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正文內(nèi)容

生物信息學(xué)軟件介紹(已修改)

2025-01-28 11:18 本頁面
 

【正文】 生物信息學(xué)軟件及使用技巧 劉吉平 內(nèi)容概要 生物信息學(xué)軟件的主要功能簡介 1. 分析和處理實驗數(shù)據(jù)和公共數(shù)據(jù),加快研究進(jìn)度,縮短科研時間 2. 提示、指導(dǎo)、替代實驗操作,利用對實驗數(shù)據(jù)的分析所得的結(jié)論設(shè)計下一階段的實驗 3. 用計算機(jī)管理實驗數(shù)據(jù) 4. 尋找、預(yù)測新基因及預(yù)測其結(jié)構(gòu)、功能 5. 蛋白高級結(jié)構(gòu)預(yù)測 二 .生物學(xué)軟件部分常見功能使用技巧 PCR 引物設(shè)計 DNA、蛋白質(zhì)序列同源分析及進(jìn)化樹構(gòu)建 Contig ExpressDNA 序列片斷拼接 DNA 模擬電泳 重要生物數(shù)據(jù)庫簡介 三. 生物信息學(xué)服務(wù) 生物信息學(xué)的概念: 生物信息學(xué)是一門新興的交叉學(xué)科,它將數(shù)學(xué)和計算機(jī)知識應(yīng)用于生物學(xué),以獲取、加工、存儲、分類、檢索與分析生物大分子的信息,從而理解這些信息的生物學(xué)意義。 二 . 生物信息學(xué)軟件的主要功能簡介 網(wǎng)上數(shù)據(jù)庫的運用 ? IRACE (基因拉長功能) ? BLAST同源序列檢索 ? ENTREZ SYSTEM (集成信息檢索系統(tǒng) ) 生物信息學(xué)軟件主要功能 1. 分析和處理實驗數(shù)據(jù)和公共數(shù)據(jù),加快研究進(jìn)度,縮短科研時間 2. 提示、指導(dǎo)、替代實驗操作,利用對實驗數(shù)據(jù)的分析所得的結(jié)論設(shè)計下一階段的實驗 3. 實驗數(shù)據(jù)的自動化管理 4. 尋找、預(yù)測新基因及其結(jié)構(gòu)、功能 5. 蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)及功能預(yù)測(三維建模,目前研究的焦點和難點) 功能 1. 分析和處理實驗數(shù)據(jù)和公共數(shù)據(jù),加快研究進(jìn)度,縮短科研時間 ? 核酸:序列同源性比較,分子進(jìn)化樹構(gòu)建,結(jié)構(gòu)信息分析,包括基元 (Motif)、酶切點、重復(fù)片斷、堿基組成和分布、開放閱讀框( ORF),蛋白編碼區(qū)( CDS)及外顯子預(yù)測、 RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測、 DNA片段的拼接 ? 蛋白:序列同源性比較,結(jié)構(gòu)信息分析(包括 Motif,限制酶切點,內(nèi)部重復(fù)序列的查找,氨基酸殘基組成及其親水性及疏水性分析 ),等電點及二級結(jié)構(gòu)預(yù)測等等 ? 本地序列與公共序列的聯(lián)接,成果擴(kuò)大 ENTREZ 集成檢索示意圖 Antheprot Dot Plot 點陣圖 Peptool Li
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