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正文內(nèi)容

巨??偨Y(jié):搞有機(jī)必須學(xué)會(huì)的合成檢索方法(編輯修改稿)

2025-02-14 21:37 本頁面
 

【文章內(nèi)容簡介】 輸入“boiling”,點(diǎn)擊按鈕“Find”,左側(cè)的按鈕便會(huì)自動(dòng)展開,將其中的BoilingPoint數(shù)據(jù)域用高亮的背景顏色顯示出來,雙擊BoilingPoint數(shù)據(jù)域,在字段代碼(FieldName)框中自動(dòng)填上“BoilingPoint(BP)”,然后用同樣的方法填上Pressure()、Densityoftheliquid(DEN)、DynamicViscosity(DV)和ElementCount(ELC)。在填充數(shù)據(jù)內(nèi)容(FieldContent)時(shí),可以直接輸入與該檢索字段一致的物質(zhì)性質(zhì)的數(shù)據(jù),也可以通過右側(cè)List所在列的下拉按鈕獲得幫助。單擊“▼”按鈕,系統(tǒng)會(huì)提供一個(gè)對(duì)話框來提示如何填寫數(shù)值,按照頁面提示填上相應(yīng)的數(shù)值,然后點(diǎn)擊OK按鈕,系統(tǒng)自動(dòng)將數(shù)值填充到數(shù)據(jù)內(nèi)容(FieldContent)表格中。在數(shù)據(jù)域名和數(shù)據(jù)內(nèi)容的關(guān)系(Relation)的設(shè)定框中,系統(tǒng)提供了“is”、“Startswith”、“endswith”、“:”、“”、“=”、“”、“=”以及“Exists”等幾種關(guān)系,用戶根據(jù)自己的要求設(shè)定相應(yīng)的關(guān)系。在邏輯運(yùn)算符(Operator)設(shè)定框中,CrossFireGmelin/Beilstein提供了“and”、“or”、“not”、“proximity”、“near”以及“next”等6種算符,用戶根據(jù)課題要求設(shè)定相應(yīng)的算符。注意:“proximity”不但要求兩個(gè)條件同時(shí)存在,而且兩者必須是相關(guān)的。然后點(diǎn)擊“StartSearch”按鈕開始檢索。c 結(jié)構(gòu)檢索(StructureSearch)結(jié)構(gòu)檢索是CrossFireGmelin/Beilstein數(shù)據(jù)庫特有的檢索方式。它通過內(nèi)嵌的繪制結(jié)構(gòu)軟件ISISDraw,繪制出物質(zhì)結(jié)構(gòu)或反應(yīng)結(jié)構(gòu)式,從而達(dá)到檢索的目的。CrossFire結(jié)構(gòu)編輯器功能強(qiáng)大,不但可以繪制物質(zhì)結(jié)構(gòu)或反應(yīng)結(jié)構(gòu)式,還可以對(duì)所繪制的結(jié)構(gòu)進(jìn)行立體及屬性限定。實(shí)例3:查詢由β萘己酮制備β萘甲酸的反應(yīng),具體辦法如下:在結(jié)構(gòu)編輯窗口(StructureEditor)內(nèi)雙擊或單擊繪制結(jié)構(gòu)(DrawStructure)圖標(biāo),激活內(nèi)嵌的繪制結(jié)構(gòu)軟件ISISDraw,彈出分子結(jié)構(gòu)編輯窗口,系統(tǒng)自動(dòng)進(jìn)入編輯模式,利用分子結(jié)構(gòu)模版和系統(tǒng)提供的多項(xiàng)功能鍵,畫出所需的反應(yīng)式,點(diǎn)擊左上角的返回Commander窗口按鈕,系統(tǒng)自動(dòng)返回到Commander窗口。然后,用戶可以對(duì)所畫的結(jié)構(gòu)進(jìn)行限定,如選擇FreeSite中的雜原子(Heteroatom)或所有原子(allatom)設(shè)定為子結(jié)構(gòu),對(duì)立體結(jié)構(gòu)(Stereo)限定為絕對(duì)匹配、不匹配、相關(guān)的或者外消旋,還可以對(duì)其化合價(jià)、同位素、附加環(huán)等進(jìn)行限定,然后點(diǎn)擊開始檢索按鈕。d 組配檢索CrossFireGmelin/Beilstein數(shù)據(jù)庫提供了豐富的組配檢索功能,用戶可以把結(jié)構(gòu)圖、文本或數(shù)據(jù)進(jìn)行聯(lián)合檢索,實(shí)現(xiàn)更靈活、更準(zhǔn)確、更高效的檢索目的。實(shí)例4:檢索在JournalofMedicinalChemistry()刊物上發(fā)表的關(guān)于Cromakalim化合物的文章,并將發(fā)表日期限制在1991年,就可以進(jìn)行化學(xué)結(jié)構(gòu)和數(shù)據(jù)的聯(lián)合檢索,具體方法如下:在結(jié)構(gòu)編輯框中輸入化學(xué)結(jié)構(gòu),然后點(diǎn)擊列在左邊列表框中的預(yù)定義檢索項(xiàng)(PredefinedSearchForms)中的書目數(shù)據(jù)(Bibliographicdata)選項(xiàng),預(yù)先定義好的對(duì)話框便會(huì)彈出來,在刊物名稱框中輸入刊物名稱縮寫“”。注意:輸入的縮寫刊物名稱的每個(gè)詞之間必須用空格隔開。邏輯關(guān)系選項(xiàng)框中選擇“Startswith”,然后點(diǎn)擊OK按鈕,系統(tǒng)將數(shù)據(jù)自動(dòng)轉(zhuǎn)入數(shù)據(jù)輸入框,點(diǎn)擊開始檢索按鈕進(jìn)行檢索。e 二次檢索CrossFireGmelin/Beilstein數(shù)據(jù)庫還提供了二次檢索功能,用戶可以根據(jù)自己的檢索要求對(duì)首次檢索結(jié)果進(jìn)行組合,進(jìn)行二次檢索,使檢索結(jié)果更準(zhǔn)確。實(shí)例5:檢索合成水楊酸的化學(xué)反應(yīng),而且反應(yīng)物不含有苯酚,可以通過如下方式檢索:首先在結(jié)構(gòu)編輯窗口畫出水楊酸的結(jié)構(gòu)圖,在結(jié)構(gòu)檢索選項(xiàng)區(qū)選擇產(chǎn)物,在檢索(Search)選項(xiàng)框中選擇反應(yīng),開始檢索。得到檢索結(jié)果Q1有627條,然后在結(jié)構(gòu)編輯窗口畫出苯酚生成水楊酸的反應(yīng),在檢索(Search)選項(xiàng)框中選擇反應(yīng),開始檢索。得到檢索結(jié)果Q2有38條,然后點(diǎn)擊左上角的hitsets列表,雙擊Q1和Q2,Q1和Q2自動(dòng)添加到數(shù)據(jù)框中,在邏輯關(guān)系選項(xiàng)框中,選擇非(not),點(diǎn)擊開始檢索按鈕進(jìn)行檢索,檢索結(jié)果為Q3有589條。f 檢索結(jié)果的顯示檢索完成后,CrossFireGmelin/Beilstein數(shù)據(jù)庫會(huì)自動(dòng)切換到檢索結(jié)果的界面,顯示界面以左右兩屏顯示:左屏呈樹形結(jié)構(gòu)的是所檢索物質(zhì)的條目信息,并以編號(hào)Q1,Q2?排序,點(diǎn)擊編號(hào),可逐級(jí)打開該條目下的詳細(xì)記錄,定位記錄目標(biāo),則相對(duì)應(yīng)的詳細(xì)信息在右屏顯示,右屏可以用網(wǎng)格(Grid)和列表(List)兩種方式來顯示檢索結(jié)果,而且可以隨意的相互切換。Grid顯示方式可以在同一個(gè)界面上同時(shí)顯示多條記錄,而List顯示方式則在一個(gè)界面上顯示一條記錄的詳細(xì)信息,包括所查物質(zhì)的識(shí)別信息、反應(yīng)信息、物理性質(zhì)、化學(xué)性質(zhì)、參考文獻(xiàn)等眾多方面的信息,記錄中與檢索條件相匹配的內(nèi)容將用高亮的背景顏色顯示出來。g 檢索結(jié)果的輸出CrossFireGmelin/Beilstein能夠靈活的對(duì)檢索結(jié)果進(jìn)行各種處理,幫助用戶以各種方式將檢索內(nèi)容自動(dòng)生成圖表和報(bào)告,以Word、Excel或html等多種格式進(jìn)行存儲(chǔ)。用戶只需在所需條目的右上角的空白框中做標(biāo)記,然后選擇打印(Print)或復(fù)制到報(bào)告(CopytoReport),就可以對(duì)需要的內(nèi)容進(jìn)行打印或保存。綜上所述,CrossFireGmelin/Beilstein是個(gè)非常強(qiáng)大的數(shù)據(jù)庫,不僅數(shù)據(jù)涵蓋面非常廣,并配有強(qiáng)大的搜索引擎以幫助用戶以最簡單、最直接、最迅捷的方式來找出所需要的數(shù)據(jù),而且無論是建立查詢還是顯示查詢結(jié)果的界面的設(shè)計(jì)都十分合理、簡單易用,是化學(xué)化工研究者必不可少的網(wǎng)上工具。我們應(yīng)在檢索實(shí)踐中不斷總結(jié)經(jīng)驗(yàn),爭取把系統(tǒng)所提供的功能發(fā)揮的更好。Web of science 個(gè)人覺得Web of science使用比較方便,不像beilstein有那么多的檢索方式,相對(duì)比較簡單。我最常用的就是General Search,我覺得已經(jīng)足夠了。a 里面可以進(jìn)行關(guān)鍵詞或者title的檢索;如果你想定個(gè)課題還沒有具體的文獻(xiàn),那么可以利用關(guān)鍵詞來進(jìn)行搜索,比如要查手性識(shí)別方面的文獻(xiàn),可以在Topic一欄輸入chiral discrimination or chiral recognition,哦1641篇,這么多,怎么辦???再縮小范圍,比如你想知道手性識(shí)別在電化學(xué)方面的文獻(xiàn),那就在topic里面輸入chiral discrimination and electrochemistry 再點(diǎn)search,這下就剩了3篇了。有人說只有3篇也太少了,是不是沒有檢索全?ok,有這種可能,那怎么辦?不是已經(jīng)檢索到3篇了么,幸運(yùn)的是,在Web of science里面可以查cited reference 和 times cited根據(jù)這兩個(gè)可以看搜索到的這幾篇文獻(xiàn)里面都引用
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