【正文】 點(diǎn)的下游，都由兩部分組成。 ? 由 RNA聚合酶 II負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄的 II類基因包括所有蛋白質(zhì)編碼基因和部分snRNA基因，后者的啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)與 III類基因啟動(dòng)子中的第三種類型相似，編碼蛋白質(zhì)的 II類基因啟動(dòng)子在結(jié)構(gòu)上有共同的保守序列。這個(gè)區(qū)域被稱為起始子（ initiator， Inr），序列可表示為 Py2CAPy5。僅由 Inr元件組成的啟動(dòng)子是具有可被 RNA聚合酶 II識別的最簡單啟動(dòng)子形式。 TATA盒存在于所有真核生物中， TATA盒是一個(gè)保守的七堿基對，其序列為： ? 也有一些 II類啟動(dòng)子不含有 TATA盒，這樣的啟動(dòng)子稱為無 TATA盒啟動(dòng)子。作為基因表達(dá)的重要調(diào)節(jié)元件，增強(qiáng)子通常具有下列性質(zhì)： 增強(qiáng)效應(yīng)十分明顯，一般能使基因轉(zhuǎn)錄頻率增加 10200倍。→339?！?39。其內(nèi)部常含有一個(gè)核心序列：（ G） TGGA/TA/TA/T（ G），是產(chǎn)生增強(qiáng)效應(yīng)時(shí)所必需的； 增強(qiáng)效應(yīng)有嚴(yán)密的組織和細(xì)胞特異性，說明只有特定的蛋白質(zhì)（轉(zhuǎn)錄因子）參與才能發(fā)揮其功能； 沒有基因?qū)Ｒ恍?，可以在不同的基因組合上表現(xiàn)增強(qiáng)效應(yīng)； 許多增強(qiáng)子還受外部信號的調(diào)控，如金屬硫蛋白的基因啟動(dòng)區(qū)上游所帶的增強(qiáng)子，就可以對環(huán)境中的鋅、鎘濃度做出反應(yīng)。第二種認(rèn)為，增強(qiáng)子能改變?nèi)旧|(zhì)的構(gòu)象。 ? 增強(qiáng)子的功能是可以累加的。因此，要使一個(gè)增強(qiáng)子失活必須在多個(gè)位點(diǎn)上造成突變。 ? 四、 反式作用因子對轉(zhuǎn)錄的影響 真核生物啟動(dòng)子和增強(qiáng)子是由若干可以區(qū)分的 DNA序列組成的，由于它們和特定的功能基因連鎖在一起，因此稱為順式作用元件。一般認(rèn)為，如果某個(gè)蛋白是體外轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)中起始 RNA合成所必需的，它就是轉(zhuǎn)錄復(fù)合體的一部分。 ② 與轉(zhuǎn)錄的起始或終止有關(guān)的輔助因子，也不具有基因特異性。它們中有些被認(rèn)為是轉(zhuǎn)錄復(fù)合體的一部分，因?yàn)樗谢虼蟛糠只虻膯?dòng)子區(qū)含有這一特異序列，如 TATA區(qū)和 TFIID，更多的則是基因或啟動(dòng)子特異性結(jié)合調(diào)控蛋白，它們是起始某個(gè)（類）基因轉(zhuǎn)錄所必需的。是最早發(fā)現(xiàn)于原核生物中的一個(gè)關(guān)鍵因子，該結(jié)構(gòu)域長約 20個(gè) aa，主要是兩個(gè) α螺旋區(qū)和將其隔開的 β轉(zhuǎn)角。 ? b. Zinc finger（鋅指）。與 Zinc結(jié)合后鋅指結(jié)構(gòu)較穩(wěn)定。主要與 DNA大溝相結(jié)合。每隔 6個(gè)殘基出現(xiàn)一個(gè)亮氨酸。 ? e. 堿性螺旋 環(huán) 螺旋（ basic helixloophelix） 該調(diào)控區(qū)長約 50個(gè) aa殘基，同時(shí)具有 DNA結(jié)合和形成蛋白質(zhì)二聚體的功能，其主要特點(diǎn)是可形成兩個(gè)親脂性 α螺旋，兩個(gè)螺旋之間由環(huán)狀結(jié)構(gòu)相連，其DNA結(jié)合功能是由一個(gè)較短的富堿性氨基酸區(qū)所決定的。如GAL4分子中有 2個(gè)這種結(jié)構(gòu)域，分別位于多肽鏈的第 147196位和第 768881位； GCN4的轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域位于多肽鏈的第 106125位。增加激活區(qū)的負(fù)電荷數(shù)能提高激活轉(zhuǎn)錄的水平。 ? b. 谷氨酰胺豐富區(qū) (glutaminerich domain) SP1的 N末端含有 2個(gè)主要的轉(zhuǎn)錄激活區(qū)，氨基酸組成中有 25%的谷氨酰胺，很少有帶電荷的氨基酸殘基。 ? (prolinerich domain) CTF家族（包括 CTF CTF CTF3）的 C末端與其轉(zhuǎn)錄激活功能有關(guān)，含有20%30%的脯氨酸殘基。這一組因子是由單個(gè)基因通過可變換的剪接而形成的一組mRNA產(chǎn)生的。另一組 CAAT區(qū)結(jié)合蛋白被稱為 CP，它們是從人的 HeLa細(xì)胞中得到的。CP族蛋白主要以異源多聚體的形式存在。CBP對序列 GCAAT有較強(qiáng)的親和力，而 ACF則對卵清蛋白基因啟動(dòng)子區(qū)的 CCAAT有高親和力。 ? 對 9個(gè)哺乳動(dòng)物類 β球蛋白基因和 1個(gè)人 α球蛋白基因 539。 ? b. TATA區(qū)結(jié)合蛋白 RNA聚合酶 II需要與其他轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合，才能順利起始轉(zhuǎn)錄。 TBP結(jié)合于 DNA的小溝。 TAFs的加入延伸了對 DNA的覆蓋，整個(gè) TFIID復(fù)合 物可覆蓋 45～ 10區(qū)域。在 SV40啟動(dòng)子區(qū)，從 70～ 110的 6個(gè) GC區(qū)全部與 SP1結(jié)合，所以這個(gè)區(qū)域的 DNA不會(huì)被降解。 GC區(qū)對 SP1的結(jié)合是必需的，但該序列對于SP1親和力卻很不相同，證明 GC區(qū)兩翼序列同樣在 SP1的識別及結(jié)合過程中發(fā)揮作用。 ? d. 八堿基對元件激活蛋白 八堿基對元件也能被多個(gè)激活蛋白識別。 Oct2則是組織特異的激活因子。 ? 五、真核基因轉(zhuǎn)錄后加工的多樣性 1．簡單轉(zhuǎn)錄單位 ? 2. 復(fù)雜轉(zhuǎn)錄單位 含有復(fù)雜轉(zhuǎn)錄單位的主要是一些編碼組織和發(fā)育特異性蛋白質(zhì)的基因，它們除了含有數(shù)量不等的內(nèi)含子以外，其初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物能通過多種不同方式加工成兩個(gè)或兩個(gè)以上的 mRNA。這類基因 539。 3. mRNA穩(wěn)定性控制 ? 真核生物能否長時(shí)間、及時(shí)地利用成熟的 mRNA分子翻譯出蛋白質(zhì)以供生長、發(fā)育的需要，是和 mRNA的穩(wěn)定性以及屏蔽狀態(tài)的解除相關(guān)的。高等真核生物迅速生長的細(xì)胞中 mRNA的半衰期平均 3h。 ? 轉(zhuǎn)運(yùn)鐵蛋白受體（ TfR）和鐵蛋白負(fù)責(zé)鐵吸收和鐵解毒。 IRE與 IRE結(jié)合蛋白（ IREBP）相互作用控制了這兩個(gè) mRNA的翻譯效率。非翻譯區(qū)中的 IRE也與 IREBP特異結(jié)合，有效地阻止了 TfR mRNA的降解，促進(jìn) TfR蛋白的合成?，F(xiàn)已查明，網(wǎng)織紅細(xì)胞蛋白質(zhì)合成的抑制劑 HCI是受氯高鐵血紅素調(diào)節(jié)的 eIF2的激酶，可以使該因子的 α亞基磷酸化并由活性型轉(zhuǎn)變?yōu)榉腔钚孕?。它們與細(xì)胞內(nèi)高度專一的轉(zhuǎn)錄因子相互作用，協(xié)調(diào)相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄。 IKKα、IKKβ及 NEMO（ NFkBessential modifier）抑制 NFkB基因的表達(dá)。將抗體的某些部分與外毒素相連接，就可以把毒素直接送到病變細(xì)胞表面，有效地殺死病變細(xì)胞，保護(hù)健康細(xì)胞。 Nature, 400:781784(1999)。 PNAS， In Press (2020)。 DNA甲基化能關(guān)閉某些基因的活性，去甲基化則誘導(dǎo)了基因的重新活化和表達(dá)。在真核生物中， 5甲基胞嘧啶主要出現(xiàn)在 CpG和 CpXpG中，原核生物中CCA/TGG和 GATC也常被甲基化。前者主要在甲基化母鏈（模板鏈）指導(dǎo)下使處于半甲基化的 DNA雙鏈分子上與甲基胞嘧啶相對應(yīng)的胞嘧啶甲基化。 II類酶活性包括內(nèi)切酶和甲基化酶兩種成分，而 I類和 III類都是雙功能酶，既能將半甲基化 DNA甲基化，又能降解外源無甲基化 DNA。哺乳類基因組中約存在 4萬個(gè) CG islands，大多位于轉(zhuǎn)錄單元的 5?區(qū)。已經(jīng)甲基化的胞嘧啶發(fā)生脫氨基作用 , 它就變?yōu)?T, 無法被區(qū)分。 2．甲基化抑制基因轉(zhuǎn)錄的機(jī)制 甲基化導(dǎo)致某些區(qū)域 DNA構(gòu)象變化，從而影響了蛋白質(zhì)與 DNA的相互作用，抑制了轉(zhuǎn)錄因子與啟動(dòng)區(qū) DNA的結(jié)合效率。當(dāng)這類啟動(dòng)子被增強(qiáng)時(shí)，即使不去甲基化也