常見的生物信息學軟件的介紹和文獻依據-全文預覽
【正文】 算結構生物學軟件框架，帶有Python接口20733063NTAPNimbleGen嵌合陣列ChIPchip數據分析19468055NGSView一個開源、可擴展的下一代測序數據編輯器19855106MOF微陣列異常值過濾R函數以輔助不成功陣列的識別19329069miRDeepP一種分析植物中microRNA轉錄組的計算工具21775303MethylAnalyzer一個分析全基因組DNA甲基化數據的Python包21685051Mayday一個微陣列數據分析工作臺16500939MACS基于模型的ChIPSeq峰識別軟件18798982KGMLEDKEGG通路圖的動態(tài)瀏覽和編輯17142815一個RNA二級結構可視化Java工具16220684JColorGrid生物學測量值可視化，繪制熱圖，顏色網格等16640789JalviewJava多重序列比對編輯器14960472interPopula一個訪問HapMap計劃數據集的Python API21210977HilbertVis用希爾伯特曲線來可視化基因組數據19297348graph2tab一個轉換實驗流程圖為表格格式的程序庫22556367GoBean一個GO術語富集可視化探索Java GUI應用程序22360891Genomorama基因組可視化和分析17570856GeneTUKit一個文檔水平基因標準化軟件21303863Generic HTMLFX一個云端RNASeq分析工具22257667Flapjack圖示的基因型可視化20956241Expander一個整合的基因表達數據分析軟件平臺，支持微陣列數據分析的所有階段20134430EMBOSS歐洲分子生物學序列分析開放軟件套件12002227dsrcFASTQ格式中DNA序列片段的壓縮21252073Dendroscope一個交互式大型系統(tǒng)發(fā)生樹查看器18034891Cytoscape ESP使用邏輯操作符和通配符在多屬性領域搜索復雜生物網絡的Cytoscape插件18445605coMOTIF一個識別ChIPseq數據中轉錄因子和共調控motif的混合框架21775309ClutrFree聚類樹可視化與解釋15145813ChIPpeakAnno一個注釋ChIPseq和ChIPchip數據（峰）的Bioconductor包20459804Cerebral一個使用亞細胞定位注釋進行生物網絡布局和交互的Cytoscape插件17309895BugView用于比較基因組的一個瀏覽器，Java編寫14693822BRAT重亞硫酸鹽處理的片段分析工具20031974BisoGenet一個新的基因網絡構建、可視化和分析工具，cytoscape插件20163717BioRuby適用于Ruby編程語言的生物信息學軟件20739307BioCoder一種標準化及自動化生物學實驗方案的編程語言21059251BEST結合位點評估工具套件，整合了4種普遍使用的motif發(fā)現程序15814553Batch BlastarrayQCplot用圖形分析和統(tǒng)計分析檢查微陣列數據質量的軟件16864592ArchTEx下一代測序數據片段的最佳延長及準確提取和可視化22302569一個產生出版質量比對的“所見即所得”蛋白質序列比對編輯器19390156AmiGO訪問本體論和注釋數據19033274Arcadia代謝通路的一個可視化工具，翻譯文本的生物學網絡描述為圖示20453003arrayMagic雙色cDNA微陣列質控和預處理15454413BamTools分析和管理BAM文件的一個C++應用程序接口和工具包21493652BEDTools比較基因組特征的一套靈活的實用程序，支持BED，BAM，GFF格式文件20110278Bio++用于序列分析、系統(tǒng)發(fā)生學、分子進化和群體遺傳學的一套C++庫16594991Biopython適用于計算分子生物學和生物信息學的可免費獲得的python工具19304878Biskitpython編寫的一個結構生物信息學軟件平臺（庫）17237072Bpipe一個運行和管理生物信息學流程的工具22500002BSMAP全基因組重亞硫酸鹽測序比對程序19635165Cent
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