蛋白質(zhì)與dna的相互作用(已修改)
2025-10-30 05:28 本頁面
【正文】 ,蛋白質(zhì)與DNA的相互作用 劉興漢 哈爾濱醫(yī)科大學生物化學(shēnɡ w249。 hu224。 xu233。)與分子生物學教研室,第一頁，共三十七頁。,分類(fēn l232。i)： 與單鏈RNA結(jié)合 與莖環(huán)結(jié)構(gòu)結(jié)合 與雙鏈DNA結(jié)合：普遍性結(jié)合 特異性結(jié)合,第二頁，共三十七頁。,蛋白質(zhì)與DNA結(jié)合的特性： 1.DNA識別部位有二度對稱性。蛋白質(zhì)一般是有二度對稱結(jié)構(gòu)的二聚體，兩個單體具有(j249。yǒu)旋轉(zhuǎn)對稱性，與鹼基的旋轉(zhuǎn)對稱吻合。 2.蛋白質(zhì)和DNA的接觸區(qū)只在DNA的一側(cè)。 3.在結(jié)合過程中，蛋白質(zhì)和DNA都有構(gòu)像改變。 4.普遍性結(jié)合：蛋白質(zhì)中帶正電荷氨基酸與DNA骨架的磷酸基團形成離子鍵。 5. 特異性結(jié)合：識別螺旋區(qū)內(nèi)氨基酸與DNA特定鹼基接觸。,第三頁，共三十七頁。,蛋白質(zhì)與DNA的普遍性結(jié)合中DNA特點： 蛋白質(zhì)與DNA主鏈骨架接觸，大多數(shù)涉及磷酸二酯鍵中的氧原子。 與DNA鹼基序列特異性無關(guān) 結(jié)構(gòu)的匹配性： 旋轉(zhuǎn)對稱性 特定距離的相反電荷 形成氫鍵基團排布(p225。i b249。)上的匹配 形成足夠大的范德華力,第四頁，共三十七頁。,1.蛋白質(zhì)和DNA都存在0.7nm 的重復(ch243。ngf249。)距離 DNA雙螺旋單鏈相鄰磷酸基團間的距離是0.7nm。 β—折疊，N原子間距離是0.7nm 伸展β—折疊Cβ間距離是0.7nm α—螺旋，Arg和Lys被另外三個殘基隔開，帶正電荷側(cè)鏈的距離是0.7nm. 2.DNA對稱性 平移對稱： GCATCT GCATCT CGTAGA CGTAGA,,第五頁，共三十七頁。,二重(232。r zh242。nɡ)軸對稱 GCATCT TCTACG CGTAGA AGATGC 二重旋轉(zhuǎn)對稱 GCATCT AGATGC CGTAGA
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