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正文內(nèi)容

中華大學(xué)生物資訊學(xué)系專題報告-資料下載頁

2025-04-04 23:07本頁面
  

【正文】 後再經(jīng)由老師耐心的教導(dǎo)下,讓我們學(xué)到寫程式的技巧,使得專題得以順利進(jìn)行。四、主要成果 程式完成之後,在Inparanoid中做搜尋,會發(fā)生搜尋不到任何東西的情況(圖九),但經(jīng)由我們所提供的程式轉(zhuǎn)換成WormBase資料庫中WBGene00006765擷取碼之後,就可以在Inparanoid網(wǎng)頁中找到該同源蛋白的資料(圖十),由這個例子我們可以利用這個程式在不同的網(wǎng)站,得到不同的應(yīng)用圖九: 。圖十: WBGene00006765在Inparanoid中作搜尋的結(jié)果。花費時間:在轉(zhuǎn)換擷取碼轉(zhuǎn)換時,每次執(zhí)行時間約在一分鐘內(nèi)完成。使用記憶體:使用電腦空間記憶體約20000K五、評估與展望未來希望可以增加更多的資料庫蛋白質(zhì)擷取碼供使用者查詢。一些檔案太大的蛋白質(zhì)資料庫截取碼無法轉(zhuǎn)換,藉由升級電腦配備、增加記憶體之後,再修改程式二維陣列大小,讓使用者有更多元、完整的蛋白質(zhì)截取碼可以查詢。 程式視窗化設(shè)計方面,仍有一些可以改進(jìn)的空間。未來蒐集每個使用者實際使用蛋白質(zhì)擷取碼轉(zhuǎn)換與同源蛋白質(zhì)程式介面時的意見,我們會參考使用者的需求與差異性,進(jìn)行程式的修改與加強(qiáng),讓使用者查詢時更符合自己的需求、更方便。六、結(jié)語 每個資料庫都有自己蛋白質(zhì)序列的編碼方式,若把某個資料庫的蛋白質(zhì)擷取碼,取到另外的資料庫上搜尋,會因為編碼方式的不同而找不到擷取碼。而最後這個程式除了視窗化蛋白質(zhì)擷取碼的轉(zhuǎn)換,還提供了同源蛋白質(zhì)物種的資料,讓使用者可以大幅減少在網(wǎng)路上查詢蛋白質(zhì)擷取碼轉(zhuǎn)換與同源蛋白質(zhì)物種時的複雜度與時間。七、銘謝本次專題能夠順利完成,要特別感謝我們的指導(dǎo)教授侯玉松老師不厭其煩的耐心教導(dǎo),在百忙之中抽出時間來與我們進(jìn)行討論,並且不斷的鼓勵我們,而當(dāng)我們遇上困難時會帶領(lǐng)我們思考並找出解決方法,讓我們不僅可以順利的進(jìn)行專題還可以從討論之中獲得更多知識,而在專題之外老師也會關(guān)心我們的生活情況,並且會建議我們畢業(yè)之後的發(fā)展,可謂我們的良師與益友,所以在這送上最誠摯的感謝。
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