【正文】 斷裂鏈內(nèi)二硫鍵 。 谷胱甘肽 （ GSH） ： ?全稱為 γ 谷氨酰半胱氨酰甘氨酸。 ?兩氨基酸單位之間的酰胺鍵 ， 稱為 肽鍵 。 ?構象是由于有機分子中單鍵的旋轉所形成的 。 疊氮反應 ：活化羧基，可用于肽的人工合成 脫羧基反應： Glu脫羧形成 γ氨基丁酸 （ 3） αNH2和 αCOOH共同參加的反應 ?與茚三酮反應 茚三酮在弱酸中與 α氨基酸共熱，引起氨基酸的氧化脫氨，脫羧反應，最后，茚三酮與反應產(chǎn)物 —— 氨和還原茚三酮反應，生成紫色物質（ λmax=570nm）。 ?可利用此性質采用紫外分分光度法測定蛋白質的含量 。 ?通過改變?nèi)芤旱?pH可使氨基酸分子的解離狀態(tài)發(fā)生改變。 b)極性氨基酸： Gly,Tyr， Cys， Ser， Thr，Asn， Gln； Lys,Arg,His。除 脯氨酸 和 甘氨酸 外 ， 其余均屬于 Lα 氨基酸 。第二章 蛋白質的結構與功能 Chapter 2 Structure and Function of Protein 主講人：段江燕 ?蛋白質 (protein)是由氨基酸為單位組成的一類重要的生物大分子 ， 是生命的物質基礎 。 ? 氨基酸的功能 （ 1） 、 組成蛋白質 （ 2） 、 一些 aa及其衍生物充當化學信號分子 ?氨基丁酸 ， 色氨酸衍生物： 5羥色胺 、 褪黑激素 ， 都是神經(jīng)遞質 ， 甲狀腺素 （ Tyr衍生物 ） ， 吲哚乙酸 （ Trp衍生物 ） 都是激素 （ 3） 、 氨基酸是許多含 N分子的前體物 核酸的含氮堿基 、 血紅素 、 葉綠素的合成都需要 aa （ 4） 、 一些基本氨基酸和非基本 aa是代謝中間物 精氨酸、瓜氨酸、鳥氨酸 )尿素循環(huán)的中間物， C O O H │ H 2 N — C — H │ R 一、氨基酸 (amino acid)的結構與通式 基本氨基酸 （ 編碼的蛋白質氨基酸 ） ：組成蛋白質 ， 20種 ， 稀有氨基酸：是多肽合成后由基本 aa經(jīng)酶促修飾而來 。Asp,Glu. 三、氨基酸的理化性質： 1．兩性解離及等電點： (1) 氨基酸在晶體和水溶液中主要以兼性離子形式存在 ① 晶體溶點高 → 離子晶格 ， 不是分子晶格 。 ?氨基酸分子帶有相等正、負電荷時，溶液的 pH值稱為該氨基酸的 等電點 （ pI）。 氨基酸的光吸收性 Tyr、 Phe、 Trp的R基含有共軛雙鍵，在 220300nm近紫外區(qū)有吸收。 Pro、 HyPro與直接形成黃色化合物（ λmax=440nm） ?成肽反應 （ 4）側鏈 R基參加的反應 —— 用于蛋白質的化學修飾 ?Trp ?Arg ?His ?Tyr ?Cys ?Pro 三、氨基酸的分離和分析 （一）基于電荷性質差異的分離方法 電泳分離 電泳的基本原理 Glu、 Leu 、 His 、 Lys， 4種混合樣 ， 在 ， 泳動方向及相對速度： Glu Leu His Lys pI 離子交換柱層析 （二）基于分配系數(shù)（極性）差異的分離方法 —— 分配層析 ? 紙層析 ?薄層層析 ?分配柱層析 第三節(jié) 蛋白質的分子結構 ?蛋白質是由許多氨基酸單位通過肽鍵連接起來的 ， 具有特定分子結構的高分子化合物 。 蛋白質的構象通常由 非共價鍵 （ 次級鍵 ） 來維系 。多肽鏈中的氨基酸單位稱為 氨基酸殘基 。其巰基可氧化、還原，故有還原型（ GSH）與氧化型（ GSSG）兩種存在形式。 （ 4） 分析多肽鏈的 N末端和 C末端 。 （ 9） 確定多肽鏈中二硫鍵的位置 。 ② C端分析 ★ 肼解法 無水肼 NH2NH2 100℃ 510h。 （三）蛋白質的一級結構與生物功能 ★ 蛋白質的一級結構決定高級結構和功能 ★ 同源蛋白質一級結構的種屬差異與生物進化 通過比較同源蛋白質的氨基酸序列的差異可以研究不同物種間的親源關系和進化 。 ★ 蛋白質一級結構的突變 — 分子病 分子病：基因突變引起的某個功能蛋白的某一個或幾個氨基酸殘基發(fā)生了遺傳性替代從而導致整個分子的三維結構發(fā)生改變 ， 功能部分或全部喪失 。 蛋白質分子中氫鍵的形成 2. 疏水鍵： ?非極性物質在含水的極性環(huán)境中存在時 ，會產(chǎn)生一種相互聚集的力 ， 這種力稱為 疏水鍵或疏水作用力 。 蛋白質分子中離子鍵的形成 4． 范德華氏 （ van der Waals)引力： ?原子之間存在的相互作用力 。 結構 ， 稱為肽單元或肽鍵平面 。 （ 2） 肽鍵具有部分雙鍵性質 ， 不能自由旋轉 。 ★ 從 Cα沿鍵軸方向看，順時針旋轉的 Φ (Ψ)角為正值，反之為負值。 ， 是一種右手螺旋 ② 每圈螺旋： ， 高度： ③ 每個殘基繞軸旋轉 100176。 封閉環(huán)原子數(shù) =3n+4（ n= .....） （ n：后邊第 n個 aa） （ n=1） 310 螺旋 （ n=2） 613螺旋 （ n=3） （ n=4） 310 n=1 n=2 n=3 n=4 ?影響 α 螺旋穩(wěn)定的因素有： ⑴ 極大的側鏈基團 （ 存在空間位阻 ） ； ⑵ 連續(xù)存在的側鏈帶有相同電荷的氨基酸殘基 （ 同種電荷的互斥效應 ） ； ⑶ 有 Pro等亞氨基酸存在 （ 不能形成氫鍵 ） 。 回折 。 RNase的分子結構 α 螺旋 β 折迭 β 轉角 無規(guī)卷曲 三 、 超二級結構 由若干個相鄰的二級結構單元 （ α螺旋 、 β折疊 、 β轉角及無規(guī)卷曲 ） 組合在一起 ， 彼此相互作用 ， 形成有規(guī)則的 、 在空間上能夠辨認的二級結構組合體