)構(gòu)互不相同，編碼不同的蛋白質(zhì)。 ? 類型： ① 一個基因的核苷酸序列完全包含在另一個基因中； ② 兩個基因的核苷酸序列部分重疊； ③ 兩個基因只有一個堿基重疊。 其中非編碼序列只有217/5386，不足 5%。 （二）病毒基因組的結(jié)構(gòu)特點： ? ，大小差異較大； ? CAV DNA ，編碼 3種蛋白質(zhì) ? 乙肝病毒 RNA 3kb，編碼 4種蛋白質(zhì) ? 痘病毒 DNA 300kb，編碼幾百種蛋白 ? 基因組越小，編碼蛋白越少，對寄主依賴性越大。 第一節(jié) 病毒基因組的結(jié)構(gòu) （一）病毒的基本結(jié)構(gòu) ? 外殼蛋白 ： 識別、侵襲特定的宿主細(xì) 胞，并保護(hù)基因組不被 核酸酶破壞； ? DNA（ RNA）： 編碼結(jié)構(gòu)蛋白和少量 調(diào)控蛋白。 almost all of its plexity is in singlecopy DNA.