生物信息學(xué)4733545076-文庫(kù)吧在線文庫(kù)
【正文】 面向生物信息學(xué)院全體本科學(xué)生和研究生，以及全校對(duì)生物信息學(xué)感興趣的其他專業(yè)學(xué)生開放。參考書目： 《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯， 北京大學(xué)出版社， 2002； 《生物信息學(xué)手冊(cè)》 郝柏林 等著， 上?？萍汲霭嫔?， 2004； 《生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 2003。系統(tǒng)樹圖是通過UPGMA方法計(jì)算的。實(shí)驗(yàn)內(nèi)容：1. 運(yùn)行CodonCode Aligner程序，并用它建立工程文件，導(dǎo)入例子文件夾里面的數(shù)據(jù)；練習(xí)對(duì)序列的各種查看方式。實(shí)驗(yàn)內(nèi)容：1. 從網(wǎng)站下載并安裝Primer ；2. 從 GenBank 中任意獲取一個(gè) DNA 序列，設(shè)計(jì)出該序列的合適引物；實(shí)驗(yàn)報(bào)告：1. 實(shí)驗(yàn)各步驟使用的數(shù)據(jù)、運(yùn)算平臺(tái)、結(jié)果文件記錄；2. 比較不同引物設(shè)計(jì)平臺(tái)和不同PCR實(shí)驗(yàn)的差別；參考書目： 《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯， 北京大學(xué)出版社， 2002； 《生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 2003 。實(shí)驗(yàn)原理：現(xiàn)有的蛋白質(zhì)功能分析工具和平臺(tái)都是根據(jù)已知的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行注釋分析、總結(jié)結(jié)構(gòu)規(guī)律建立參考數(shù)據(jù)庫(kù)，并以此作為預(yù)測(cè)未知蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的依據(jù)。實(shí)驗(yàn)報(bào)告：1. perl解釋器安裝方法；2. perl解釋器debug方法；3. 討論：perl語言在生物信息學(xué)研究中所起到的積極作用。Rasmol（）程序有多種版本，有unix, windows, Mac等實(shí)驗(yàn)內(nèi)容：1. ；2. 在PDB網(wǎng)站下載感興趣的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)文件；3. 在Windows用Rasmol打開這個(gè)文件；4. 按照要求，找出感興趣的區(qū)域如保守區(qū)等，用特殊顏色標(biāo)出。實(shí)驗(yàn)五 利用Primer 實(shí)驗(yàn)?zāi)康模菏煜CR引物設(shè)計(jì)工具Primer ，能夠根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要選擇相應(yīng)的引物設(shè)計(jì)方法設(shè)計(jì)PCR引物。參考書目： 《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯， 北京大學(xué)出版社， 2002； 《生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 2003。實(shí)驗(yàn)報(bào)告：1
化學(xué)相關(guān)推薦
鄂ICP備17016276號(hào)-1