20xx年醫(yī)學(xué)專題—產(chǎn)甲烷古細(xì)菌的特點(diǎn)(編輯修改稿)
2024-11-19 03:55 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 rachromosomal element，ECE)。[4]比如Methanococcus jannaschii不僅含有1個(gè)1664976bp的環(huán)狀染色體，還含有1個(gè)58407bp的大ECE和1個(gè)16550bp的小ECE。產(chǎn)甲烷菌的G+C含量在30%一65%之間，這種變化與其所生存的環(huán)境相關(guān)。比如嗜熱的MethanoPyruskandleriAV19的G+%。編碼蛋白的ORF與一個(gè)物種的復(fù)雜度相關(guān)聯(lián)，產(chǎn)甲烷菌的ORF約在1500一5000之間。傳統(tǒng)的分類是在對大量單個(gè)微生物進(jìn)行觀察分析和描述的基礎(chǔ)上，以它們的形態(tài)結(jié)構(gòu)、生理生化特性和遺傳性等特征的異同為依據(jù)進(jìn)行的。隨著分子生物學(xué)的發(fā)展，人們利用不同物種間smallsubunitribosom習(xí)RNA的同源性進(jìn)行分類取得了較為滿意的結(jié)果。但這種方法存在著明顯的弊端，當(dāng)環(huán)境壓力使得某物種核酸中G+C含量變化時(shí)，分析結(jié)果會(huì)有較大偏差。隨著多個(gè)物種全基因組測序的完成，使人們可以用全基因組信息研究物種的進(jìn)化、基因的垂直進(jìn)化和水平遷移。[5]在產(chǎn)甲烷菌之間基因的“重疊”性很高，發(fā)現(xiàn)一些基因簇只在產(chǎn)甲烷菌中出現(xiàn)而不在其它古細(xì)菌中出現(xiàn)，同樣也發(fā)現(xiàn)一些其它微生物中共有的基因簇在產(chǎn)甲烷菌中找不到痕跡。不同基因組間基因順序的比較可以衡量2個(gè)物種間的親緣關(guān)系，也能提示基因之間功能的關(guān)聯(lián)性。利用核糖體蛋白同源性構(gòu)建進(jìn)化樹是目前認(rèn)為最可靠的進(jìn)化分析方法。[6]3產(chǎn)甲烷菌代謝特征產(chǎn)甲烷菌生活在厭氧條件下，它們通過甲烷的生物合成形成維持細(xì)胞生存所需的能量。在產(chǎn)甲烷菌中存在原核細(xì)胞和真核細(xì)胞所共有的糖酵解途徑(EMP)、三狡酸循環(huán)(TCA)、氨基酸和核昔酸代謝。但一些基本所需的酶在產(chǎn)甲烷菌中未被確定，如在Methanopyrus kandleri AV19的TCA循環(huán)中缺乏將兩分子丙酮酸縮合成一分子六碳三狡酸所需的酶。,。[7]產(chǎn)甲烷菌是自養(yǎng)型的生物，它能利用環(huán)境中的化學(xué)能。因而產(chǎn)甲烷菌中發(fā)現(xiàn)了許多無機(jī)物進(jìn)人細(xì)胞所需的通道蛋白。如Na+，K+，Ca+，Cu2+,Fe2+,Fe3+,Cl,Co2+等離子。以及亞砷酸、磷酸、硫酸、硝酸等無機(jī)酸。產(chǎn)甲烷菌還具備運(yùn)輸乳酸、六碳三狡酸、六碳二狡酸等有機(jī)物進(jìn)人細(xì)胞的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白。產(chǎn)甲烷菌是目前唯一
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