第八章生物信息學在基因芯片中的應用-文庫吧
2025-07-17 13:23 本頁面
【正文】 檢測目的不同 ,可以把樣品制備方法分為 ? 用于表達譜測量的 mRNA樣品制備 ? 用于多態(tài)性 (或突變 )研究的基因樣品的制備 （４）雜交信號檢測 ? 對于用熒光素標記經(jīng)擴增（也可用其他放大技術(shù)）的序列或樣品，與芯片上的探針進行雜交，然后沖洗，采集熒光圖像。 ? 圖像的采集用落射熒光顯微鏡 或電荷偶聯(lián)裝置照相機 非共聚焦激光掃描儀等進行。 ２、基因芯片對于生物分子信息檢測的作用和意義 ? 在生命科學領域中，基因芯片為分子生物學、生物醫(yī)學等研究提供了強有力的手段。 ? 利用基因芯片技術(shù)，可研究生命體系中不同部位、不同生長發(fā)育階段的基因表達，比較不同個體或物種之間的基因表達，比較正常和疾病狀態(tài)下基因及其表達的差異。 ? 基因芯片技術(shù)也有助于研究不同層次的多基因協(xié)同作用的生命過程，發(fā)現(xiàn)新的基因功能，研究生物體在進化、發(fā)育、遺傳過程中的規(guī)律。 ３、基因芯片研究和應用中所涉及到的生物信息學問題 提取什么信息 如何提取信息 如何處理和利用信息 確定芯片檢測目標 芯片設計 數(shù)據(jù)管理與分析 探針設計 解決雜交條件一致性問題 芯片優(yōu)化 提高芯片制備效率 公共 數(shù)據(jù)庫 專用 數(shù)據(jù)庫 確定目標 選擇待檢測的目標序列 數(shù)據(jù)分析 分析雜交檢測結(jié)果及可靠性 基因芯片 數(shù)據(jù)庫 圖像處理 數(shù) 據(jù) 庫 查 詢 序 列 分 析 生 物 信 息 學 數(shù) 據(jù) 挖 掘 數(shù) 據(jù) 可 視 化 雜交檢測圖像 基因芯片數(shù)據(jù)流圖 （２）生物信息學在基因芯片中的應用 ? 生物信息學在基因芯片中的應用主要體現(xiàn)在三個方面 : ? 確定芯片檢測目標 ? 芯片設計 ? 實驗數(shù)據(jù)管理與分析 （３）基因芯片研究與應用中所要解決的信息學問題 ? 在基因芯片信息學方面要解決以下幾個關(guān)鍵的問題 : ? 第一是芯片設計問題 ? 第二是可靠性分析問題 ? 第三是數(shù)據(jù)挖掘問題 第二節(jié) 基因芯片設計 １、基因芯片設計的一般性原則 ? 基因芯片設計主要包括兩個方面 : ? (1)探針的設計 ? 指如何選擇芯片上的探針 ? (2)探針在芯片上的布局 ? 指如何將探針排布在芯片上。 ? 確定芯片所要檢測的目標對象 ?查詢生物分子數(shù)據(jù)庫 取得相應的 DNA序列數(shù)據(jù) ? 序列對比分析 找出特征序列，作為芯片設計的參照序列。 ? 數(shù)據(jù)庫搜索 ?
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