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蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能-wenkub

2023-05-18 07:58:54 本頁(yè)面
 

【正文】 斷裂鏈內(nèi)二硫鍵 。 谷胱甘肽 ( GSH) : ?全稱為 γ 谷氨酰半胱氨酰甘氨酸。 ?兩氨基酸單位之間的酰胺鍵 , 稱為 肽鍵 。 ?構(gòu)象是由于有機(jī)分子中單鍵的旋轉(zhuǎn)所形成的 。 疊氮反應(yīng) :活化羧基,可用于肽的人工合成 脫羧基反應(yīng): Glu脫羧形成 γ氨基丁酸 ( 3) αNH2和 αCOOH共同參加的反應(yīng) ?與茚三酮反應(yīng) 茚三酮在弱酸中與 α氨基酸共熱,引起氨基酸的氧化脫氨,脫羧反應(yīng),最后,茚三酮與反應(yīng)產(chǎn)物 —— 氨和還原茚三酮反應(yīng),生成紫色物質(zhì)( λmax=570nm)。 ?可利用此性質(zhì)采用紫外分分光度法測(cè)定蛋白質(zhì)的含量 。 ?通過(guò)改變?nèi)芤旱?pH可使氨基酸分子的解離狀態(tài)發(fā)生改變。 b)極性氨基酸: Gly,Tyr, Cys, Ser, Thr,Asn, Gln; Lys,Arg,His。除 脯氨酸 和 甘氨酸 外 , 其余均屬于 Lα 氨基酸 。第二章 蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能 Chapter 2 Structure and Function of Protein 主講人:段江燕 ?蛋白質(zhì) (protein)是由氨基酸為單位組成的一類重要的生物大分子 , 是生命的物質(zhì)基礎(chǔ) 。 ? 氨基酸的功能 ( 1) 、 組成蛋白質(zhì) ( 2) 、 一些 aa及其衍生物充當(dāng)化學(xué)信號(hào)分子 ?氨基丁酸 , 色氨酸衍生物: 5羥色胺 、 褪黑激素 , 都是神經(jīng)遞質(zhì) , 甲狀腺素 ( Tyr衍生物 ) , 吲哚乙酸 ( Trp衍生物 ) 都是激素 ( 3) 、 氨基酸是許多含 N分子的前體物 核酸的含氮堿基 、 血紅素 、 葉綠素的合成都需要 aa ( 4) 、 一些基本氨基酸和非基本 aa是代謝中間物 精氨酸、瓜氨酸、鳥(niǎo)氨酸 )尿素循環(huán)的中間物, C O O H │ H 2 N — C — H │ R 一、氨基酸 (amino acid)的結(jié)構(gòu)與通式 基本氨基酸 ( 編碼的蛋白質(zhì)氨基酸 ) :組成蛋白質(zhì) , 20種 , 稀有氨基酸:是多肽合成后由基本 aa經(jīng)酶促修飾而來(lái) 。Asp,Glu. 三、氨基酸的理化性質(zhì): 1.兩性解離及等電點(diǎn): (1) 氨基酸在晶體和水溶液中主要以兼性離子形式存在 ① 晶體溶點(diǎn)高 → 離子晶格 , 不是分子晶格 。 ?氨基酸分子帶有相等正、負(fù)電荷時(shí),溶液的 pH值稱為該氨基酸的 等電點(diǎn) ( pI)。 氨基酸的光吸收性 Tyr、 Phe、 Trp的R基含有共軛雙鍵,在 220300nm近紫外區(qū)有吸收。 Pro、 HyPro與直接形成黃色化合物( λmax=440nm) ?成肽反應(yīng) ( 4)側(cè)鏈 R基參加的反應(yīng) —— 用于蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾 ?Trp ?Arg ?His ?Tyr ?Cys ?Pro 三、氨基酸的分離和分析 (一)基于電荷性質(zhì)差異的分離方法 電泳分離 電泳的基本原理 Glu、 Leu 、 His 、 Lys, 4種混合樣 , 在 , 泳動(dòng)方向及相對(duì)速度: Glu Leu His Lys pI 離子交換柱層析 (二)基于分配系數(shù)(極性)差異的分離方法 —— 分配層析 ? 紙層析 ?薄層層析 ?分配柱層析 第三節(jié) 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu) ?蛋白質(zhì)是由許多氨基酸單位通過(guò)肽鍵連接起來(lái)的 , 具有特定分子結(jié)構(gòu)的高分子化合物 。 蛋白質(zhì)的構(gòu)象通常由 非共價(jià)鍵 ( 次級(jí)鍵 ) 來(lái)維系 。多肽鏈中的氨基酸單位稱為 氨基酸殘基 。其巰基可氧化、還原,故有還原型( GSH)與氧化型( GSSG)兩種存在形式。 ( 4) 分析多肽鏈的 N末端和 C末端 。 ( 9) 確定多肽鏈中二硫鍵的位置 。 ② C端分析 ★ 肼解法 無(wú)水肼 NH2NH2 100℃ 510h。 (三)蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)與生物功能 ★ 蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)決定高級(jí)結(jié)構(gòu)和功能 ★ 同源蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的種屬差異與生物進(jìn)化 通過(guò)比較同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列的差異可以研究不同物種間的親源關(guān)系和進(jìn)化 。 ★ 蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的突變 — 分子病 分子?。夯蛲蛔円鸬哪硞€(gè)功能蛋白的某一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基發(fā)生了遺傳性替代從而導(dǎo)致整個(gè)分子的三維結(jié)構(gòu)發(fā)生改變 , 功能部分或全部喪失 。 蛋白質(zhì)分子中氫鍵的形成 2. 疏水鍵: ?非極性物質(zhì)在含水的極性環(huán)境中存在時(shí) ,會(huì)產(chǎn)生一種相互聚集的力 , 這種力稱為 疏水鍵或疏水作用力 。 蛋白質(zhì)分子中離子鍵的形成 4. 范德華氏 ( van der Waals)引力: ?原子之間存在的相互作用力 。 結(jié)構(gòu) , 稱為肽單元或肽鍵平面 。 ( 2) 肽鍵具有部分雙鍵性質(zhì) , 不能自由旋轉(zhuǎn) 。 ★ 從 Cα沿鍵軸方向看,順時(shí)針旋轉(zhuǎn)的 Φ (Ψ)角為正值,反之為負(fù)值。 , 是一種右手螺旋 ② 每圈螺旋: , 高度: ③ 每個(gè)殘基繞軸旋轉(zhuǎn) 100176。 封閉環(huán)原子數(shù) =3n+4( n= .....) ( n:后邊第 n個(gè) aa) ( n=1) 310 螺旋 ( n=2) 613螺旋 ( n=3) ( n=4) 310 n=1 n=2 n=3 n=4 ?影響 α 螺旋穩(wěn)定的因素有: ⑴ 極大的側(cè)鏈基團(tuán) ( 存在空間位阻 ) ; ⑵ 連續(xù)存在的側(cè)鏈帶有相同電荷的氨基酸殘基 ( 同種電荷的互斥效應(yīng) ) ; ⑶ 有 Pro等亞氨基酸存在 ( 不能形成氫鍵 ) 。 回折 。 RNase的分子結(jié)構(gòu) α 螺旋 β 折迭 β 轉(zhuǎn)角 無(wú)規(guī)卷曲 三 、 超二級(jí)結(jié)構(gòu) 由若干個(gè)相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)單元 ( α螺旋 、 β折疊 、 β轉(zhuǎn)角及無(wú)規(guī)卷曲 ) 組合在一起 , 彼此相互作用 , 形成有規(guī)則的 、 在空間上能夠辨認(rèn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體
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