常見的生物信息學軟件的介紹和文獻依據(jù)-文庫吧
2025-03-23 03:26 本頁面
【正文】 conductor包20459804ChIPseqR核小體定位和組蛋白修飾ChIPseq實驗分析21281468Chipster用于微陣列和其他高通量數(shù)據(jù)的用戶友好的分析軟件21999641CisGenome一個分析ChIPchip和ChIPSeq的整合軟件系統(tǒng)18978777ClutrFree聚類樹可視化與解釋15145813COBrA一個生物本體論編輯器15513995Cobweb一個網(wǎng)絡(luò)瀏覽和可視化Java小程序21486937ComBat使用經(jīng)驗貝葉斯方法調(diào)整微陣列表達數(shù)據(jù)中的批次影響16632515coMOTIF一個識別ChIPseq數(shù)據(jù)中轉(zhuǎn)錄因子和共調(diào)控motif的混合框架21775309ContEst評估下一代測序數(shù)據(jù)中人類樣品的交叉污染21803805ConscriptRasMol到PyMOL的腳本轉(zhuǎn)換器21567873CoXpress基因表達數(shù)據(jù)中的差異共表達分析（R包）17116249Cytoscape ESP使用邏輯操作符和通配符在多屬性領(lǐng)域搜索復雜生物網(wǎng)絡(luò)的Cytoscape插件18445605Cytoscape Web一個交互式基于網(wǎng)絡(luò)的網(wǎng)絡(luò)瀏覽器20656902DAnTE一個定量分析組學數(shù)據(jù)（蛋白質(zhì)組、微陣列）的統(tǒng)計工具18453552DBChIP用ChIPseq檢測轉(zhuǎn)錄因子的差異結(jié)合22057161Dendroscope一個交互式大型系統(tǒng)發(fā)生樹查看器18034891DIME基于一套混合模型的差異ChIPseq結(jié)合位點識別R包21471015DendroPy一個系統(tǒng)發(fā)生計算Python庫20421198DrugViz一個在生物網(wǎng)絡(luò)中可視化和分析小分子藥物的Cytoscape插件18658180dsrcFASTQ格式中DNA序列片段的壓縮21252073EagleView一個適用于下一代測序技術(shù)的基因組裝配查看器18550804EASE在基因列表中識別生物學主題，用于基因列表的快速生物學解釋14519205Easyfig基因組比較可視化，創(chuàng)建多個基因組位點的線性比較圖形21278367EMBOSS歐洲分子生物學序列分析開放軟件套件12002227EnzymeTracker一個開源的樣品跟蹤實驗室信息管理系統(tǒng)22280360Eoulsan一個促進高通量測序分析的基于云計算的框架22492314ESBTL用于生物大分子結(jié)構(gòu)和幾何分析的高效PDB剖析器和數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)20185407Expander一個整合的基因表達數(shù)據(jù)分析軟件平臺，支持微陣列數(shù)據(jù)分析的所有階段20134430ExpressionPlot一個分析RNASeq和微陣列基因表達數(shù)據(jù)的基于網(wǎng)絡(luò)的框架21797991EZViz用標簽和按鈕簡化PyMOL中分子查看21638731FIMO掃描一個給定motif的出現(xiàn)21330290Flapjack圖示的基因型可視化20956241flowViz一個可視化流式細胞儀數(shù)據(jù)的Bioconductor包18245128FPV使用Java 3D進行快速蛋白質(zhì)可視化12761052FunNet一個探索轉(zhuǎn)錄相互作用的整合工具18799481FX一個云端RNASeq分析工具22257667GaggleBridge協(xié)作的數(shù)據(jù)分析21775306Gap5編輯數(shù)十億的片段序列裝配20513662GBParsy一個高速的GenBank平面文件解析器庫18652706Generic HTMLForm Processor一個保存網(wǎng)絡(luò)收集的數(shù)據(jù)到一個MySQL數(shù)據(jù)庫中的多功能PHP腳本16629305GeneNotes第一個允許用戶收集和管理有關(guān)基因/ESTs的多媒體生物信息的應(yīng)用程序15686593GeneTrack一個基因組數(shù)據(jù)處理和可視化框架18388141GeneTUKit一個文檔水平基因標準化軟件21303863GeneXplorer微陣列數(shù)據(jù)的可視化和分析15458579GenomeView使用動態(tài)導航和語義縮放動態(tài)地瀏覽高容量的比對短片段數(shù)據(jù)22102585GenomeViz可視化微生物基因組15601465Genomorama基因組可視化和分析17570856GenoViewer一個高度用戶友好、易于操作的SAM/BAM查看器和比對器工具22359445GenPlay
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