rna及rna二級結(jié)構(gòu)的理論知識(完整版)
【正文】 結(jié)構(gòu)當中，對于各個組成方面所具有的生物學意義與其堿基序列的組成相比意義更大，這個對比對非編碼的RNA或者DNA同樣適用。（●表示堿基對，數(shù)字表示堿基的序列號）所謂的莖區(qū)結(jié)構(gòu)就是我們通過RNA二級結(jié)構(gòu)示意圖會發(fā)現(xiàn)有一部分雙螺旋區(qū)域是由兩方面組織，一部分是堿基互補對的形式構(gòu)建起來的，另一部分是其余被隔離在雙螺旋區(qū)域之外且沒有堿基對的單鏈則形成了環(huán)結(jié)構(gòu)。那么，如果從穩(wěn)定性上將上述配對放一起做比較的話，通常情況應(yīng)為“G≡C”“A=U”“G=U”。其中嘧啶生物包括胞嘧啶C、尿嘧啶Ｕ和胸腺嘧啶Ｔ；嘌呤生物包括鳥嘌呤Ｇ、腺嘌呤Ａ。核苷酸由核酸經(jīng)大量水解得到；而核苷和磷酸由對核苷酸的水解得到；同樣的，對核苷再進行水解就可得到含氮堿基和戍糖；含氮堿基包括嘌呤堿和嘧啶堿，戍糖經(jīng)過分解形成核糖與脫氧核糖。但正是這一穩(wěn)定的特點，使RNA能形成更復雜的三維結(jié)構(gòu)。 RNA二級結(jié)構(gòu)的組成上文提到，RNA二級結(jié)構(gòu)是RNA分子在自然條件下對自身進行各種形式的回折，在不同的堿基互補對莖區(qū)之間，以非匹配的環(huán)區(qū)形式和最頂部單鏈形式兩者交替出現(xiàn)的莖環(huán)結(jié)構(gòu)。：目前，關(guān)于RNA二級結(jié)構(gòu)的研究依然是RNA分子結(jié)構(gòu)領(lǐng)域當中的重點和難點。 RNA二級結(jié)構(gòu)預測方法的發(fā)展Von et al第一次大概算出了有關(guān)二級結(jié)構(gòu)的能量，他通過研究小分子和利用外推法來預測最穩(wěn)定的大分子結(jié)構(gòu)。另外可能區(qū)域的選擇可通過權(quán)重進一步進行，一直到不能再加了。在有關(guān)序列當中發(fā)現(xiàn)的序列變異也能用來預測可能在每個分子里都存在的堿基配對。 RNA二級結(jié)構(gòu)的表示RNA二級結(jié)構(gòu)的表示方法很多，如半圓表示、圓形表示、點陣表示。（2） 發(fā)卡環(huán)的長度必須大于等于3。Ls和Ld分別表示一個環(huán)中的單堿基個數(shù)和配對的堿基個數(shù)。假結(jié)和三堿基配對的情形的能量，由于目前實驗手段的限制，和數(shù)據(jù)不足兩方面的原因而無法給出其準確的能量計算公式。正多邊形表示等，其中以正多邊形表示最為直觀形象，便于分子生物學家觀察，研究RNA二
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