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計算機在化學中的應用(原創(chuàng))(編輯修改稿)

2025-10-13 18:42 本頁面
 

【文章內容簡介】 分析時,只需選擇所要分析的數(shù)據(jù),然后再選擇相應的菜單命令即可。Origin的繪圖是基于模板的,Origin本身提供了幾十種二維和三維繪圖模板而且允許用戶自己定制模板。繪圖時,只要選擇所需要的模板就行。用戶可以自定義數(shù)學函數(shù)、圖形樣式和繪圖模板;可以和各種數(shù)據(jù)庫軟件、辦公軟件、圖像處理軟件等方便的連接。另一方面經(jīng)過本學期的學習,我對如何進行文獻的檢索和整理的認識都上升了一個臺階,不僅以往經(jīng)常使用的搜索引擎百度與google中也學習到了一些過去不了解的搜索方法與技巧,同時對一些化學化工的文獻數(shù)據(jù)庫也有所了解,如中國知網(wǎng),工程索引EI,科學引文索引SCI等等,這些數(shù)據(jù)庫令我在未來查詢文件時不再茫無目標,而能做到有的放矢。此外對于如專利檢索等對我們未來學習研究必不可少的技巧也做到初步了解,相信在未來這些技能一定可以發(fā)揮出無與倫比的作用。最后,作為一名化工專業(yè)的學生,不但要掌握基本的計算機操作知識,更應掌握化工領域常用的專業(yè)性計算機軟件。無論是在以后的學習或是工作中,這種掌握只會使自己越來越專業(yè),提高自己的競爭力,為我們未來的學習與發(fā)展鋪墊出一塊堅定的基石。第四篇:計算機在化學中的應用實踐總結報告計算機在化學中的應用實踐總結報告第十四周實踐內容分子結構及化學反應式的繪制、分子結構及能量優(yōu)化、化學反應機理的分子力學和量子化學計算軟件:ChemOffice 20Gaussian 0MOPCA2010 第15周實踐內容:復雜體系多組分定性定量分析的化學計量學方法軟件:Matlab 201程序:MCRALS(多元曲線分辨交替最小二乘)、PLS(偏最小二乘)、SVM(支持向量機)、PCA(主成分分析)、ANN(人工神經(jīng)網(wǎng)絡)第16周實踐內容:計算機輔助藥物分子設計、化學數(shù)據(jù)庫與化學信息學 軟件:MOE 200VMD、NAMD、Amber、Autodock、Matlab 2012 數(shù)據(jù)庫:蛋白質晶體結構數(shù)據(jù)庫、ZINC數(shù)據(jù)庫chemoffice的組成主要有ChemDraw 化學結構繪圖,Chem3D 分子模型及仿真,ChemFinder 化學信息搜尋整合系統(tǒng),此外還加入了 ENotebook Ultra ,BioAssay Pro ,量化軟件 MOPAC、Gaussian 和 GAMESS 的界面,ChemSAR, Server Excel, CLogP, CombiChem/Excel等等,ChemOffice Pro 還包含了全套 ChemInfo 數(shù)據(jù)庫,有 ChemACX 和 ChemACXSC,Merck 索引和 ChemMSDX等等Gaussian是一個功能強大的量子化學綜合軟件包。其可執(zhí)行程序可在不同型號的大型計算機,超級計算機,工作站和個人計算機上運行,并相應有不同的版本。高斯功能:過渡態(tài)能量和結構、鍵和反應能量、分子軌道、原子電荷和電勢、振動頻率、紅外和拉曼光譜、核磁性質、極化率和超極化率、熱力學性質、反應路徑,計算可以對體系的基態(tài)或激發(fā)態(tài)執(zhí)行。可以預測周期體系的能量,結構和分子軌道。因此,Gaussian可以作為功能強大的工具,用于研究許多化學領域的課題,例如取代基的影響,化學反應機理,勢能曲面和激發(fā)能等等。常常與gaussview連用。軟件包括很多很強大的新功能,比如系統(tǒng)命名法,工具板,改進的質子核磁共振的預測、質譜碎片,支持多種格式的圖形文件和支持化標記語言等。將軟件中的結構剪貼或者粘貼到軟件中,能轉化空間結構模型。軟件涉及的范圍包括化學作圖、分子模型生成、化學數(shù)據(jù)庫信息管理等,主要功能是繪制化學常用的平面圖形,比如描繪化合物的結構式、化學反應方程式、化工流程圖、簡單的實驗裝置圖等圖形,為化學工作者日常的教學工作和科研工作帶來了很大的方便,解決了人工繪畫、分析化學圖形帶來的不便。分子結構繪制:軟件可以建立和編輯一切與化學有關的圖形,主要是建立和編輯各類化學式、立體圖形、對稱圖形、軌道、化合物的結構式、化學反應方程式等。實驗裝置繪制:軟件提供了非常豐富的常用的實驗儀器模板和各種玻璃器皿,可以很方便的用來繪制實驗裝置圖,用戶還可以根據(jù)自己的需要,自己編輯或者從外部其他文件中導入圖形。分子性質預測及分析:軟件可以預測分子的很多性質和參數(shù),比如分子量、摩爾體積、元素組成比、表面張力、密度等,還可以粗略的預測質譜以及核磁共振;還提供了元素周期表,這樣方便用戶查詢各種元素的相關數(shù)據(jù)?;瘜W結構:軟件可以優(yōu)化調整化學結構,使化學結構更加美觀;還可以檢查化合物分子式是否正確,并能將不正確的地方標記出來,方便修改;還能使分子結構在三維空間旋轉,并能借助軟件進行自動三維優(yōu)化即先第章二種工具軟件的相關介紹借助軟件將結構轉化為三維結構再優(yōu)化。軟件不僅可以將輸入的化學物質名稱直接轉為物質結構圖,省去繪圖的麻煩;而且可以對已知結構”的化學物質命名,給出正確的化學物質名稱⑷。其它功能:所繪制的圖形具有矢量圖的特點,無論怎么操作邊緣都不會出現(xiàn)鋸齒狀,可以直接拷貝至、中使用,也可以使用鏈接使用。而且此軟件默認設置和用戶自定義設置都可隨意保存和回復,也可以插入文明,添加注釋,還能夠根據(jù)需要定義文字和圖形的大小、字體、顏色等屬性,能夠對結構、圖形進行縮小、放大、旋轉、翻轉、移動等操作,還能進行剪切、粘貼、刪除、復制、存儲等操作。Chem3d軟件是一個很好的三維模型設計軟件是一個具有較強功能的結構化學計算軟件。用軟件制作的化合物分子模型來演示化學反應方程式,就更加形象、生動。軟件具備以下幾種實用的功能:軟件可以直接將二維的平面結構式轉換為三維的空間模型;軟件具有模型線狀模型、模型棒狀模型、模型球棍模型、模型圓柱模型、模型比例模型等顯示模式;軟件可以使用或等分子力場對化合物分子進行自動校正后創(chuàng)建結構多樣的化合物分子模型,還能自動判斷化合物分子模型是否正確,實時直觀生動的顯示出三維化合物分子模型,進行物質結構化學計算、動態(tài)立體化學變化過程的演示,并可以通過計算最小化能量給出最恰當?shù)幕衔锓肿涌臻g構象】。軟件可以輸出多達種三維化合物分子文件的格式包括常見的、等格式,也可以存儲為多種高分辨率的位圖、矢量圖形格式、方便在幻燈片中清晰的呈現(xiàn)出分子的三維模型。在整個演示過程中,化合物分子都是以三維動態(tài)的直觀形式呈現(xiàn)的,形象生動地表示了化合物分子在每一步變化中鍵長、鍵角及鍵能的變化
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