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2025-04-14 06:13本頁(yè)面
  

【正文】 k中記錄的基因名稱,還有很多別名,比如MGC70609, VEGF, VEGFA, VPF;在這里可以看到該基因在染色體上的位置。9 S。 c Q8 ^39。 } genbk02- ( KB)07810 18:08點(diǎn)擊VEGFA后出現(xiàn)的界面:6 j。 t$ _/ z+ C: B genbk02- ( KB)07810 18:08下面可以看到Genomic regions, transcripts, and products,這里顯示了該基因在基因組中的位置,以及轉(zhuǎn)錄本的生成情況:$ T. J. K5 M2 g Kgenbk02- ( KB)07810 18:08可以看見目的基因的mRNA的鏈接()和蛋白質(zhì)的鏈接( )。有的基因也許只有一個(gè)編碼序列,但有的基因有很多的mRNA剪接體,都是歸在一個(gè)基因名稱下面。比如,在VEGF基因下面有7個(gè)序列,分別是vascular endothelial growth factor A isoform a, isoform c, isoform d, isoform e, isoform f , isoform g, isoform b precursor ,哪個(gè)是想找的基因呢?這就需要根據(jù)查閱的文獻(xiàn)以及在這些基因序列后面的解釋來確定。$ f8 w* D( V3 W: B. Hamp。 genbk02- ( KB)07810 18:08如果想找的基因是第一個(gè)序列即isoform a, ,得到如下界面:. P~/ F0 U。 ]genbk02- ( KB)07810 18:08對(duì)于一些常用的GENE,如果只知道縮寫,:, b R9 m39。 Q! n。 D. H l! oPubMed使用說明39。 P7 X3 z+ b8 ] Z, LPubMed簡(jiǎn)介:PubMed是美國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)下屬的國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開發(fā)的、基于WWW的查詢系統(tǒng)。是NCBI Entrez 數(shù)個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)查詢系統(tǒng)下中的一個(gè)。提供免費(fèi)的MEDLINE、PREMEDLINE與其他相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)接入服務(wù),MEDLINE是一個(gè)擁有1億字條的巨大數(shù)據(jù)庫(kù)。PubMed也包含著與提供期刊全文的出版商網(wǎng)址的鏈接,來自第三方的生物 學(xué)數(shù)據(jù),序列中心的數(shù)據(jù)等等。提供與綜合分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的鏈接與接入服務(wù),這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)歸NCBI所有,其內(nèi)容包括:DNA與蛋白質(zhì)序列,基因圖數(shù)據(jù)、3D蛋白構(gòu)象,人類孟德爾遺傳在線。 g2 e g x5 g頁(yè)面介紹:/ ]。 |7 S* }3 h, G ( KB)07810 18:24在瀏覽器中的URL地址框中健入,將進(jìn)入Pubmed的主頁(yè)面。如圖:。 s) ~ j( d! o0 k, x( X1 U1. 主頁(yè)面左側(cè)框的介紹:* s9 V {7 b |amp。 P4 k/ {3 u ( KB)07810 18:24主界面的左側(cè)框有:1 h n% @39。 P% x) W% Z8 J Journal Browser 期刊瀏覽 4 qamp。 Q0 F0 K6 v. W1 } MeSh Browser可以用它來分層流覽MeSH表 ! W0 \。 y0 K* W Single Citation Matcher通過填表的形式輸入期刊的信息可以找到某單篇的文獻(xiàn)或整個(gè)期刊的內(nèi)容% I5 F6 t3 d8 \, B/ s2 m Batch Citution Matcher用一種特定的形式輸入期刊的信息一次搜索多篇文獻(xiàn)。 H5 K39。 a6 q1 l h/ ^1 Z Clinical Queries這一部分為臨床醫(yī)生設(shè)置,通過過濾的方式將搜索的文獻(xiàn)固定在4個(gè)范圍:治療、診斷、病原學(xué)與預(yù)后。4 P* l2 E8 k3 t+ m* ~: b0 z Old PubMed (使用以前的PubMed查詢方式)6 `7 Y( w+ g9 Ts! C+ J1 wC3 nRelated Resources :4 u! H) ? d7 [% lamp。 u Order , 但這是要收費(fèi)的。2 O1 |: P8 e5 m! S NLM Mobile:可利用流動(dòng)的手機(jī)進(jìn)行查詢的服務(wù)。 E/ r8 [$ ~。 _. @ NLM Catalog:期刊具體詳細(xì)信息。39。 Q39。 Sz39。 ^39。 n S. b5 a$ X+ W* @ NLM Gateway:數(shù)據(jù)庫(kù)入口 B! F/ ?* ~3 U) x TOXNET:提供了毒理學(xué),危險(xiǎn)化學(xué)藥品,環(huán)境健康以及有毒物質(zhì)釋放的數(shù)據(jù)庫(kù) 3 G. M, B4 a O. N7 R3 E Consumer Health提供與Medline plus的鏈接,Medline plus是與消費(fèi)者健康信息相關(guān)的國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館的網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)8 _3 _amp。 S* n6 N6 f3 iamp。 _ X4 k8 s Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH資助的臨床研究成果公2 S0 id6 v) c4 ^. ~% }0 ?: ^ :提供了關(guān)于政府或者私人支持的在自愿者上進(jìn)行的臨床研究最新信,能夠告訴你進(jìn)行該研究的參與者,位置以及電話等一系列詳細(xì)信息。 f5 q. l1 A1 M0 i PubMed Central:是美國(guó)國(guó)家健康研究所提供的一個(gè)關(guān)于生物醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)的全文免費(fèi)期刊庫(kù)。 U3 R$ A6 L4 _39。 ]39。 i Grateful Med是對(duì)另一個(gè)NLM基于網(wǎng)絡(luò)的查詢系統(tǒng)的鏈接。Grateful Med也提供MEDLINE的接入,并且還有一些其他的數(shù)據(jù)庫(kù)如AIDSLINE、HISTLINE等等。$ Iamp。 V) ]/ k0 U4 B E0 y簡(jiǎn)單檢索:6 D9 H5 Qamp。 } @0 z. V* S  登陸PUBMED檢索系統(tǒng)主頁(yè),在頁(yè)面上部的檢索框中輸入檢索詞或幾個(gè)檢索詞,然后單擊go按鈕或按回車鍵。+ I. {39。 F3 B。 l( q6 Z7 g2 j ( KB)07810 18:24  假如是查找與gallstone、pain有關(guān)的文獻(xiàn)。在對(duì)話框中輸入查詢?cè)~。比如輸入gallstone pain,然后單擊“go”按鈕或按回車鍵,PubMed將會(huì)自動(dòng)開始檢索,并將檢索到的相關(guān)條目顯示在屏幕上。4 k$ V6 K2 [39。 L h z4 M1 J3 p ( KB)07810 18:24  可以隨時(shí)向查詢框輸入查詢?cè)~,點(diǎn)擊“go”按鈕開始新的查詢?!癱lear”按鈕可以清除查詢框中的內(nèi)容,然后開始一個(gè)新的查詢。amp。 H, O W% z1 e9 Z39。 ^! v M ( KB)07810 18:24  在查詢框前search提示后有一個(gè)下拉式菜單,可以在這里選擇其他的信息資源或NCBI的數(shù)據(jù)庫(kù)。, m+ e3 e3 `% zamp。 } Structure 搜索分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)(MMDB)The Molecular Modeling Database,這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)保存的是由X線晶體成像、NMR分光光度法建立的三維分子結(jié)構(gòu)。/ YF! _, L% x。 H$ d Genome 提供所有基因與染色體紀(jì)錄與圖片的查詢服務(wù),這個(gè)庫(kù)中數(shù)以百萬(wàn)的基因序列是由龐大的基因排序工作得來的。9 L。 a4 \: | r* Q9 Xr7 D PopSet 這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中的內(nèi)容是由相關(guān)種族、人類發(fā)展、突變研究得來的人類進(jìn)化與人種差異的結(jié)果。: r5 b3 L* X, i( B |注意事項(xiàng):) K C. P5 W% W8 l2 H 在檢索時(shí),要明確檢索的關(guān)鍵詞,同時(shí)要考慮到關(guān)鍵詞的同義詞,還可以利用限定時(shí)間和研究團(tuán)隊(duì)來精簡(jiǎn)檢索范圍。* u: d。 {) [: x5 r 利用布爾運(yùn)算提高檢索效率,最常用的三種:是and,or和not( G4 S7 Q39。 c7 w8 Gamp。 Qamp。 }檢索類型:3 w6 J1 n6 S, V/ D 主題檢索: 在檢索框中鍵入英文單詞或短語(yǔ)(大寫或小寫均可)。然后回車或點(diǎn)擊Go, Wamp。 x a f0 x 作者檢索:格式:格式為:著者姓 空格 名字首字母縮寫$ x \5 u! }+ c1 o/ q. C 刊名檢索:可以輸入期刊全名,也可輸入期刊簡(jiǎn)寫或期刊的ISSN號(hào): ? m3 c。 v。 U, O v( k, C 日期范圍檢索:日期的錄入格式為YYYY/MM/DD;如:2005/09/08 也可以不錄月份和日子,如:2005或2005/09。3 n5 P0 A$ D+ e0 c! V P 檢索帶文摘的記錄:格式:檢索詞AND has abstract ! T2 e39。 } U O3 E39。 s: m1 布爾邏輯檢索:利用 and or not定義檢索。5 Z6 ?! ^: L) Z5 B檢索結(jié)果: o6 W* L) o/ ?! S檢索結(jié)果默認(rèn)的顯示方式:是Summary格式,每頁(yè)20條記錄,以時(shí)間倒序排列。顯示作者,文章題目,以及文章來源的一些信息: w. z ]+ z) x% F* F( Y. n% e u, w ( KB)07810 18:24  可以通過點(diǎn)擊Display 選擇其他的顯示格式,同時(shí)在show后的下拉菜單選擇每頁(yè)的顯示數(shù)量可進(jìn)行5102050100200最多每頁(yè)顯示500條數(shù)據(jù)。Sort by 可以利用檢索結(jié)果的作者,其刊名或更新時(shí)間來進(jìn)行排序顯示。6 |3 N0 P! z) ^8 a% e  如果只顯示其中的一條記錄,點(diǎn)擊所選的記錄的題目進(jìn)入查看詳細(xì)的信息:可以看到文章的數(shù)據(jù)庫(kù)鏈接,相鏈接的數(shù)據(jù)庫(kù)如果已經(jīng)購(gòu)買,就可以看到全文。Pubmed只提供相應(yīng)的摘要。/ ox: z8 c% b% G5 s Y1 ^39。 L高級(jí)
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