遺傳作圖及基因定位-文庫(kù)吧資料
2025-05-23 22:15本頁(yè)面
【正文】 Ho . et al. 2021 Grain dry milling properties, position and vitreousness S233。 S. Y. 1998 Barley Callus growth,subsequent shoot differentiation ratio and green shoot ratio in immature embryo culture Mano Y. et al. 2021 Resistance against powdery mildew。sc=Download Mapmaker BC,F2,DH,RI 作物 QTL定位研究進(jìn)展 ? 隨著遺傳圖譜的日益飽和以及 QTL定位方法的不斷完善 ， 植物 QTL定位研究發(fā)展很快 ， 從模式植物水稻 、 擬南芥的深入研究逐步擴(kuò)展到玉米 、 小麥 、 大豆 、 棉花等重要作物的諸多重要性狀 （ 表 3） 。 Name Source Companion program① Functions② Designs③ Mapmaker/QTL b/mapmaker3 M a p m a k e r / M a p manager QT SIM/CIM BC,F2,F3 Q T L Cartographer art/ M a p m a k e r / M a p manager QT SIM/CIM,PT BCx,SFx,RFx,RI,others Map manager QT du/ Q T L Cartographer/Mapmaker/Qgene SIM/CIM,PT BC,F2,RI QGeneTM m Map manager QT SIM,PT BCx,F2,F3,DH,others MapQTLTM Joinmap SIM/CIM,PT BC,F2,Risx,DH,CP PLABQTL e/ipsp/ SIM/CIM BC,F2,SFx MQTL a/pub/geics/ sCIM,PT BC,DH,RI Multimapper ~mjs/ Q T L Cartographer/Mapmaker CIM BC,F2 The QTL Caf233。 ? 利用這些效應(yīng)估計(jì)值 ,可預(yù)測(cè)基于 QTL 主效應(yīng)的普通雜種優(yōu)勢(shì)和基于 QTL 與環(huán)境互作效應(yīng)的互作雜種優(yōu)勢(shì) 。 （ Mixed Composite Interval Mapping） ? 朱軍提出了用隨機(jī)效應(yīng)的預(yù)測(cè)方法獲得基因型效應(yīng)及基因型與環(huán)境互作效應(yīng)，然后再用區(qū)間作圖法進(jìn)行遺傳主效應(yīng)及基因型與環(huán)境互作效應(yīng)的 QTL分析。 ? 利用 MIM法還能估計(jì)和分析 QTL之間的上位性 、個(gè)體的基因型值和數(shù)量性狀的遺傳力 。 ? 復(fù)合區(qū)間作圖法的主要優(yōu)點(diǎn)是： ? ①仍采用 QTL似然圖來(lái)顯示 QTL的可能位置及顯著程度，從而保持了區(qū)間作圖法的優(yōu)點(diǎn)； ? ②一次只檢驗(yàn)一個(gè)區(qū)間，把對(duì)多個(gè) QTL的多維搜索降低為一維搜索； ? ③假如不存在上位性和 QTL與環(huán)境互作， QTL的位置和效應(yīng)估計(jì)是漸近無(wú)偏的； ? ④以所選擇的多個(gè)標(biāo)記為條件，在較大程度上控制了背景遺傳效應(yīng)，提高了作圖的精度和效率。 復(fù)合區(qū)間作圖法（ Composite Interval Mapping, CIM） ? 復(fù)合區(qū)間作圖法是 Zeng系統(tǒng)研究了多元線性回歸方法 (一個(gè)因變量和多個(gè)自變量間的相關(guān)關(guān)系 )進(jìn)行 QTL作圖的理論基礎(chǔ)，進(jìn)而提出把多元回歸與區(qū)間作圖結(jié)合起來(lái)的 QTL定位方法。 區(qū)間作圖法一度成為 QTL作圖的標(biāo)準(zhǔn)方法 。當(dāng) LOD值超過(guò)某一給定的臨界值時(shí) ， 即表明存在一個(gè) QTL， ? 其置信區(qū)間為對(duì)應(yīng)于峰兩側(cè)各下降 1個(gè) LOD值的圖譜區(qū)間 。 ? 該方法借助于完整的分子標(biāo)記連鎖圖譜 ， 計(jì)算基因組任意位置上兩個(gè)相鄰標(biāo)記之間存在或不存在 QTL的似然比的對(duì)數(shù) （ LOD值 ） 。 ? 但傳統(tǒng)的單標(biāo)記分析方法存在許多缺點(diǎn)： ? ①不能確定標(biāo)記是與一個(gè) QTL連鎖還是與幾個(gè)QTL連鎖； ? ②無(wú)法確切估計(jì) QTL的可能位置； ? ③遺傳效應(yīng)與重組率混合在一起，導(dǎo)致低估了QTL的遺傳效應(yīng)； ? ④容易出現(xiàn)假陽(yáng)性； ? ⑤檢測(cè)效率不高，所需的個(gè)體數(shù)較多 , ? ⑥ 對(duì)于某標(biāo)記而言，基因型缺失的個(gè)體必須剔除。 單標(biāo)記分析法 ? 單標(biāo)記分析法就是通過(guò) t 測(cè)驗(yàn)、方差分析、回歸分析、似然比測(cè)驗(yàn)或最大似然估計(jì)，比
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