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rclimdex中文用戶手冊-在線瀏覽

2024-08-09 09:10本頁面
  

【正文】 致 謝 RClimDex 由Xuebin Zhang(張學(xué)斌)and Feng Yang(加拿大氣象局氣候研究部)開發(fā)與維護(hù),最初的開發(fā)由加拿大國際發(fā)展辦事處通過《加中氣候協(xié)作項(xiàng)目,C5》資助。Lisa Alexander, Francis Zwiers, Byron Gleason, David Stephenson, Albert Klan Tank, Mark New, Lucie Vincent與Tom Peterson對(duì)R包的開發(fā)與測試作出了重要貢獻(xiàn)。. 譯者的話原英文說明中所介紹的下載網(wǎng)址鏈接已無效,新網(wǎng)址包括RClimdex可計(jì)算極端氣候指數(shù)27項(xiàng),以下摘錄來自一碩士論文《內(nèi)蒙古地區(qū)極端氣候事件時(shí)空變化及其與NDVI的相關(guān)性》(使用RClimdex軟件)的15項(xiàng)指數(shù)名稱翻譯及一段簡要說明。由于研究的氣象記錄年限跨度很大,難免有些記錄值缺測。檢驗(yàn)處理主要涉及幾個(gè)方面的錯(cuò)誤記錄檢查:(1)日最低溫日最高溫(2)日降水量0mm(3)記錄值嚴(yán)重偏離本地區(qū)氣象實(shí)際情況,即超出3 倍標(biāo)準(zhǔn)差的值定義為出界值,通過人工檢查同相鄰站點(diǎn)的記錄進(jìn)行比對(duì),合理的保留,不合理的按缺測進(jìn)行處理。 目錄1. 簡介2. R語言安裝 How to install R How to run R3. 如何使用RClimDex? RClimDex的加載與使用 數(shù)據(jù)質(zhì)量控制 指數(shù)計(jì)算4. 已知的bugs5. Bug報(bào)告Appendix A: 氣候指數(shù)列表Appendix B: 輸入數(shù)據(jù)格式Appendix C: 指數(shù)定義Appendix D: Threshold and inbase period temperature indices calculationAppendix E: R for Windows FAQ 1. 介紹加拿大氣象研究中心的Xuebin Zhang(張學(xué)斌,華人)與Feng Yang 開發(fā)的RClimDex()是對(duì)ClimDex軟件(由加拿大國家氣候數(shù)據(jù)中心的Byron Gleason開發(fā))的R語言改寫與改進(jìn)。ClimDex是以Excel為基礎(chǔ)的程序,意在提供容易使用的軟件包用于計(jì)算監(jiān)測氣候變化的氣候極值。ClimDex項(xiàng)目軟件開發(fā)之初就強(qiáng)調(diào)運(yùn)行環(huán)境不依賴于特定的操作系統(tǒng)。它既可運(yùn)行于Windows 系統(tǒng),也可運(yùn)行于Unix系統(tǒng)。RClimDex ()有著比較友好的操作界面,計(jì)算由CCl/CLIVAR推薦及可由用戶定義門檻值的重要極端氣候指數(shù)27 種,包括16 個(gè)極端溫度指數(shù)和11 個(gè)極端降水指數(shù),這27 個(gè)極端氣候指數(shù)都是世界氣象組織氣候委員會(huì)推薦使用的核心極端氣候指數(shù),已包括了ClimDex (Version )中的幾乎全部指數(shù)。開發(fā)極端氣候指數(shù)軟件的目的之一是用于氣候監(jiān)測研究,這要求各項(xiàng)指數(shù)必須均一化(一致化)。當(dāng)前的RClimDex版只包括一個(gè)簡單的數(shù)據(jù)質(zhì)量控制程序,由ClimDex計(jì)劃(譯者注:ClimDex是一個(gè)專門的計(jì)劃,有專門的網(wǎng)站。 對(duì)于ClimDex的用戶,我們希望,在計(jì)算極端指數(shù)前已進(jìn)行數(shù)據(jù)質(zhì)量控制。2. R語言的安裝與運(yùn)行(譯者注:很方便,幾乎不需要設(shè)置,一路點(diǎn)擊即可)R is a language and environment for statistical puting and graphics. It is a GNU implementation of the S language developed by John Chambers and colleagues at Bell Laboratories (formerly ATamp。R的安裝過程非常簡單:1) 登錄網(wǎng)站 , 2) Follow the links to download the most recent version of R for your puter operating system from any mirror site of CRAN. 對(duì)于Microsoft Windows (95, 98, 2000, and XP)系統(tǒng),下載 Windows版安裝程序 。TclTk程序已包含在R 。第一次使用時(shí)你可能需要配置稱做“HOME”的環(huán)境變量。在unix 環(huán)境下,直接在 R程序界面運(yùn)行。在Windows系統(tǒng)下,還可以選擇 “File”菜單然后點(diǎn)擊 “Exit”選項(xiàng)。在RGui菜單下選 “File” ,再選 “Source R code”。 “”下,輸入源文件(R包)名稱:source(“”)。這將加載RClimDex。為便利用戶使用作了調(diào)換。RClimDex質(zhì)量控制模塊執(zhí)行如下功能: 1) 用R語言認(rèn)可的數(shù)據(jù)格式代替缺失值 (), 如用“NA”表示“不可得”;2) 用“NA”代替所有的不合理值。此外,質(zhì)量控制模塊還能識(shí)別日最大氣溫與日最大氣溫的離群值(不正常值)。 當(dāng)前,這個(gè)區(qū)域被定義為均值177。std表示日特征值的標(biāo)準(zhǔn)差 , n 表示一個(gè)用戶的輸入,mean(均值) 表示氣候特征的日值。用戶能夠選取用于計(jì)算極端指數(shù)的氣候數(shù)據(jù)文件。文件中數(shù)值格式應(yīng)該符合附錄B的要求。 數(shù)據(jù)加載成功之后,一個(gè)彈出窗口出現(xiàn)。這通常是由于輸入格式有誤。 不合理的值將被自動(dòng)識(shí)別,但離群值需要用戶進(jìn)行確認(rèn)。因?yàn)?可能標(biāo)志(flag)著一個(gè)很大的數(shù)值,用戶可能希望設(shè)定為4。譯者注:此處n表示原始?xì)庀髷?shù)據(jù)序列的標(biāo)準(zhǔn)差。如果發(fā)現(xiàn)不合理值,將會(huì)出現(xiàn)彈出窗口。 如果在日降水量中出現(xiàn)負(fù)值 () ,將會(huì)出現(xiàn)以下窗口: 如果有離群值出現(xiàn),將出現(xiàn)以下窗口。如果出現(xiàn)離群值。同時(shí),4個(gè)Excel文件: “”, “”, “”, and “” 將建立在一個(gè)名為log 的子目錄中。最后一個(gè)文件包含著數(shù)據(jù)控制模塊的信息,并將用于指數(shù)的計(jì)算。 為了可視化,4個(gè) 用于日最高、最低氣溫、日降水時(shí)間序列范圍繪圖的PDF文檔 (缺失值被標(biāo)為紅點(diǎn)) 放置在log目錄之中。文件 “” 可以用Windows 系統(tǒng)下的Excel 軟件或Unix系統(tǒng)下的編輯器進(jìn)行修改。 注意:指數(shù)采用數(shù)據(jù)質(zhì)量控制后的數(shù)據(jù)進(jìn)行計(jì)算。譯者注:,用戶可以查看或修改。系統(tǒng)自動(dòng)生成一個(gè)校核過的新數(shù)據(jù)文件進(jìn)行后續(xù)處理,并不直接使用原始數(shù)據(jù)文件)因此,用戶想要修改原始數(shù)據(jù)文件以改正錯(cuò)誤值的話,應(yīng)當(dāng)重新加載數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)質(zhì)量控制模塊也需要再次運(yùn)行。 在主菜單中選擇值“計(jì)算指數(shù)(Indices Calculation)”之后,用戶被要求設(shè)置某些參數(shù)?!坝脩舳x的日最高限值(User defined Upper Limit of Day High)”用于計(jì)算日最高氣溫高于門檻值時(shí)的持續(xù)日數(shù)。 “用戶定義的日低值上限(User defined Upper Limit of Day Low)” 用于計(jì)算日最低氣溫超過該值時(shí)的持續(xù)日數(shù)。這些指數(shù)分別被稱作SUmm、FDmm、TRmm、IDmm, “mm”對(duì)應(yīng)于用戶定義的值。采用默認(rèn)設(shè)置不作改動(dòng)可以運(yùn)行,但具體影響本人尚未深入分析?!?. 已知的差錯(cuò)》提供的一個(gè)補(bǔ)救方法是在觀測數(shù)據(jù)前面增加一個(gè)值()詳見《4. 已知的差錯(cuò)》。這一步完成之后,一個(gè)窗口會(huì)出現(xiàn),允許用戶選擇需要計(jì)算的指數(shù)。 退選不需計(jì)算的指數(shù)項(xiàng)目后,點(diǎn)擊 “OK” 進(jìn)行計(jì)算。譯者注:在調(diào)試過程中,為節(jié)約運(yùn)算時(shí)間可退選暫不需要計(jì)算的項(xiàng)目。需要計(jì)算的指數(shù)運(yùn)算完成之后 ,出現(xiàn)一個(gè)彈出窗口。指數(shù)結(jié)果文件名稱類似 “”, XXX表示指數(shù)的名稱??紤]可視化需要,繪制了年序列、趨勢(最小線性二乘法solid line,locally weighted linear regression (dashed line))的圖形,線性回歸的趨勢擬合也進(jìn)行了繪制。 譯者注:提示窗口僅標(biāo)出了plots目錄,其他結(jié)果文件也在相應(yīng)目錄之中。對(duì)于其他站點(diǎn),選擇“數(shù)據(jù)質(zhì)量控制模塊(Data QC)”、重復(fù)上述的同樣過程。 4. 已知的差錯(cuò)在RClimDex本版以及此前版本中有一個(gè)已知的差錯(cuò)。產(chǎn)生這個(gè)差錯(cuò)的原因之一是氣溫百分比指數(shù)計(jì)算中需要一個(gè)基期以外的數(shù)據(jù)。CDaysSU25Summer daysAnnual count when TX(daily maximum)25186。CDaysTR20Tropical nightsAnnual count when TN(daily minimum)20186。C and first span after July 1 (January 1 in SH) of 6 days with
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