【正文】 但隨后，由于在動物毒性研究中發(fā)現其會劑量依賴導致強烈的免疫刺激， Anadys 終止了針對 HCV 病人的一個 28 天的Ⅰ b 期臨床項目。現將部分化合物活性列出 （ TLR7 HEK293） ： 編號 結構 編號 結構 1 EC50= 3 EC50= 50 15 EC50= 16 EC50= 17 EC50= 18 EC50= 在專利 US20xx306610A124中， Aamp。其中， SM276001在 20xx 年作為 HBV 和 HCV 的治療藥物處在臨床前研究。以，每周兩次，連續(xù)四周，在此計量水平下化合物能被很好的耐受，但是沒有表現出有意義的病毒載量和顯著的系統(tǒng)性細胞因子和生物標記物水平的改變。 Zhou, L.。 Lawrence, B. S.。 Lemm, J.。 Xuejie, Y.。 Hua, F.。 Peter, T. N.。 JinHua, S.。 Lawrence, B. S., Inhibitors of HCV NS5A: From Iminothiazolidinones to Symmetrical Stilbenes. ACS Medicinal Chemistry Letters 20xx, 2。 Hickey, M.。 Luc, J. W. v. d. L., New targets for treatment against HCV infection. Best Practice amp。而比較 30 與化合物 3 苯甲酰胺和苯胺環(huán)的構想， 發(fā)現相差很大，推測，可能化合物 3 的構象與 NS5A GT1b的生物構象較符合，而 30 則與 NS5A GT1a 的較符合。而延長飽和烷基鏈的鏈長，活性降低程度中等。 C） NS5A 結構相對內質網膜的位置。此非結構蛋白質也參與若干細胞過程，比如干擾素抵抗以及凋亡調節(jié)。 途徑 /新穎性 藥物 進展 備注（靶點等） 評價 風險 潛力 釋放 ★★★☆ celgosivir Phase 2 Glucosidase inhibitors ★★★☆ ★★★☆ 、 其它方式 。 NS2 和 NS3 具有蛋白酶活性，參與病毒多聚蛋白前體的切割。大約 7585%的新感染者出現慢性肝病，慢性感染者中 6070%會出現慢性肝病，520%會出現肝硬化， 15%會死于肝硬化或肝癌。但干擾素在全球并不能普遍獲得， 并不總是耐受良好，有些病毒基因型對干擾素的反應優(yōu)于其它基因型，而且許多使用干擾素治療的人未完成其療程。 圖三、 HCV 的生命周期 6 三、 以生命周期劃分 HCV 治療藥物整理 對 HCV 不同周期時藥物所針對的不同 途徑，我們分四個階段進行總結，大體如下圖所示： 同時，我們對各個途徑的新穎性，各個靶點、藥物的風險、 潛力進行了簡單的評級 ，黑色四星（ ★★★ ★ ）為最高， 白色四星（ ☆☆☆☆ ）最低。 綜合上述總結， 我們認為 HCV 藥物最具潛力治療方式是將核苷聚合酶 抑制劑（ NS5B 抑制劑） 、 NS5A 抑制劑 、 蛋白酶抑制劑結合的療法。最近研究又發(fā)現區(qū)域三（ 356447 殘基）在病毒組裝而不是 RNA 復制中起到關鍵作用。 20 表一、代表性 NS5A 抑制劑 Comp Company In vitro EC50 (pM) Phase 1b 1a BMS790052(daclatasvir) Bristol–Myers Squibb 9 50 3 GS5885 Gilead 4 34 2 ABT267（結構未知，以專利中代表性化合物代替） US20xx172368A1 Abbott 5 14 2 GSK2336805， WO20xx091446A1 GlaxoSmithKline 8 44 2 ACH2928（結構未知，以專利中代表性化合物代替） Achillion 2–3 46 1 ACH3102（結構未知，以專利中 代表性化合物代替） US20xx302538A1 Achillion 4 10 1 PPI461（結構未知，以專利中代表性化合物代替）WO20xx096777A1 Presidio 10 210 1 21 續(xù)表一、代表性 NS5A 抑制劑 Comp Company In vitro EC50 (pM) Phase 1b 1a PPI668（結構未知，以專 利中代表性化合物代替） US20xx115855A1 Presidio 10 100 1 IDX719（結構未知，以專利中代表性化合物代替） US20xx150827A1 Idenix 3 8 1 EDP239（結構未知，以專利中代表性化合物代替） US20xx217261A1 Enanta/Novartis 4 34 PC MK8742（結構未知，以專利中代表性化合物代替） US20xx083483A1 Merck 3 4 PC 還有另外一些結構類型，僅挑選其中高活性代表化合物，見下表： 22 表二、其它代表性 NS5A 抑制劑 Comp Company In vitro EC50 (pM) 注 1b 1a Example 1002 BOEHRINGER INGELHEIM INTERNATIONA 15 230 Example 44 JANSSEN Ramp。引入雜環(huán)，改變聯苯的角度，也對活性不理利。 (b) Scheel, T.。 (g) Vermehren, J.。 Scott, W. M.。 Ramesh, K.。 Lawrence, B. S., HCV NS5A replication plex inhibitors. Part 2: Investigation of stilbene prolinamides. Bioanic amp。 Robert, A. F.。 Mengping, L.。 St Laurent, D.。 medicinal chemistry letters 20xx, 23 (15), 44284435. 4. Donald, R. O. B., II。 Amblard, F.。 McBrayer, T.。此化合物能夠計量依賴和給藥頻率依賴的誘導免疫生物標記物和 IFN 反應。在 C2 位的功能團化也得到 TLR7 強效激動劑如 SM360320，在干細胞中能夠抑制 HCV 復制。 而在專利 US20xx098248A127中， Gilead Science, 更深入的研究，披露了以下骨架： 54 此類化合物是 TLR7 的激動劑，給出結構的 59 個化合物中多數化合物的活性（ MEC）接近 1nM。 部分化合物結構見下表： 編號 結構 編號 結構 1 2 3 4 5 6 66 7 而在專利 US20xx258928A136， US20xx316327A137 中， Gilead Science, Inc.公司披露了以下兩個骨架： 此類化合物是 HCV 治療藥物的前藥，但在專利中并沒有提及機理是否是通過 TLR途徑實現，然而鑒于其與上述 Anadys 化合物結構的相似性，也將其進展列出。其中，艾沙托立賓進入到治療 HCV 感染的Ⅱ期臨床實驗。D 公司披露了以下結構骨架： 此專利 披露了 7 個化合物結構，部分活性結果見下表（ 活性結果 pEC50 為TLR7 激動劑誘導 SEAP（ secreted alkaline phosphatase）產生達到此化合物最大水平一半時所需的濃度）。 36 Comp R EC50， nM Comp R EC50， nM 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 目前，相關專利中對此類化合物的涵蓋范圍如下： Pfizer 公司的 US20xx197478A114 、 US20xx039884A11 US20xx302598A116三篇專利。 化合物分類依據其核心結構特點進行。 Tharnish, P.。 Jeffrey, L. R.。 O39。 Jeffrey, L. R.。 Medicinal Chemistry Letters 20xx, 23。 Michael, H. .。 Peter, T. N.。 JinHua, S.。 therapeutics 20xx, 32 (1), 1428. 2. (a) Tellinghuisen, T.。 Vliegen, I.。 同時，在咪唑上的某些鹵素取代也改善了化合物的藥 藥相互作用問題。 BMS411 的結構如下圖所示： 23 結合方式通過 QUANTA軟件模擬，可見 BMS411活性狀態(tài)為 γ扭曲形結構，橫穿 NS5A 二聚體的接觸面，其“蓋子”區(qū)靠近 Y93 氨基酸，其核心區(qū)域平躺于氨基酸 L31 殘基之下，氨基酸殘基 Q54 靠近 BMS411 的末端，并與 α螺旋的氨基酸殘基 L28 相接觸。 B、 D 兩圖顯示區(qū)域一的保守度，一不同顏色表示，品紅色表示 95%，淡粉紅色表示75%95%，白色表示 75%。 NS5A在 HCV復制和組裝中起到重要作用 ， 還與宿主免疫反應有關， 是一個比較新穎的靶點 ，此類藥物大多處在臨床階段，這給我們很多 追趕 機會 研發(fā)出中國自主的丙肝治療藥物 。不耐突變，與其它藥物連用效果好。 一、 HCV 的結構 ： 如 右 圖所示 ， HCV 病毒體呈球形，直徑小于 80nm（在肝細胞中為 3640nm，在血液中為 3662nm），為單 股正鏈 RNA 病毒，在核衣殼外包繞含脂質的囊膜，囊膜上有剌突 . 圖一、 HCV 結構 如下圖所示， HCV 的 RNA 大約 由 9500－ 10000bp 組成， 5′和 3′非編碼區(qū)（ NCR）分別有 319341bp 和 2755bp，含有幾個順向和反向重復序列，可能與基因復制有關。1 目錄 丙型肝炎治療藥物研究與設計 ………………………………………………………3 以生命周期劃分 HCV 治療藥物整理 ………………………………………4 HCV 的結構 ………………...……………………………………………4 HCV 生命周期 ………………………………………………………...…5 以生命周期劃分 HCV 治療藥物整理 …………………………..............6 總結和展望 ………………………...…………………………..……….13 基于 NS5A 抑制劑的創(chuàng)新藥物設計 ………………………………………14 前言 ..........................................................................................................14 NS5A 靶點 ...............................................................................................14 NS5A 抑制劑研究進展 ...........................................................................15 BMS790052(daclatasvir)研究 ................................................................20 創(chuàng)新藥物設計 ..........................................................................................24 參考文獻 ..................................................................................................26 TLR7 激動劑研究與設計 ………………………………………………….29 目前已開發(fā)的激動劑 ..............................................................................29 咪唑喹啉胺（ imidazoquinoline amine）類 ..................................29 1取代 吡唑啉酮 （ 1Substituted Pyrazolo(3,4C) Ring）類 ......31 8氧 去氮嘌呤類 /咪唑并吡啶酮類 .......................................