【正文】
射雜種作圖的計(jì)算 單位為 厘鐳 (cR), 限制性片段作圖與克隆作圖的圖距為 DNA的分子長度,即 堿基對(duì) (bp, kb)。 ?生化性狀基因 ,如血型系列 (ABO)分析、血清蛋白、免疫蛋白、同工酶等。 遺傳作圖的標(biāo)記 DNA標(biāo)記( DNA markers) : 是指以 DNA片段為標(biāo)記,通過DNA片段的電泳使 DNA產(chǎn)生多態(tài)性,如 RFLP等。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 DNA標(biāo)記具有的優(yōu)勢(shì): ? 在數(shù)量上是巨大的; ? 操作相對(duì)簡(jiǎn)單,適合大規(guī)模開展工作; ? 標(biāo)記比較明顯,容易識(shí)別; ? 受環(huán)境影響少,標(biāo)記本身就是遺傳物質(zhì)。 2 遺傳學(xué)圖譜 167。s appointment will begin July 1, 2022. 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 第 1篇有關(guān)人類 RFLP實(shí)驗(yàn)論文 A Highly Polymorphic Locus in Human DNA Arlene R. Wyman and Ray White, MIT A locus in the human genome, not associated with any specific gene, has been found to be a site of restriction fragment length polymorphism. The polymorphism was found by hybridizing a 16 kilobasepair segment of singlecopy human DNA, selected from the human genome library cloned in phage CH4A, to a Southern transfer of total human DNA digested with EcoRI. DNAs from a number of individuals from within Mormon pedigrees as well as random individuals have been examined. The locus is highly variable, with at least eight alleles present, homozygotes accounting for less than 25% of the individuals examined. PNAS | November 1, 1980 | vol. 77 | no. 11 | 67546758 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 第一篇 RFLP論文的誕生 1) David Botstein等在 Alta的研究生學(xué)術(shù)討論上提出 RFLP的想法。 3) 同一凝膠電泳可顯示不同多態(tài)性片段,表現(xiàn)為共顯性; 4)只有兩種等位形式。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 167。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 由于重復(fù)單位的不同,微衛(wèi)星存在著多種不同的類型。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 1400 1200 1000 800 600 400 200 0 CATG/GTAC CTTT/GAAA ATC/TAG GATA/CTAT TGG/ACC CAG/GTC TCT/CTC CGG/GCC ATT/TAA TTG/AAC GT/CA GA/CT SSR motif Estimated number of SSR in the rice genome 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 在微衛(wèi)星 DNA中 , 簡(jiǎn)單序列的重復(fù)次數(shù)在同一物種的不同品種或不同個(gè)體中存在著較大的差異 。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 SSR的特點(diǎn) 1) 染色體上的位臵相對(duì)固定 。 2 遺傳學(xué)圖譜 167。在適當(dāng)?shù)臈l件下一個(gè)寡核苷酸只有在與另一個(gè)核酸分子形成完全的堿基配對(duì)結(jié)構(gòu)時(shí)才能與其雜交。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 幾種分子標(biāo)記特點(diǎn)的比較 標(biāo)記類型 帶型 等位基因數(shù) 穩(wěn)定性 技術(shù)難度 費(fèi)用 RFLP 共顯性 中 高 難 高 SSLP 共顯性 多 高 易 低 SNP 共顯性 中 高 易 高 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 167。 2 遺傳學(xué)圖譜 167。 遺傳標(biāo)記之間的遺傳關(guān)系主要是通過連鎖關(guān)系來反映 。 167。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 遺傳圖的偏離與造成遺傳圖偏離的原因 ? 重組熱點(diǎn) ( rebination hot spot): 染色體上某些比其他位點(diǎn)有更高交 換頻率的位點(diǎn)。 所以測(cè)交便于分析子代個(gè)體基因型的分離比。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 根據(jù)需要與可能,選擇合適的分子標(biāo)記 ,對(duì)親本和作圖群體進(jìn)行標(biāo)記基因型的分析 ,為構(gòu)建遺傳圖譜收集必要的數(shù)據(jù)。 ? 識(shí)別位點(diǎn)的堿基數(shù)與多態(tài)性程度的關(guān)系 , 識(shí)別位點(diǎn)的堿基數(shù)越多 , 產(chǎn)生的片段越長 , 片段長度的多態(tài)性就越高 。 多態(tài)標(biāo)記的篩選 : 根據(jù)親本分析的結(jié)果,選擇具有多態(tài)性的分子標(biāo)記。 Mapmaker軟件的利用 167。當(dāng)座位數(shù)足夠大時(shí),連鎖群的數(shù)目與單倍體的染色體數(shù)目相同。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 圖譜分析 標(biāo)記總數(shù): 圖譜上包含的標(biāo)記(座位)總數(shù)。 圖位克隆的步驟 1) 連鎖標(biāo)記的篩選 。 2 遺傳學(xué)圖譜 167。 3) 尋找與靶基因工分離的分子標(biāo)記; 4) 候選基因分析 。 標(biāo)記密度(座位 / cM): 分子標(biāo)記的平均距離。 167。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 準(zhǔn)備資料 ( prepare data) : 如果是 F2群體的資料 , 閱讀資料后 , 屏幕上將出現(xiàn): data type f2 intercross 146 362 0 symbols 1=A 2=H 3=B 0= ( 個(gè)體數(shù) 座位數(shù) QT數(shù) ) 其中: 1=A—親本 A的純合基因型 ( aa) 2=H—雜合基因型 ( ab) 3=B—親本 B的純合基因型 ( bb) 4=C—非親本 A純合基因型 ( ab, bb) 5=D—非親本 B純合基因型 ( aa, ab)