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第八章生物信息學(xué)在基因芯片中的應(yīng)用-文庫(kù)吧

2025-07-17 13:23 本頁(yè)面


【正文】 檢測(cè)目的不同 ,可以把樣品制備方法分為 ? 用于表達(dá)譜測(cè)量的 mRNA樣品制備 ? 用于多態(tài)性 (或突變 )研究的基因樣品的制備 (4)雜交信號(hào)檢測(cè) ? 對(duì)于用熒光素標(biāo)記經(jīng)擴(kuò)增(也可用其他放大技術(shù))的序列或樣品,與芯片上的探針進(jìn)行雜交,然后沖洗,采集熒光圖像。 ? 圖像的采集用落射熒光顯微鏡 或電荷偶聯(lián)裝置照相機(jī) 非共聚焦激光掃描儀等進(jìn)行。 2、基因芯片對(duì)于生物分子信息檢測(cè)的作用和意義 ? 在生命科學(xué)領(lǐng)域中,基因芯片為分子生物學(xué)、生物醫(yī)學(xué)等研究提供了強(qiáng)有力的手段。 ? 利用基因芯片技術(shù),可研究生命體系中不同部位、不同生長(zhǎng)發(fā)育階段的基因表達(dá),比較不同個(gè)體或物種之間的基因表達(dá),比較正常和疾病狀態(tài)下基因及其表達(dá)的差異。 ? 基因芯片技術(shù)也有助于研究不同層次的多基因協(xié)同作用的生命過(guò)程,發(fā)現(xiàn)新的基因功能,研究生物體在進(jìn)化、發(fā)育、遺傳過(guò)程中的規(guī)律。 3、基因芯片研究和應(yīng)用中所涉及到的生物信息學(xué)問(wèn)題 提取什么信息 如何提取信息 如何處理和利用信息 確定芯片檢測(cè)目標(biāo) 芯片設(shè)計(jì) 數(shù)據(jù)管理與分析 探針設(shè)計(jì) 解決雜交條件一致性問(wèn)題 芯片優(yōu)化 提高芯片制備效率 公共 數(shù)據(jù)庫(kù) 專用 數(shù)據(jù)庫(kù) 確定目標(biāo) 選擇待檢測(cè)的目標(biāo)序列 數(shù)據(jù)分析 分析雜交檢測(cè)結(jié)果及可靠性 基因芯片 數(shù)據(jù)庫(kù) 圖像處理 數(shù) 據(jù) 庫(kù) 查 詢 序 列 分 析 生 物 信 息 學(xué) 數(shù) 據(jù) 挖 掘 數(shù) 據(jù) 可 視 化 雜交檢測(cè)圖像 基因芯片數(shù)據(jù)流圖 (2)生物信息學(xué)在基因芯片中的應(yīng)用 ? 生物信息學(xué)在基因芯片中的應(yīng)用主要體現(xiàn)在三個(gè)方面 : ? 確定芯片檢測(cè)目標(biāo) ? 芯片設(shè)計(jì) ? 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)管理與分析 (3)基因芯片研究與應(yīng)用中所要解決的信息學(xué)問(wèn)題 ? 在基因芯片信息學(xué)方面要解決以下幾個(gè)關(guān)鍵的問(wèn)題 : ? 第一是芯片設(shè)計(jì)問(wèn)題 ? 第二是可靠性分析問(wèn)題 ? 第三是數(shù)據(jù)挖掘問(wèn)題 第二節(jié) 基因芯片設(shè)計(jì) 1、基因芯片設(shè)計(jì)的一般性原則 ? 基因芯片設(shè)計(jì)主要包括兩個(gè)方面 : ? (1)探針的設(shè)計(jì) ? 指如何選擇芯片上的探針 ? (2)探針在芯片上的布局 ? 指如何將探針排布在芯片上。 ? 確定芯片所要檢測(cè)的目標(biāo)對(duì)象 ?查詢生物分子數(shù)據(jù)庫(kù) 取得相應(yīng)的 DNA序列數(shù)據(jù) ? 序列對(duì)比分析 找出特征序列,作為芯片設(shè)計(jì)的參照序列。 ? 數(shù)據(jù)庫(kù)搜索 ?
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