[高等教育]第二章遺傳學(xué)圖譜-資料下載頁(yè)
2025-02-22 00:21本頁(yè)面
【正文】 0= — 缺資料 167。 2 遺傳學(xué)圖譜 167。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 通過(guò)兩點(diǎn)分析 ， 計(jì)算各座位之間的連鎖關(guān)系 ， 并把基因座位劃分為若干個(gè)連鎖群 。 屏幕上將出現(xiàn)： group 1： 1 4 12 35 … group 2： 2 7 18 42 … … 通過(guò)設(shè)臵 LOD值，可以改變連鎖群的數(shù)目。 LOD值增大，連鎖群的數(shù)目也會(huì)增大。 LOD值 ，其分群的可靠性較大。當(dāng)座位數(shù)足夠大時(shí)，連鎖群的數(shù)目與單倍體的染色體數(shù)目相同。 分群（ group）： 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 排序 （ sequence） ： 通過(guò)多點(diǎn)分析，可以計(jì)算出在同一連鎖群內(nèi)不同排列順序下，各座位之間的距離和連鎖群的總長(zhǎng)度。 167。 2 遺傳學(xué)圖譜 167。 比較 （ pare） ： 通過(guò)比較同一連鎖群內(nèi)不同排列順序的作圖結(jié)果，找出loglikelihood（對(duì)數(shù)似然值）為最大的排列方式為最合理的排列方式。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 作圖 （ map） ：顯示最后的作圖結(jié)果 。 D i s t M a rk e rcM Id N a m e(71) R G4 7 21 9 .2(50) R G2 4 61 6 .1(1 5 4 ) K54 . 8(1 5 9 ) U 1 04 . 7(75) R G5 3 21 5 .3(1 6 0 ) W11 5 .5(39) R G1 7 31 5 .0(1 6 3 ) A m y 1 B3 . 8(1 0 8 ) R Z 2 7 63 . 3(32) R G1 4 63 4 .3(57) R G3 4 52 . 5(60) R G3 8 12 3 .5(1 0 2 ) R Z 1 98 . 2(84) R G6 9 01 3 .2(1 4 1 ) R Z 7 3 03 3 .1(1 4 3 ) R Z 8 0 12 . 6(90) R G8 1 09 . 2(55) R G3 3 11D i s t M a rk e rcM Id N a m e(66) R G4 3 71 3 .0(76) R G5 4 45 . 3(37) R G1 7 12 2 .2(33) R G1 5 72 7 .4(1 1 0 ) R Z 3 1 86 . 3(1 6 7 ) P a l I2 9 .3(1 2 9 ) R Z 5 81 0 .2(12) C D O6 8 68 . 8(1 6 2 ) A m y 1 A / C1 2 .8(95) R G9 58 . 4(82) R G6 5 45 . 1(52) R G2 5 61 0 .0(1 0 4 ) R Z 2 1 35 . 4(99) R Z 1 2 31 3 .1(74) R G5 2 02D i s t M a rk e rcM Id N a m e(25) R G1 0 47 . 7(58) R G3 4 81 3 .2(1 1 1 ) R Z 3 2 96 . 9(1 4 5 ) R Z 8 9 29 . 8(23) R G1 0 02 . 8(43) R G1 9 11 7 .5(1 3 9 ) R Z 6 7 84 1 .6(1 2 8 ) R Z 5 7 43 7 .1(1 0 9 ) R Z 2 8 41 5 .6(1 1 5 ) R Z 3 9 41 8 .5(1 5 6 ) p R D 1 0 A2 . 5(1 1 8 ) R Z 4 0 35 . 0(40) R G1 7 92 8 .6(4) C D O3 3 71 . 9(1 1 2 ) R Z 3 3 7 A2 2 .5(1 2 1 ) R Z 4 4 81 5 .0(1 2 4 ) R Z 5 1 93 2 .1(1 7 3 ) P g i 17 . 1(13) C D O8 79 . 2(94) R G9 1 01 7 .9(62) R G4 1 8 A3D i s t M a rk e rcM Id N a m e(47) R G2 1 88 . 1(1 0 7 ) R Z 2 6 28 . 6(42) R G1 9 01 2 .6(92) R G9 0 81 3 .7(93) R G9 13 . 2(67) R G4 4 91 6 .1(89) R G7 8 88 . 4(1 2 7 ) R Z 5 6 51 6 .8(1 3 8 ) R Z 6 7 52 1 .4(35) R G1 6 32 8 .2(1 3 0 ) R Z 5 9 02 . 7(46) R G2 1 41 2 .2(31) R G1 4 35 . 9(79) R G6 2 04167。 2 遺傳學(xué)圖譜 167。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 圖譜分析 標(biāo)記總數(shù)： 圖譜上包含的標(biāo)記（座位）總數(shù)。 圖譜長(zhǎng)度（單位： centiMan， cM）： ? 各連鎖群的長(zhǎng)度； ? 基因組的總長(zhǎng)度。 標(biāo)記密度（座位 / cM）： 分子標(biāo)記的平均距離。當(dāng)分子標(biāo)記的密度足夠大時(shí)，通常稱(chēng)為高密度圖譜。 標(biāo)記分布的均勻程度： 遺傳圖譜上希望分子標(biāo)記的分布比較均勻，不要出現(xiàn)距離較大的間隙（ gap）。 167。 2 遺傳學(xué)圖譜 167。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 遺傳圖譜的應(yīng)用 圖位克隆（ mapbased cloning):根據(jù)基因在圖譜上的 相對(duì)位臵來(lái)克隆基因 。 圖位克隆的步驟 1) 連鎖標(biāo)記的篩選 。 2) 連鎖標(biāo)記向靶基因位臵逼近 。 3) 尋找與靶基因工分離的分子標(biāo)記； 4) 候選基因分析 。 5) 轉(zhuǎn)基因驗(yàn)證 . 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 系譜分析作圖 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 細(xì)菌的遺傳作圖 ? 轉(zhuǎn)導(dǎo)（ transduction)： 以噬菌體為媒介，將長(zhǎng)度可達(dá)50kb的 DNA片段從供體細(xì)胞轉(zhuǎn)移到受體細(xì)胞。 ? 轉(zhuǎn)化 (transformation)： 供體細(xì)胞釋放的一段 DNA（通常小于 50kb)，經(jīng)受體細(xì)胞攝取后整合到基因組中，可借助抗性培養(yǎng)基篩選重組克隆。 ? 接合轉(zhuǎn)移（ conjugation)： 2個(gè)細(xì)菌機(jī)械接觸，其中一個(gè)細(xì)菌（供體）將 DNA轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)菌（受體）中。轉(zhuǎn)移長(zhǎng)度可達(dá) 1Mb。 細(xì)菌遺傳作圖采用的都是生化標(biāo)記 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 細(xì)菌之間DNA 轉(zhuǎn)移的三種方式 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 細(xì)菌基因作圖的原理 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 人類(lèi)基因組遺傳圖 167。 2 遺傳學(xué)圖譜 167。 ?1994年 1000kb一個(gè)標(biāo)記遺傳圖 ?1996年 600kb一個(gè)標(biāo)記遺傳圖 ? 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 本章小結(jié) ? 名詞解釋 遺傳圖、物理圖、重疊群、小衛(wèi)星、微衛(wèi)星 ? 問(wèn)答題： ？ RFLP、 SSLP和SNP標(biāo)記各有什么特點(diǎn)和優(yōu)缺點(diǎn)？ ？ ？ ？
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