【正文】 分子生物學(xué)復(fù)習(xí) 一、主要專業(yè)術(shù)語 ? 組蛋白： 真核細(xì)胞染色體結(jié)構(gòu)蛋白， 2M NaCl能使之與 DNA分開，包括： H1,H2A,H2B,H3,H4。 ? C值（ Cvalue):一種生物單倍體基因組 DNA的總量。 ? C值反?，F(xiàn)象（ Cvalue paradox): 真核生物含有大量不編碼蛋白的重復(fù)序列，高等生物的 C值一般大于低等生物，且隨著生物的進(jìn)化而增加。但兩棲類動物的 C 值比哺乳動物的還大，并且兩棲類動物的 C值相差也比較大，甚至相差 100倍，這種現(xiàn)象為 C值反常現(xiàn)象。 ? 衛(wèi)星 DNA（ satellite DNA): 真核生物染色體中的一些高度重復(fù)序列，通常位于染色體的著絲粒部位，也有一些存在于染色體臂上，當(dāng)該生物的總 DNA進(jìn)行電泳時(shí)，這些 DNA出現(xiàn)在主帶以外的衛(wèi)星區(qū)帶內(nèi)，衛(wèi)星 DNA不轉(zhuǎn)錄，是異染色質(zhì)成分，與染色體的穩(wěn)定性有關(guān)。 ? 小衛(wèi)星 DNA(mimisatellite DNA): 又稱可變串聯(lián)重復(fù)序列（ variable number of tandem repeat, VNTR)， 10~數(shù)百個 bp，由于存在重復(fù)單位的不平衡交換，產(chǎn)生不同等位基因，通過雜交可以檢測，是多態(tài)性的一種。 ? 微衛(wèi)星 DNA(microsatellite DNA)： 重復(fù)單位序列最短，只有 2～6bp，串聯(lián)成簇，長度 50～ 100bp，又稱為短串聯(lián)重復(fù)序列（ Short Tandem Repeat ， STR)。廣泛分布于基因組中。 富含 AT堿基對。 ? 單核苷酸多態(tài)性 （ single nucleotide polymorphism, SNP):單個核苷酸引起的 DNA多態(tài)性。 ? 串聯(lián)重復(fù)序列的多態(tài)性 （ tandem repeats polymorphism): 由重復(fù)序列增減引起的 DNA多態(tài)性。 ? 端粒（ telomere):真核生物線性基因組末端的一種特殊結(jié)構(gòu)，是DNA和蛋白質(zhì)組成的復(fù)合體，其中的 DNA多為高度重復(fù)序列，能穩(wěn)定染色體 DNA，決定細(xì)胞壽命。 ? DNA半保留復(fù)制（ Semiconservative replication): DNA在復(fù)制過程中，兩條鏈間的氫鍵斷裂，兩條鏈分開，每條鏈分別作為模板合成新鏈，產(chǎn)生互補(bǔ)的雙鏈，這樣新合成的兩個 DNA與原 DNA分子的堿基序列完全相同，每個子代DNA中的一條鏈來自親代 DNA，另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻摹? ? 復(fù)制子 （ replicon):DNA的復(fù)制單位，從復(fù)制起點(diǎn)到復(fù)制終點(diǎn)的一段 DNA。 ? D環(huán)型（ Dloop): 先在動物線粒體 DNA復(fù)制時(shí)被發(fā)現(xiàn)。這種復(fù)制兩鏈合成高度不對稱，一條鏈迅速指導(dǎo)互補(bǔ)鏈的合成，另一條鏈則游離出成單環(huán)（ D環(huán)）。 ? 半不連續(xù)復(fù)制（ DNA semidiscontinuous replication)： 從 DNA的復(fù)制過程來看，一條新鏈的合成是連續(xù)的，另外的一條鏈的合成是先合成一些短的岡崎片段，再連接成連續(xù)的新鏈，因此這種復(fù)制方式為半不連續(xù)復(fù)制。 ? 錯配修復(fù) 恢復(fù)錯配的堿基 ? 切除修復(fù) （堿基切除修復(fù)、核苷酸切除修復(fù)） 切除突變的堿基或核苷酸，恢復(fù)破壞的 DNA ? 重組修復(fù) 受損 DNA先不復(fù)制，而是由其等位基因復(fù)制一段后替代受損 DNA. ? DNA直接修復(fù) 酶催化修復(fù)嘧啶二聚體或甲基化DNA ? SOS修復(fù)系統(tǒng) DNA損傷后產(chǎn)生過多單鏈引起的修復(fù) ? DNA轉(zhuǎn)座（ transposition): 由可移位因子介導(dǎo)的遺傳物質(zhì)的重排現(xiàn)象。 ? 轉(zhuǎn)座子（ transposon, Tn):存在于染色體 DNA上可自主復(fù)制和轉(zhuǎn)移的基本單位。 ? 插入序列（ insertional sequence,IS)： 不含任何宿主基因的轉(zhuǎn)座子，當(dāng)其插入特定基因中造成該基因突變。 ? 復(fù)合式轉(zhuǎn)座子（ posite transposon):帶有抗藥性基因或其它宿主基因的轉(zhuǎn)座子，其兩側(cè)帶有兩個相同或高度同源的 IS序列。當(dāng)兩個 IS插入某個功能基因兩側(cè)時(shí)就產(chǎn)生了復(fù)合式轉(zhuǎn)座子， IS就不能單獨(dú)移動。 ? P轉(zhuǎn)座子（ P element): 果蠅中的一種轉(zhuǎn)座子 ,插入基因組中的 w位點(diǎn)能引起雜交后代的不育。 P轉(zhuǎn)座子兩側(cè)有 31bp的倒置重復(fù)序列，插入靶位點(diǎn)還產(chǎn)生 8bp的正向重復(fù)序列。 P轉(zhuǎn)座子含 4個外顯子和 3個內(nèi)含子。 ? 啟動子（ promoter): 位于基因 5’端上游的 DNA序列，能活化 RNA聚合酶，使之與 DNA模板結(jié)合，引起轉(zhuǎn)錄的開始。識別后，啟動子附近的 DNA雙鏈分開形成轉(zhuǎn)錄泡，核苷酸與模板 DNA配對。 ? 終止子（ Terminator):位于基因 3’下游的一端 DNA，當(dāng)轉(zhuǎn)錄進(jìn)行到該區(qū)域時(shí)， RNA聚合酶與模板分離，RNA鏈釋放，轉(zhuǎn)錄終止。 ? 轉(zhuǎn)錄單元（ transcrition unit): 從啟動子開始到終止子結(jié)束的一段 DNA序列。 RNAP從轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)開始轉(zhuǎn)錄，沿模板前進(jìn)到終止子結(jié)束轉(zhuǎn)錄出一條 RNA鏈。 ? 轉(zhuǎn)錄起點(diǎn) ：與新生 RNA鏈第一個核苷酸相對應(yīng)模板鏈上的堿基，通常是嘌呤。 ? 下降突變（ down mutation)： 啟動子內(nèi)的某個堿基突變導(dǎo)致其啟動轉(zhuǎn)錄效率降低的現(xiàn)象。 ? 上升突變（ up mutation):啟動子內(nèi)的某個堿基突變導(dǎo)致其啟動轉(zhuǎn)錄效率提高的現(xiàn)象。 ? 增強(qiáng)子（ enhancer） :位于啟動子以外的 DNA序列，能增強(qiáng)或促進(jìn)轉(zhuǎn)錄的開始，且其增強(qiáng)活性不以其位置的改變而改變，可能促進(jìn)了RNAP與 DNA的相互作用而促進(jìn)了轉(zhuǎn)錄。 ? 抗終止（ antitermination):轉(zhuǎn)錄過程中即使遇到終止信號，轉(zhuǎn)錄仍然繼續(xù)進(jìn)行的現(xiàn)象。 ? RNA剪接（ RNA splicing): 從 RNA前體分子中去除被稱為內(nèi)含子（ intron)的非編碼區(qū)，連接被稱為外顯子（ exon)的編碼區(qū)，使之成為成熟 RNA分子的過程。 ? 核不均一 RNA（ hnRNA, heterogeneous nuclear RNA): 真核基因的原始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物，即 mRNA前體。 ? 內(nèi)含子變位剪接： 高等生物中，內(nèi)含子通常是有序或組成性地從 hnRNA中被切除。然而在個體發(fā)育或細(xì)胞分化的特定時(shí)期，可以選擇性地越過某些外顯子或剪接位點(diǎn)進(jìn)行剪接，產(chǎn)生組織或發(fā)育特定階段的mRNA。 ? RNA編輯（ RNA editing): RNA特別是 mRNA的一種加工形式，它導(dǎo)致了 DNA所編碼的遺傳信息的改變，因?yàn)?RNA的序列經(jīng)過編輯發(fā)生改變。 ? SD序列 （ ShineDalgarno sequence),或 核糖體結(jié)合位點(diǎn)（ ribosome binding site, RBS)：原核生物 mRNA起始密碼子前含有 712個核苷酸的保守區(qū)，與核糖體小亞基中16S rRNA的 3’端互補(bǔ)，在 mRNA核糖體結(jié)合過程中起作用 ? 核酶（ ribozyme): 一類具有催化功能的 RNA分子，通過催化 RNA鏈中的靶位點(diǎn)中磷酸二酯鍵的斷裂，特異性的剪接 RNA 分子。分為：剪切型核酶和剪接型核酶 ? 密碼子（ codon):存在于 mRNA中的三個相鄰的核苷酸順序，是蛋白質(zhì)合成中某一特定 Aa的密碼單位，密碼子確定哪一個 Aa摻入多肽鏈上的哪個位置。 ? 移碼突變（ frameshift mutation):基因中插入或缺失若干核苷酸，轉(zhuǎn)錄后以突變的 mRNA為模板合成蛋白質(zhì)時(shí)，會改變突變密碼子以后的全部 Aa序列。 ? 密碼子兼并性（ codon degeneracy): 由一種以上的密碼子編碼同一 Aa的現(xiàn)象。 ? 同義密碼子（ synonymous codon):對應(yīng)同一 Aa的不同密碼子。如 GGG, GGA, GGC, GGU 一般而言，某 Aa的同義密碼子越多，則該 Aa在蛋白質(zhì)中出現(xiàn)的頻率也越高。 ? 同工 tRNA（ isoacceptor tRNA ）： 攜帶同一 Aa的不同 tRNA。同工 tRNA結(jié)構(gòu)相似。 ? 無義突變： 基因內(nèi)部一個核苷酸的突變，使編碼 Aa的密碼子突變成了終止密碼子，使蛋白質(zhì)合成提前終止，合成出無功能或無意義的多肽。 ? 錯義突變： 基因內(nèi)部一個核苷酸的突變，使編碼 Aa的密碼子突變成了編碼另外一個 Aa的密碼子。 ? 分子伴侶（ molecular chaperone):很多新合成的多肽折疊成有功能蛋白時(shí)，必需有其它蛋白分子的參與才能完成，但這些蛋白并不是折疊蛋白的一部分，這些幫助其它蛋白折疊的蛋白分子就是分子伴侶。 ? 泛素（ ubiquitin)： 真核細(xì)胞中存在的由 76Aa組成的蛋白，高度保守，它通過結(jié)合在其它蛋白上，從而改變這些蛋白的功能，引導(dǎo)蛋白進(jìn)入蛋白酶體而降解。 ? Klenow fragment: DNA聚合酶 I經(jīng)枯草芽孢桿菌蛋白酶 (subtilisin)切割產(chǎn)生的大片段 ,具有 DNA聚合酶和 3’→ 5’ 外切酶的活性 ,缺少 5’ → 3’ 外切酶的活性。 ? 感受態(tài)細(xì)胞（ petent cell):經(jīng)過物理、化學(xué)方法處理而易于獲取外源 DNA的細(xì)胞。 ? 核酸分子雜交（ Hybridization of nucleic acids） :帶有互補(bǔ)序列的單鏈 DNA或 RNA混合在一起退火時(shí)，其相應(yīng)的同源區(qū)段會形成雙鏈的過程。 ? 雜交分子（ Hybrid molecular） :不同來源的單鏈 DNA或 RNA分子退火形成的雙鏈分子。 ? Southern blot(DNA 印跡）： 酶切的 DNA片段經(jīng)過瓊脂糖凝膠電泳分離，堿變性后轉(zhuǎn)移到固相支持物（ NC膜）上，用標(biāo)記的探針檢出目的片段所在位置的方法。發(fā)明人： Edwin Southern(英） ? Northern blottting(RNA印跡 )： 不同分子量的 RNA經(jīng)過變性瓊脂糖凝膠電泳分離，轉(zhuǎn)移到固相支持物上，用特異探針檢出目的RNA所在位置的方法。 ? Western Blotting(蛋白質(zhì)印跡 ,免疫印跡 ): 不同分子量的蛋白質(zhì)經(jīng) SDSPAGE分離，轉(zhuǎn)移到固相支持物上，用特異的抗體檢出目的蛋白所在位置的方法。 ? Southwestern blotting: 蛋白質(zhì)經(jīng)過 PAGE分離并轉(zhuǎn)移到固相支持物上，用標(biāo)記的雙鏈 DNA檢出 DNA結(jié)合蛋白的方法。 ? Northwestern blotting: 蛋白質(zhì)經(jīng)過 PAGE分離并轉(zhuǎn)移到固相支持物上，用標(biāo)記的 RNA檢出 RNA結(jié)合蛋白的方法。 ? 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（ polymerase chain reaction， PCR)：體外利用 DNA快速擴(kuò)增特定基因或 DNA序列的方法。若干循環(huán)，每一個循環(huán)包括：變性、退火、延伸三個階段。 ? 同義 cSNP (synonymous cSNP): SNP導(dǎo)致的編碼序列改變不影響其所翻譯蛋白的氨基酸序列 ,突變堿基與非突變堿基的含義相同 . ? 非同義 cSNP (nonsynonymous cSNP): SNP導(dǎo)致的編碼序列改變導(dǎo)致翻譯出蛋白質(zhì)的氨基酸序列發(fā)生改變 ,從而導(dǎo)致性狀的改變 . ? 單倍型（ haplotype） :位于某一等位基因內(nèi)部的多個 SNP的總和。 ? 基因分型 ( genotyping): 利用數(shù)據(jù)庫中已有的 SNP進(jìn)行特定人群的序列和發(fā)生頻率的研究技術(shù) ,包括基因芯片技術(shù) ,Taqman技術(shù) ,分子信標(biāo) (molecular beacon)技術(shù)和焦磷酸測序技術(shù) (pyrosequencing)等 . ? 基因敲除（ gene knockout): 又稱基因打靶，通過外源 DNA與染色體 DNA間的同源重組，進(jìn)行精確的定點(diǎn)修飾和基因改造，使基因失活，從而確定基因與性狀的關(guān)系，具有專一性強(qiáng)，染色體DNA與外源 DNA共同穩(wěn)定遺傳等特點(diǎn)。 ? TDNA（ transfer DNA):位于 Ti質(zhì)粒上的一段 DNA序列，該 DNA進(jìn)入植物細(xì)胞后，可整合到植物基因組 DNA中 ,插入是隨機(jī)的。 ? RACE(rapid amplification of cDNA ends):在已知部分 cDNA序列的基礎(chǔ)上，通過 PCR擴(kuò)增 cDNA 3’或 5’端未知序列的技術(shù)。分為5’RACE和 3’RACE。 ? cDNA差示分析法（ representional difference analysis ,RDA):利用不同細(xì)胞來源的 cDNA雜交，通過改變接頭和 PCR技術(shù)擴(kuò)增目的 cDNA的片段。 ? 基因圖位克隆法（ mapbased cloning） :根據(jù)基因連鎖圖，確定決定某種表現(xiàn)型基因的方法。 ? RFLP(Restriction fragment length polymorphism, 限制性片段長度多態(tài)性 )： 生物個體之間 DNA的序列存在差異，稱為 DNA多態(tài)性。由于 DNA序列的改變導(dǎo)致了 DNA分子上限制性內(nèi)切酶的酶切位點(diǎn)發(fā)生改變，從而導(dǎo)致了相應(yīng)限制性酶切片段的長度和數(shù)量發(fā)生變化。 ? RAPD(Random amplification polymorphic DNA, 隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性 DNA): 利用隨機(jī)引物，通過 PCR從基因組中擴(kuò)增不同長度的DNA片段的技術(shù)。 ? 染色