生物化學(xué)課件---蛋白質(zhì)(編輯修改稿)
2024-09-12 01:13 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 OC NHαCαC肽鍵 肽單位肽鏈主鏈……OC NHαCαCOC NHαCOC NHαCOC OHNH 肽鍵氮氧原子共振產(chǎn)生： （ 1）部分雙鍵性質(zhì)；（ 2）多肽主鏈酰胺平面；（ 3） Cα 處于順式或反式構(gòu)型；（ 4）二面角；（ 5）偶極性（ N末端， C末端） 。 氨基酸殘基 （ amino acid residue） RHαHNOC C氨基酸殘基H OH 蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的表示法 肽鍵 H 2 N CO H CH 3 S COOH NH C CO H NH C CO H NH C CO H NH C H H CH 2 C H CH 2 OH CH 2 CH 2 中文氨基酸殘基命名法： 酪氨酰甘氨酰甘氨酰苯丙 氨酰甲硫氨酸 三字母符號表示法 ： TyrGlyGlyPheMet 單字母 符號表示法 ： YGGFM ⑴ 谷胱甘肽 ⑵ 腦啡肽 （ 5肽 ） ⑶ 短桿菌肽 S（ 10肽 ） ⑷ 肽類激素 （二）蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu) 蛋白 質(zhì)的三維結(jié)構(gòu) 指的是 蛋白質(zhì)分子中全部原子和基團(tuán)相互間的立體關(guān)系，包括全部原子和基團(tuán)的排列、分布及肽鏈的走向。 又稱為蛋白質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)、空間結(jié)構(gòu)或構(gòu)象，可分為 二級 、 超二級 、結(jié)構(gòu)域 、 三級 和 四級結(jié)構(gòu) 。 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)層次 （ 1）構(gòu)型與構(gòu)象 構(gòu)型（ configuration） 構(gòu)象（ conformation） 1969年， IUPAC （ 2） 蛋白質(zhì)的立體結(jié)構(gòu)原理 ①肽單位與二面角 將多肽鏈的基本結(jié)構(gòu)中， Cα CONHCα 這一主鏈骨架的重復(fù)單位叫 肽單位 （ Pauling和 Corey在 1951年根據(jù) X射線衍射結(jié)果，提出蛋白質(zhì) 肽單位平面原則 3） 。 肽單位平面結(jié)構(gòu) N H α C O C N H α C O C OH H H R1 R2 H 氨基酸殘基CCONHαHROC NHOC NHαCαC肽鍵 肽單位肽鏈主鏈……OC NHαCαCOC NHαCOC NHαCOC OHNH肽單位立體結(jié)構(gòu) 二面角（ dihedral angle） 肽平面 1 圍繞 Cα 2— N1 單鍵旋轉(zhuǎn)，其旋轉(zhuǎn)的角度用 Φ表示； 肽平面 2 也可以圍繞 Cα 2— C2 單鍵旋轉(zhuǎn)，其旋轉(zhuǎn)的角度用 Ψ表示。 (右為正 ,左為負(fù) ) N1 C α 2 C2 多肽鏈主鏈骨架的構(gòu)象是由每個 Cα 的成對二面角 （ Φ， Ψ） 所決定的。 ②非鍵合原子間的最小接觸距離 在相鄰的兩個肽單位的構(gòu)象中，非鍵合原子間的接近有無障礙，是否符合 標(biāo)準(zhǔn)接觸距離 ， 即能量是否達(dá)到最低 ， 也是肽鏈構(gòu)象能否穩(wěn)定存在的重要 立體化學(xué)原則 。 2. 二級結(jié)構(gòu) 概 念 指多肽鏈主鏈在一級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上 ，某些肽段借助氫鍵進(jìn)一步盤旋或折疊 ，從而形成有規(guī)律的構(gòu)象 。 主要類型 α 螺旋 、 β 折疊片 、 β 轉(zhuǎn)角 、 無規(guī)卷曲 。 （ 1） α 螺旋 即每個氨基酸殘基 （ n） 的＞ C＝ O 與另一個氨基酸殘基 （ n+4） 的＞ N－ H 形成氫鍵 。 C H C O ) 3( N HC NO HR Pauling 和 Corey于 1951 年提出蛋白質(zhì)的 α 螺旋（ α helix） 結(jié)構(gòu)模型 。 羊毛等纖維狀蛋白質(zhì)中，球狀蛋白中也廣泛存在。它是蛋白質(zhì)主鏈的一種典型結(jié)構(gòu)形式 . 每隔 ，螺旋上升一圈，每圈間距 . 氫鍵環(huán)內(nèi)包括 13個主鏈原子，因此稱這種螺旋為 。 電子顯微鏡下的人體頭發(fā) （ 2） β 折疊 （ a） Antiparallel β 折疊： 伸展的多肽鏈靠氫鍵聯(lián)結(jié)而成的鋸齒狀片層結(jié)構(gòu)，存在于纖維蛋白，球狀蛋白也有。 又稱為β 折疊片（ β pleated sheet） 。 反平行式較為穩(wěn)定，例如在絲心蛋白中存在穩(wěn)定的反平行 β–折疊。 （ 3） β 轉(zhuǎn)角 蛋白質(zhì)分子
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