【正文】 默復(fù)合體（RISC）→識(shí)別與siRNA有同源序列的mRNA，并在特異的位點(diǎn)將該mRNA切斷。單鏈、雙鏈和逆轉(zhuǎn)錄病毒第二章 染色質(zhì)、染色體、基因和基因組染色質(zhì)(chromatin) ：是指細(xì)胞周期間期細(xì)胞核內(nèi)由DNA、組蛋白、非組蛋白和少量RNA組成的復(fù)合結(jié)構(gòu)染色體(chromosome)：是指在細(xì)胞分裂期出現(xiàn)的一種能被堿性染料強(qiáng)烈染色，并具有一定形態(tài)、結(jié)構(gòu)特征的物體。2★著絲粒：兩條染色單體相連處染色較淺向內(nèi)凹陷的縊痕（主縊痕）3副縊痕：染色體臂上狹窄淺染的縊縮的部分4隨體：位于染色體末端的球形染色體節(jié)段5核仁組織區(qū) ：是核糖體RNA基因所在的區(qū)域，位于副縊痕區(qū) 6復(fù)制子與復(fù)制起始點(diǎn)：7★端粒 （telomere）：由端粒DNA與端粒結(jié)合蛋白形成的、染色體端部的特化部分。(2)蛋白質(zhì)組蛋白(histone)：呈堿性，結(jié)構(gòu)穩(wěn)定；與DNA結(jié)合形成、維持染色質(zhì)結(jié)構(gòu)，與DNA含量呈一定的比例非組蛋白：呈酸性，種類和含量不穩(wěn)定；作用還不完全清楚，可能與染色質(zhì)結(jié)構(gòu)調(diào)節(jié)有關(guān)，在DNA遺傳信息的表達(dá)中有重要作用(3)少量的RNA脫氧核糖核酸(DNA)1非重復(fù)序列：一個(gè)基因組中只有一個(gè)拷貝，是編碼蛋白質(zhì)和酶的結(jié)構(gòu)基因2輕度重復(fù)序列：一個(gè)基因組中有210個(gè)拷貝的序列3中度重復(fù)序列：重復(fù)數(shù)十至數(shù)萬（105）次的重復(fù)順序 ，在基因組中所占比例在不同種屬之間差異很大，一般約占1040。4高度重復(fù)序列：在基因組中重復(fù)頻率高，可達(dá)百萬(106)以上 ，不轉(zhuǎn)錄，多位于著絲粒處，是異染色質(zhì)組分，可能與染色體穩(wěn)定有關(guān)。染色體畸變 是因?yàn)橄忍煨匀旧w數(shù)目異?；颍ê停┙Y(jié)構(gòu)畸變數(shù)目畸變：整倍體 ：增加或減少整套的染色體 ① 多倍體 ② 三倍體非整倍體：增加或減少一條或幾條染色體 ①缺體 ②單體 ③三體 是DNA長(zhǎng)鏈上一個(gè)由特定核苷酸組成并具有特定遺傳功能的片段，包括編碼蛋白質(zhì)或RNA的核酸序列和調(diào)控序列。一個(gè)順反子決定一條多肽鏈 2重疊基因：是指兩個(gè)或兩個(gè)以上的基因共有一段DNA序列，或是指一段DNA序列成為兩個(gè)或兩個(gè)以上基因的組成部分。5癌基因:人類或其他動(dòng)物細(xì)胞（以及致癌病毒）固有的一類基因，又稱轉(zhuǎn)化基因。 ★原核生物基因組特征1基因組通常僅由一條雙鏈DNA組成。②衛(wèi)星DNA：一般較短，采用密度梯度離心后，分布于DNA主帶的旁邊，參與復(fù)制水平的調(diào)節(jié)、表達(dá)的調(diào)控、參與染色體配對(duì)中度重復(fù)序列：重復(fù)次數(shù)在10～105，散布于基因組中。 ★轉(zhuǎn)座子的共同特點(diǎn)1都有一個(gè)保守結(jié)構(gòu)，有一個(gè)或多個(gè)ORF，兩端有末端反向重復(fù)序列2轉(zhuǎn)座后靶位點(diǎn)呈現(xiàn)正向重復(fù)3編碼與轉(zhuǎn)座有關(guān)的蛋白4可以在基因組中移動(dòng) 轉(zhuǎn)座子的分類1 DNADNA方式轉(zhuǎn)座：通過DNA復(fù)制或直接切除兩種方式獲得可移動(dòng)片段，重新插入基因組DNA中2逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座：由RNA介導(dǎo)轉(zhuǎn)座的轉(zhuǎn)座元件。通過轉(zhuǎn)錄合成mRNA，再逆轉(zhuǎn)錄合成新的元件整合到基因組中完成轉(zhuǎn)座 轉(zhuǎn)座子的分類和結(jié)構(gòu)特征1插入序列( insertion sequence，IS):最簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)座子，不含有任何宿主基因 （1）含短的末端反向重復(fù)序列。 （3）靶位點(diǎn)存在 59 bp 的短正向重復(fù)序列 （4）作為一個(gè)整體進(jìn)行轉(zhuǎn)座2復(fù)合轉(zhuǎn)座子 (Composite transposon)：包含有轉(zhuǎn)座非必需基因的中央?yún)^(qū)和兩側(cè)兩個(gè)IS (1)中間區(qū)域含編碼轉(zhuǎn)座酶以外的標(biāo)記基因； (2)兩端具有插入序列； (3)兩末端是反向重復(fù)序列； (4)靶位點(diǎn)存在短正向重復(fù)序列 (5)可以作為一個(gè)整體進(jìn)行轉(zhuǎn)座；含有的一個(gè)或兩個(gè)IS元件也可進(jìn)行單獨(dú)轉(zhuǎn)座 （transposon A, Tn A）長(zhǎng)約5kb左右，兩端具有ITR，而不是IS，中部的編碼區(qū)不僅編碼抗性標(biāo)記，還編碼轉(zhuǎn)座酶和解離酶：以溶菌和溶源周期性交替生長(zhǎng)的溫和噬菌體①含有與轉(zhuǎn)座有關(guān)的基因和反向重復(fù)序列 ②能夠整合進(jìn)寄主染色體，催化一系列染色體的重新排列 轉(zhuǎn)座作用的機(jī)制1增殖：在基因組中增加轉(zhuǎn)座因子的拷貝數(shù)2步驟： ①供體剪切：使轉(zhuǎn)座因子從宿主DNA中分離出來 ②鏈交換：轉(zhuǎn)座酶催化使轉(zhuǎn)座子與靶位點(diǎn)相連 ③修復(fù)：以DNA合成反應(yīng)填補(bǔ)缺口3靶位點(diǎn)的重復(fù)制：修復(fù)缺口的同時(shí)產(chǎn)生同向重復(fù)序列 轉(zhuǎn)座的三種類型知道1復(fù)制型轉(zhuǎn)座(replicative transposition)①轉(zhuǎn)座因子在轉(zhuǎn)座期間先復(fù)制一份拷貝，而后拷貝轉(zhuǎn)座到新的位置，在原先的位置上仍然保留原來的轉(zhuǎn)座因子 ②有轉(zhuǎn)座酶和解離酶的參與 2非復(fù)制型轉(zhuǎn)座(Nonreplicative transposition)①轉(zhuǎn)座因子直接從原來位置上轉(zhuǎn)座插入新的位置，并留在插入位置上②轉(zhuǎn)座只需轉(zhuǎn)座酶的作用。3保守型轉(zhuǎn)座(Conservative transposition)①非復(fù)制轉(zhuǎn)座的一種 ②類似于入噬菌體的整合作用,轉(zhuǎn)座因子都比較大③轉(zhuǎn)座的往往不只是轉(zhuǎn)座因子自身，而是連同宿主的一部分DNA一起轉(zhuǎn)座 ④轉(zhuǎn)座子從供體上切下然后插入靶位點(diǎn)，供體恢復(fù)原狀 逆轉(zhuǎn)錄病毒和逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子1逆轉(zhuǎn)錄病毒—RNA病毒。但不能以自由感染的方式進(jìn)行傳播 2非LTR反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子 ：包括LINES 和SINE 等。 1 F質(zhì)粒：攜帶有負(fù)責(zé)接合轉(zhuǎn)移的基因即編碼形成性纖毛的基因和 DNA 復(fù)制的基因 2 R質(zhì)粒(resistant plasmid )：由決定抗性轉(zhuǎn)移因子的DNA和決定抗性因子的DNA做成，含有對(duì)抗生素的抗性基因又稱抗藥性質(zhì)粒。：復(fù)制是從DNA分子上的特定部位開始的，這一部位叫做復(fù)制起點(diǎn)(ori ) ★：DNA復(fù)制從起始點(diǎn)開始直到終點(diǎn)為止，每個(gè)這樣的DNA單位稱為復(fù)制子 ：DNA分子復(fù)制是復(fù)制起始點(diǎn)兩條鏈解開成單鏈，分別做模板各自合成其互補(bǔ)鏈所形成的Y形結(jié)構(gòu)：①雙向復(fù)制：從原點(diǎn)開始在兩個(gè)方向各有一個(gè)復(fù)制叉在延伸，直至與臨近的復(fù)制叉匯合②單向復(fù)制：：①環(huán)狀DNA復(fù)制終點(diǎn)：兩個(gè)復(fù)制叉進(jìn)行到特殊的終止位點(diǎn)復(fù)制終止?！?39?！?39。岡崎片段：DNA合成過程中，后隨鏈的合成是不連續(xù)的進(jìn)行的，先合成許多片段，最后各段再連接成為一條長(zhǎng)鏈，這些小的片段稱為岡崎片段原核生物的DNA復(fù)制★復(fù)制原點(diǎn)(Ori C) ⑴245bp的DNA序列 ⑵富含AT ⑶3個(gè)13聚體的回文結(jié)構(gòu) ⑷4個(gè)9聚體的重復(fù)序列⑸重復(fù)序列緊鄰啟動(dòng)子 ⑹起到轉(zhuǎn)錄激活作用 復(fù)制的延伸★1. 先導(dǎo)鏈(leading strand) 合成：以3’ →5’親本鏈為模板，由引發(fā)體合成引物，DNA聚合酶Ⅲ催化以5’→3’合成一條完整的新鏈★2．后隨鏈(lagging strand) 合成：引物RNA合成→DNA pol Ⅲ→合成岡崎片段→ DNA pol I切除岡崎片段上的RNA引物→由DNA連接酶連接兩個(gè)岡崎片段→形成完整的DNA后隨鏈 DNA復(fù)制的終止 DNA具有終止位點(diǎn)(ter)，與蛋白質(zhì)Tus結(jié)合，阻止解鏈酶活性而終止復(fù)制真核生物DNA復(fù)制的特點(diǎn)1．DNA復(fù)制時(shí)要克服核小體結(jié)構(gòu)的空間阻礙，復(fù)制叉前進(jìn)速度慢2．真核生物多起點(diǎn)復(fù)制3．自主復(fù)制序列(ARS)，核心序列為： 5′ATTTATRTTA3′4．DNA聚合酶有5種，分別負(fù)責(zé)先導(dǎo)鏈和后隨鏈的合成5．真核細(xì)胞內(nèi)引物酶與polA緊密偶聯(lián)，原核細(xì)胞引發(fā)酶和解旋酶偶聯(lián)在一起形成復(fù)制體的一部分6．真核細(xì)胞的復(fù)制起始點(diǎn)和復(fù)制子的大小在不同的發(fā)育時(shí)期會(huì)發(fā)生改變7．真核生物在完成全部復(fù)制之前，各個(gè)起始點(diǎn)上DNA的復(fù)制不能再開始；8．DNA的延長(zhǎng)取決于增殖細(xì)胞核抗原(PCNA) 真核細(xì)胞DNA復(fù)制的終止真核細(xì)胞DNA末端的復(fù)制即端粒結(jié)構(gòu)的形成端粒是一段DNA序列和蛋白質(zhì)形成的復(fù)合體端粒DNA由多個(gè)串聯(lián)的58bp寡核苷酸序列組成端粒DNA的合成1端粒酶是反轉(zhuǎn)錄酶，由蛋白質(zhì)和RNA兩部分組成，它以自身的RNA為模板，在后隨鏈模板DNA的3’OH末端延長(zhǎng)DNA2再以這種延長(zhǎng)的DNA為模板，繼續(xù)合成后隨連形成端粒結(jié)構(gòu)★端粒的功能和特點(diǎn)1保證線性DNA的完整復(fù)制2保護(hù)染色體末端不受核酸酶水解和不發(fā)生染色體的異常重組3體細(xì)胞端粒酶活性低4隨著復(fù)制次數(shù)的增加端粒DNA逐步縮短，細(xì)胞組建停止分裂，進(jìn)而進(jìn)入凋亡5惡性腫瘤細(xì)胞可表達(dá)端粒酶，永生分裂單鏈環(huán)狀DNA的復(fù)制φX174噬菌體由一個(gè)單鏈環(huán)狀DNA組成，這條鏈稱為正（+）鏈；合成的互補(bǔ)鏈稱為負(fù)（一）鏈。點(diǎn)突變分轉(zhuǎn)換和顛換兩種形式。引起該位點(diǎn)以后的遺傳信息出現(xiàn)異常?！镌颍篋NA復(fù)制錯(cuò)誤、DNA自發(fā)的化學(xué)改變、堿基的互變異構(gòu)體導(dǎo)致錯(cuò)配、氧化作用損傷堿基2誘發(fā)突變（induced mutation): 特定的化學(xué)或物理因素引起的DNA序列改變。復(fù)制后DNA在短期內(nèi)（數(shù)分鐘）為半甲基化的GATC序列，一旦發(fā)現(xiàn)錯(cuò)配堿基，即將未甲基化鏈切除一段包含錯(cuò)誤堿基的序列，并以甲基化的鏈為模板進(jìn)行修復(fù)2損傷修復(fù) ①光復(fù)活修復(fù) ②甲基轉(zhuǎn)移酶 ③切除修復(fù)3復(fù)制后修復(fù) (postreplication repair)①大腸桿菌的重組修復(fù)系統(tǒng)②SOS修復(fù)：DNA分子受損傷的范圍較大，在復(fù)制受到抑制時(shí)出現(xiàn)的一種應(yīng)急修復(fù)作用 第五章 轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后加工★轉(zhuǎn)錄:生物體以DNA為模板,在RNA聚合酶催化下合成互補(bǔ)的RNA分子的過程轉(zhuǎn)錄單位(transcription unit):從啟動(dòng)子到終止子，被轉(zhuǎn)錄成單個(gè)RNA分子的一段DNA序列★復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的相同點(diǎn)1都以DNA為模板2原料為核苷酸3合成方向均為5′→3′方向4都需要依賴DNA的聚合酶5遵守堿基互補(bǔ)配對(duì)規(guī)律6產(chǎn)物為多聚核苷酸鏈★復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的區(qū)別作為RNA合成模板的鏈稱為反意義鏈(模板鏈/負(fù)鏈)；與其互補(bǔ)的鏈稱有意義鏈(編碼鏈/正鏈)原核生物RNA聚合酶(RNA polymerase )全酶 = 核心酶（α2ββ’）+ σ因子1, α亞基決定轉(zhuǎn)錄的基因2, β亞基在5’ →3’方向上延長(zhǎng)多核苷酸鏈3, β’亞基結(jié)合DNA模板4, σ因子識(shí)別“啟動(dòng)子”并與之結(jié)合真核的RNA聚合酶酶轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物鵝膏蕈堿敏感性RNA聚合酶Ⅰ大部分rRNA不敏感RNA聚合酶ⅡhnRNA 敏感RNA聚合酶ⅢtRNA、5srRNA 、snRNA前體中度敏感★啟動(dòng)子：RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合并起始轉(zhuǎn)錄的一段高度保守性DNA序列★原核生物啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)216。 35區(qū)：TTGACA區(qū)，與RNA聚合酶的σ因子相互識(shí)別35 和10區(qū)域之間的間隔17bp最佳。2．由170 ～ 107位序列組成，稱為上游調(diào)控元件，能有效地增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄效率3．轉(zhuǎn)錄成rRNA RNA聚合酶Ⅲ啟動(dòng)子、tRNA和某些snRNA2 .5S rRNA和tRNA基因的啟動(dòng)子是內(nèi)部啟動(dòng)子(internal promoter)位于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的下游 ，都由兩部分組成，位于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子1 起始子：轉(zhuǎn)錄起始的第一個(gè)堿基多為A,兩側(cè)各有若干嘧啶核苷酸2 TATA box： 25~ 35區(qū)含TATA序列，是轉(zhuǎn)錄因子與DNA分子結(jié)合的部位，使轉(zhuǎn)錄精確地起始 3 CAAT 框：70 ~ 80區(qū)含CCAAT序列，控制轉(zhuǎn)錄起始的頻率 4 GC box：80 ~ 110區(qū)含有GCCACCC或GGGCGGG序列，控制轉(zhuǎn)錄起始的頻率增強(qiáng)子(enhancer)：使和它相連鎖的基因轉(zhuǎn)錄頻率明顯增加的DNA序列①增強(qiáng)效應(yīng)明顯但與位置和取向無關(guān)②核心序列：TGTGGGTTTGG ③沒有基因?qū)Ｒ恍缘袊?yán)密的組織和細(xì)胞特異性④許多增強(qiáng)子還受外部信號(hào)的調(diào)控終止子(terminator) ：DNA分子中終止轉(zhuǎn)錄的核苷酸序列 ?！镌撕驼婧松镛D(zhuǎn)錄啟動(dòng)子的比較1原核啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)類型少，真核生物每種類型的RNA聚合酶均有自己的啟動(dòng)子2原核啟