生物信息學(xué)原理與方法第九講蛋白質(zhì)序列分析與預(yù)測(cè)-資料下載頁(yè)
2025-01-16 11:21本頁(yè)面
【正文】 測(cè) 。 810PSA 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 。 811SOPMA 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 。 812SSpro –利用雙向重復(fù)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu) 。 structure 三 級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 91三級(jí)結(jié)構(gòu)分析 （ Tertiary structure analysis） 911iMolTalk – 一個(gè)交互式的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析服務(wù)器 912MolTalk –一個(gè)結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)計(jì)算環(huán)境 92 比較建模 （ Comparative modeling） 921SWISSMODEL – 一個(gè)自動(dòng)基于知識(shí)的蛋白質(zhì)建模服務(wù)器 。 9223Djigsaw – 基于已知結(jié)構(gòu)同源蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)建模 。 923CPHmodels – 基于同源蛋白自動(dòng)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)建模服務(wù)器 。 924ESyPred3D – 采用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的自動(dòng)同源建模程序 。 925Geno3d – 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)自動(dòng)建模 。 926SDSC1 – 蛋白質(zhì)同源結(jié)構(gòu)建模服務(wù)器 。 93穿過(guò)建模 （ Threading） 9313DPSSM – 采用經(jīng)過(guò)二級(jí)結(jié)構(gòu)信息 (Foldfit)處理的一維和三維序列模式進(jìn)行蛋白質(zhì)折疊識(shí)別 。 932Fugue – 序列結(jié)構(gòu)同源識(shí)別 。 933Libellula –采用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法評(píng)價(jià)折疊識(shí)別結(jié)果 。 934LOOPP – 采用序列到序列 、 序列到結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)到結(jié)構(gòu)的算法 。 935SAMT02 – 基于 HMM的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 。 936Threader – 蛋白質(zhì)折疊識(shí)別 。 937ProSup – 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)附件 。 938SWEET – 從 saccharides序列構(gòu)建其三維模型 。 94 從頭建模 （ Ab initio） 941HMMSTR/Rosetta – 從序列預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu) 。 9 5 三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)評(píng)價(jià) （ Assessing tertiary structure prediction） 951Anolea – 原子非局部環(huán)境評(píng)價(jià) 。 952Biotech Validation Suite for Protein Structures 953EVA – 原子蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)評(píng)價(jià) 954LiveBench –結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)服務(wù)器的連續(xù) Benchmarking。 955PROCHECK – 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的 stereochemical質(zhì)量證實(shí) 。 956What If –用于突變預(yù)測(cè) 、 結(jié)構(gòu)驗(yàn)證 、 分子圖示的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析程序 。 96分子建模顯示工具 961SwissPdbViewer – 顯示 、 分析 、 添加蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的程序 962Astex Viewer 963MolMol 964Rasmol 965VMD 10. Sequence alignment 序列比 對(duì)
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