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[高等教育]第二章遺傳學圖譜-資料下載頁

2025-02-22 00:21本頁面
  

【正文】 0= — 缺資料 167。 2 遺傳學圖譜 167。 基因組學 杭州師范大學生命與環(huán)境科學學院 向太和 通過兩點分析 , 計算各座位之間的連鎖關(guān)系 , 并把基因座位劃分為若干個連鎖群 。 屏幕上將出現(xiàn): group 1: 1 4 12 35 … group 2: 2 7 18 42 … … 通過設(shè)臵 LOD值,可以改變連鎖群的數(shù)目。 LOD值增大,連鎖群的數(shù)目也會增大。 LOD值 ,其分群的可靠性較大。當座位數(shù)足夠大時,連鎖群的數(shù)目與單倍體的染色體數(shù)目相同。 分群( group): 基因組學 杭州師范大學生命與環(huán)境科學學院 向太和 排序 ( sequence) : 通過多點分析,可以計算出在同一連鎖群內(nèi)不同排列順序下,各座位之間的距離和連鎖群的總長度。 167。 2 遺傳學圖譜 167。 比較 ( pare) : 通過比較同一連鎖群內(nèi)不同排列順序的作圖結(jié)果,找出loglikelihood(對數(shù)似然值)為最大的排列方式為最合理的排列方式。 基因組學 杭州師范大學生命與環(huán)境科學學院 向太和 作圖 ( map) :顯示最后的作圖結(jié)果 。 D i s t M a rk e rcM Id N a m e(71) R G4 7 21 9 .2(50) R G2 4 61 6 .1(1 5 4 ) K54 . 8(1 5 9 ) U 1 04 . 7(75) R G5 3 21 5 .3(1 6 0 ) W11 5 .5(39) R G1 7 31 5 .0(1 6 3 ) A m y 1 B3 . 8(1 0 8 ) R Z 2 7 63 . 3(32) R G1 4 63 4 .3(57) R G3 4 52 . 5(60) R G3 8 12 3 .5(1 0 2 ) R Z 1 98 . 2(84) R G6 9 01 3 .2(1 4 1 ) R Z 7 3 03 3 .1(1 4 3 ) R Z 8 0 12 . 6(90) R G8 1 09 . 2(55) R G3 3 11D i s t M a rk e rcM Id N a m e(66) R G4 3 71 3 .0(76) R G5 4 45 . 3(37) R G1 7 12 2 .2(33) R G1 5 72 7 .4(1 1 0 ) R Z 3 1 86 . 3(1 6 7 ) P a l I2 9 .3(1 2 9 ) R Z 5 81 0 .2(12) C D O6 8 68 . 8(1 6 2 ) A m y 1 A / C1 2 .8(95) R G9 58 . 4(82) R G6 5 45 . 1(52) R G2 5 61 0 .0(1 0 4 ) R Z 2 1 35 . 4(99) R Z 1 2 31 3 .1(74) R G5 2 02D i s t M a rk e rcM Id N a m e(25) R G1 0 47 . 7(58) R G3 4 81 3 .2(1 1 1 ) R Z 3 2 96 . 9(1 4 5 ) R Z 8 9 29 . 8(23) R G1 0 02 . 8(43) R G1 9 11 7 .5(1 3 9 ) R Z 6 7 84 1 .6(1 2 8 ) R Z 5 7 43 7 .1(1 0 9 ) R Z 2 8 41 5 .6(1 1 5 ) R Z 3 9 41 8 .5(1 5 6 ) p R D 1 0 A2 . 5(1 1 8 ) R Z 4 0 35 . 0(40) R G1 7 92 8 .6(4) C D O3 3 71 . 9(1 1 2 ) R Z 3 3 7 A2 2 .5(1 2 1 ) R Z 4 4 81 5 .0(1 2 4 ) R Z 5 1 93 2 .1(1 7 3 ) P g i 17 . 1(13) C D O8 79 . 2(94) R G9 1 01 7 .9(62) R G4 1 8 A3D i s t M a rk e rcM Id N a m e(47) R G2 1 88 . 1(1 0 7 ) R Z 2 6 28 . 6(42) R G1 9 01 2 .6(92) R G9 0 81 3 .7(93) R G9 13 . 2(67) R G4 4 91 6 .1(89) R G7 8 88 . 4(1 2 7 ) R Z 5 6 51 6 .8(1 3 8 ) R Z 6 7 52 1 .4(35) R G1 6 32 8 .2(1 3 0 ) R Z 5 9 02 . 7(46) R G2 1 41 2 .2(31) R G1 4 35 . 9(79) R G6 2 04167。 2 遺傳學圖譜 167。 基因組學 杭州師范大學生命與環(huán)境科學學院 向太和 圖譜分析 標記總數(shù): 圖譜上包含的標記(座位)總數(shù)。 圖譜長度(單位: centiMan, cM): ? 各連鎖群的長度; ? 基因組的總長度。 標記密度(座位 / cM): 分子標記的平均距離。當分子標記的密度足夠大時,通常稱為高密度圖譜。 標記分布的均勻程度: 遺傳圖譜上希望分子標記的分布比較均勻,不要出現(xiàn)距離較大的間隙( gap)。 167。 2 遺傳學圖譜 167。 基因組學 杭州師范大學生命與環(huán)境科學學院 向太和 遺傳圖譜的應用 圖位克?。?mapbased cloning):根據(jù)基因在圖譜上的 相對位臵來克隆基因 。 圖位克隆的步驟 1) 連鎖標記的篩選 。 2) 連鎖標記向靶基因位臵逼近 。 3) 尋找與靶基因工分離的分子標記; 4) 候選基因分析 。 5) 轉(zhuǎn)基因驗證 . 基因組學 杭州師范大學生命與環(huán)境科學學院 向太和 基因組學 杭州師范大學生命與環(huán)境科學學院 向太和 系譜分析作圖 基因組學 杭州師范大學生命與環(huán)境科學學院 向太和 細菌的遺傳作圖 ? 轉(zhuǎn)導( transduction): 以噬菌體為媒介,將長度可達50kb的 DNA片段從供體細胞轉(zhuǎn)移到受體細胞。 ? 轉(zhuǎn)化 (transformation): 供體細胞釋放的一段 DNA(通常小于 50kb),經(jīng)受體細胞攝取后整合到基因組中,可借助抗性培養(yǎng)基篩選重組克隆。 ? 接合轉(zhuǎn)移( conjugation): 2個細菌機械接觸,其中一個細菌(供體)將 DNA轉(zhuǎn)移到另一個細菌(受體)中。轉(zhuǎn)移長度可達 1Mb。 細菌遺傳作圖采用的都是生化標記 基因組學 杭州師范大學生命與環(huán)境科學學院 向太和 細菌之間DNA 轉(zhuǎn)移的三種方式 基因組學 杭州師范大學生命與環(huán)境科學學院 向太和 細菌基因作圖的原理 基因組學 杭州師范大學生命與環(huán)境科學學院 向太和 人類基因組遺傳圖 167。 2 遺傳學圖譜 167。 ?1994年 1000kb一個標記遺傳圖 ?1996年 600kb一個標記遺傳圖 ? 基因組學 杭州師范大學生命與環(huán)境科學學院 向太和 本章小結(jié) ? 名詞解釋 遺傳圖、物理圖、重疊群、小衛(wèi)星、微衛(wèi)星 ? 問答題: ? RFLP、 SSLP和SNP標記各有什么特點和優(yōu)缺點? ? ? ?
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