遺傳學(xué)第八章數(shù)量性狀的遺傳-資料下載頁(yè)
2025-05-12 18:18本頁(yè)面
【正文】 蓋整個(gè)基因組，控制數(shù)量性狀的基因 ( Qi )兩側(cè)會(huì)有相連鎖的分子標(biāo)記 ( M i 和 M i+ )。這些與數(shù)量性狀基因緊密連鎖的分子標(biāo)記將表現(xiàn)不同程度的遺傳效應(yīng)。 MM Mm mm MM Mmmm Qq qq qqQq Qq qq qqQq Qq qq qqQq單標(biāo)記和單基因 作圖群體數(shù)量性狀數(shù)據(jù)標(biāo)記數(shù)據(jù)連鎖遺傳圖 統(tǒng)計(jì)分析 QT L定 位二、 QTL作圖一般步驟 適于 QTL作圖的群體是待測(cè)數(shù)量性狀存在廣泛變異，多個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)處于分離狀態(tài)的群體。一般是由親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的親本間雜交，再經(jīng)自交、回交等方法構(gòu)建。 常用的群體有 F2群體、回交（ BC）群體、雙單倍體（ doubled haploids, DH）群體，重組近交系（ rebinant inbred lines, RIL）群體等。其中 DH群體和 RIL群體可以永久使用。 用群體的雙親檢測(cè)分子標(biāo)記的多態(tài)性。 用多態(tài)性分子標(biāo)記檢測(cè)分離世代群體中每一個(gè)體（系）的標(biāo)記基因型值。 各種分子標(biāo)記最后顯示的都是電泳分離的帶譜，所以個(gè)體的標(biāo)記基因型需要將每個(gè)標(biāo)記的帶紋與親本比較并賦值來(lái)記錄，例如在共顯性情況下，作圖群體中應(yīng)含有P1， P2和雜合型 3種帶型，這 3種帶型即代表某一分子標(biāo)記的 3種基因型。 構(gòu)建分子標(biāo)記連鎖圖譜（單標(biāo)記分析法除外） 測(cè)定作圖群體的每個(gè)個(gè)體 （系） 數(shù)量性狀值。 用統(tǒng)計(jì)方法分析數(shù)量性狀與標(biāo)記基因型值之間是否存在關(guān)聯(lián)，確定 QTL在標(biāo)記遺傳圖譜上的數(shù)目、位置，估計(jì) QTL的效應(yīng)。 1 .單標(biāo)記分析法 ◆ 單標(biāo)記分析法通過(guò)方差分析、回歸分析或似然比檢驗(yàn)，比較單個(gè)標(biāo)記基因型 ( MM 、 Mm 和 mm ) 數(shù)量性狀均值的差異。 ◆存在顯著差異，則說(shuō)明控制該數(shù)量性狀的 QTL與標(biāo)記有連鎖。 ◆單一標(biāo)記分析法不需要完整的分子標(biāo)記連鎖圖譜。 三、 QTL作圖的統(tǒng)計(jì)方法 2 區(qū)間作圖法 以正態(tài)混合分布的最大似然函數(shù)和簡(jiǎn)單回歸模型，借助于完整的分子標(biāo)記圖譜，計(jì)算基因組的任一相鄰標(biāo)記 ( M i和M i+ ) 之間存在和不存在 QTL(Qi )的似然函數(shù)比值的對(duì)數(shù) (LOD值 )。 根據(jù)整個(gè)染色體上各點(diǎn)處的 LOD值可以描繪出一個(gè) QTL在該染色體上存在與否的似然圖譜。 QTL的可能位置用 LOD支持區(qū)間表示出來(lái)。 QTL的效應(yīng)由回歸系數(shù)估計(jì)值推斷。 3. 復(fù)合區(qū)間作圖法 ◆ 對(duì)某一特定標(biāo)記區(qū)間進(jìn)行檢測(cè)時(shí)，將與其它 QTL連鎖的標(biāo)記也擬合在模型中以控制背景遺傳效應(yīng)。 RM545 RM517 RM251 RM232 RM554 RM156 RM55 RM514 RM85 RM569A RM520 RM60 RM489 RM552C RM293 3 RM518 RM167B RM252 RM317 RM209B RM349 RM559 RM558C RM471 RM241 RM564A 4 RM413 RM574 RM440 RM3467 RM87 RM334 RM507 RM434B RM249 RM164 RM13 RM3351 5 RM204 RM314 RM564B RM528 RM275 RM340 RM345 RM540 RM549 RM587 RM541 6 RM53 RM71 RM262 RM526 RM263A RM318 RM250 RM213 RM138 RM279 RM233A RM485 RM324 RM341 RM5897 RM4C 2 RM259 RM220 RM580 RM147B RM9 RM488 RM443 RM297 RM315 RM14 RM84 RM428 RM499 RM495 RM493 RM3602 1 RM52 RM339 RM135B RM531 RM230 RM264 RM506 RM38 RM25 RM547 RM44 RM152 8 RM101 RM270 RM519 RM235 RM17 RM415 RM453 RM263B RM501B RM277 RM309 RM12 12 RM457 RM206 RM21 RM187 RM184B RM144 RM202 RM332 RM20B RM287 RM552A RM295B 11 RM216 RM304 RM228 RM590 RM474 RM271 RM269A RM239 RM501C RM504B 10 RM346 RM118 RM172 RM295A RM147C RM320 RM180 RM481 Rc RM214 RM18 7 RM234 RM248 RM524 RM242 RM215 RM201 RM205 RM209C RM296 RM444 RM566 RM434A RM257 RM473F 9 0 10 20 Map scale in centiMans (Gu et al. 2022 Geics) A Framework Geic Map of Weedy Rice Quantitative Trait loci (QTLs) for Weedy Adaptive Traits 3 4 6 7 8 12 (Gu et al., 2022 Theor. Appl. Ge.) 1 (Gu et al., 2022 Geics) qSD4 qSD6 qSD72 qSD71 qSD12 qSD1 qSD8 Seed dormancy qSH4 qSH3 qSH7 qSH8 Seed shattering qAL41 qAL42 qAL8 Awn length qHC4 qHC7 Black hull color qHC1 qPC7 Red pericarp color QTL 性質(zhì) ?QTL與基因 QTL可能是一個(gè)基因，也可能包含多個(gè)基因，還有可能是一個(gè)區(qū)段。 ?QTL群體特征 根據(jù)不同群體確定的 QTL會(huì)有差異。注意把 QTL與具體的群體相聯(lián)系。 ?QTL有統(tǒng)計(jì)學(xué)特征 統(tǒng)計(jì)分析確定的 QTL的位置也并非物理上的位置。所以 QTL位置與效應(yīng)均有概率上的含意。 ?由 QTL定位得到的遺傳圖譜可以進(jìn)一步轉(zhuǎn)換成物理圖譜，對(duì) QTL進(jìn)行克隆和序列分析。 ?用于標(biāo)記輔助選擇。 ?可以提供與雜種優(yōu)勢(shì)有關(guān)的信息，預(yù)測(cè)雜種優(yōu)勢(shì)。 QTL分析的應(yīng)用前景
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