中華大學(xué)生物資訊學(xué)系專題報告(文件)
【正文】 二)。表一:專題流程圖(1)進(jìn)行資料整合 由於PIR提供的資料過於凌亂(圖一)，所以我們利用程式，先進(jìn)行整理，整理出7個資料庫對應(yīng)UNIPORT的擷取碼，例如CYGD有6644筆、Wormbase有22833筆、TAIR有26459筆 、Ensembl有223568筆、dictyBase有12750筆、FlyBase有38724筆、ZFIN有18158筆。利用快速排序法，將資料經(jīng)過排序後，再由二分搜尋法來對我們欲搜尋的目標(biāo)進(jìn)行搜尋。圖六:紅框中顯示線蟲與果蠅為同源蛋白的轉(zhuǎn)換表。這樣子我們就能將這些在網(wǎng)站上繁雜的資料搜尋精簡化，增加使用者搜尋的便利性，減少花費(fèi)把找到後的擷取碼再貼到找同源網(wǎng)站的複雜性與時間。(三)主要困難與解決之道 (1)專題進(jìn)行初期最大的困難是沒有相關(guān)的資料。(3) 建立對照表後，某部分資料太龐大，導(dǎo)致程式無法執(zhí)行。圖十: WBGene00006765在Inparanoid中作搜尋的結(jié)果。 程式視窗化設(shè)計方面，仍有一些可以改進(jìn)的空間。七、銘謝本次專題能夠順利完成，要特別感謝我們的指導(dǎo)教授侯玉松老師不厭其煩的耐心教導(dǎo)，在百忙之中抽出時間來與我們進(jìn)行討論，並且不斷的鼓勵我們，而當(dāng)我們遇上困難時會帶領(lǐng)我們思考並找出解決方法，讓我們不僅可以順利的進(jìn)行專題還可以從討論之中獲得更多知識，而在專題之外老師也會關(guān)心我們的生活情況，並且會建議我們畢業(yè)之後的發(fā)展，可謂我們的良師與益友，所以在這送上最誠摯的感謝。六、結(jié)語 每個資料庫都有自己蛋白質(zhì)序列的編碼方式，若把某個資料庫的蛋白質(zhì)擷取碼，取到另外的資料庫上搜尋，會因為編碼方式的不同而找不到擷取碼。使用記憶體:使用電腦空間記憶體約20000K五、評估與展望未來希望可以增加更多的資料庫蛋白質(zhì)擷取碼供使用者查詢。(4)程式技巧不足 當(dāng)遇到程式有問題時，我們利用身邊的書籍查詢，例如C++語言與C++Builder語言，最後再經(jīng)由老師耐心的教導(dǎo)下，讓我們學(xué)到寫程式
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