【正文】 肝的疫苗。丙肝是25%肝癌患者的致癌因素?？赡艹霈F(xiàn)的急性癥狀包括發(fā)熱、全身乏力、食欲下降、惡心、嘔吐、腹痛、尿色深、大便顏色變淺、關(guān)節(jié)酸痛和黃疸（皮膚和眼白發(fā)黃）。丙肝的潛伏期為兩周至六個(gè)月。目錄丙型肝炎治療藥物研究與設(shè)計(jì)………………………………………………………3以生命周期劃分HCV治療藥物整理………………………………………4HCV的結(jié)構(gòu)………………...……………………………………………4HCV生命周期………………………………………………………...…5以生命周期劃分HCV治療藥物整理…………………………..............6總結(jié)和展望………………………...…………………………..……….13基于NS5A抑制劑的創(chuàng)新藥物設(shè)計(jì)………………………………………14前言..........................................................................................................14NS5A靶點(diǎn)...............................................................................................14NS5A抑制劑研究進(jìn)展...........................................................................15BMS790052(daclatasvir)研究................................................................20創(chuàng)新藥物設(shè)計(jì)..........................................................................................24參考文獻(xiàn)..................................................................................................26TLR7激動(dòng)劑研究與設(shè)計(jì)………………………………………………….29目前已開發(fā)的激動(dòng)劑..............................................................................29咪唑喹啉胺（imidazoquinoline amine）類..................................291取代吡唑啉酮（1Substituted Pyrazolo(3,4C) Ring）類......318氧去氮嘌呤類/咪唑并吡啶酮類............................................328羥基腺嘌呤（8Hydroxyadenine）類......................................36擴(kuò)環(huán)8羥基腺嘌呤類..................................................................57艾沙托立賓（Isatoribine）衍生物類..........................................61Bitriazolyl Acyclonucleoside類...................................................64三氮唑類（Triazole）.................................................................65嘧啶類（Pyrimidine）.................................................................668Substitued Benzoazepines類....................................................68Aminodiazepine類.......................................................................69未來可能的變動(dòng)空間..............................................................................70創(chuàng)新藥物設(shè)計(jì)..........................................................................................71參考文獻(xiàn)..................................................................................................76基于NS5B抑制劑的創(chuàng)新藥物設(shè)計(jì)………………….………...………….79已報(bào)道Sofosbuvir類似物堿性部分結(jié)構(gòu)總結(jié)………………...………79sofosbuvir類似物堿性部分設(shè)計(jì)……………………………………….80丙型肝炎治療藥物研究與設(shè)計(jì)丙肝病毒（HCV）是一種血液傳播病毒，丙型肝炎是由丙肝病毒引起的肝病。HCV有六種基因型，在全球的分布不同（見下圖）。最初被感染后，大約80%的人并不會(huì)出現(xiàn)任何癥狀。大約7585%的新感染者出現(xiàn)慢性肝病，慢性感染者中6070%會(huì)出現(xiàn)慢性肝病，520%會(huì)出現(xiàn)肝硬化，15%會(huì)死于肝硬化或肝癌。每年，有35萬余人死于與丙肝相關(guān)的肝臟疾病。干擾素和利巴韋林抗病毒聯(lián)合療法是目前治療丙肝的主要方法。結(jié)果，雖然一般認(rèn)為丙肝是可以治愈的，但很多人卻未能痊愈。并且，臨床實(shí)踐證明，將多組分、不同機(jī)制的藥物連用的雞尾酒療法的效果最優(yōu)。第一章 以生命周期劃分HCV治療藥物整理為選擇出最具潛力的治療靶點(diǎn)，我們首先對目前已經(jīng)披露的所有HCV治療藥物進(jìn)行了總結(jié)，主要參考了近年的一些文獻(xiàn)，然后按照其對應(yīng)的HCV的生命周期進(jìn)行分類，并對其風(fēng)險(xiǎn)、潛力進(jìn)行簡單打分1。在5′非編碼區(qū)下游緊接一開放的閱讀框（ORF），其中基因組排列順序?yàn)?39。能編碼一長度大約為3014個(gè)氨基酸的多聚蛋白前體，后者可經(jīng)宿主細(xì)胞和病毒自身蛋白酶作用后，裂解成10種病毒蛋白，包括三種結(jié)構(gòu)蛋白，即分子量19KD的核衣殼蛋白（或稱核心蛋白，Core）和兩種糖蛋白（分子量為33KD的E1蛋白，分子量72Kd的E2蛋白），p7編碼一種膜內(nèi)在蛋白，其功能可能是一種離子通道。NS2和NS3具有蛋白酶活性，參與病毒多聚蛋白前體的切割。NS5A是一種磷酸蛋白，可以與多種宿主細(xì)胞蛋白相互作用，對于病毒的復(fù)制起重要作用。圖二、HCV的基因結(jié)構(gòu)二、 HCV生命周期：HCV在體內(nèi)的生命周期可分為以下過程： 病毒進(jìn)入并脫殼，可能涉及LDL受體和粘多糖； 轉(zhuǎn)譯以及加工多聚蛋白NS3/NS4A； HCV RNA復(fù)制，涉及到宿主內(nèi)質(zhì)網(wǎng)以及病毒自身的BS4B，BS5B和NS5A； 病毒組裝和釋放。最后綜合評價(jià)其風(fēng)險(xiǎn)與潛力，對靶點(diǎn)進(jìn)行挑選。途徑/新穎性藥物進(jìn)展備注（靶點(diǎn)等）評價(jià)風(fēng)險(xiǎn)潛力病毒進(jìn)入★★★☆I(lǐng)TX5061phase 2靶點(diǎn)：SRBI避免耐藥問題★★★☆★★★☆、轉(zhuǎn)譯以及加工多聚蛋白。途徑/新穎性藥物進(jìn)展備注（靶點(diǎn)等）評價(jià)風(fēng)險(xiǎn)潛力RNA復(fù)制★★★☆Daclatasvir (BMS790052)Phase 3, NS5A 極其強(qiáng)效?！铩睢睢睢铩铩铩頛edipasvir (GS5885)Phase 3, NS5A★☆☆☆★★★☆GSK2336805Phase 2 Clinical，NS5A★☆☆☆★★★☆A(yù)BT267Phase 3 ClinicalNS5A★☆☆☆★★★☆A(yù)CH3102Phase 2 ClinicalNS5A★☆☆☆★★★☆I(lǐng)DX719Phase 2 ClinicalNS5A★☆☆☆★★★☆MK8742Phase 2 ClinicalNS5A★☆☆☆★★★☆PPI668Phase 2 ClinicalNS5A★☆☆☆★★★☆GS5816Phase 2 ClinicalNS5A★☆☆☆★★★☆A(yù)972338DiscoveryNS5A★★★☆★★☆☆??No Development ReportedNS5A★★★☆★★☆☆、HCV RNA復(fù)制，涉及到宿主內(nèi)質(zhì)網(wǎng)以及病毒自身的BS4B和NS5A。途徑/新穎性藥物進(jìn)展備注（靶點(diǎn)等）評價(jià)風(fēng)險(xiǎn)潛力RNA復(fù)制★★★☆I(lǐng)DX375No Development ReportedNS5B★★★☆★★★☆NesbuvirDiscontinuedNS5BMK0608No Development ReportedNS5BPSI6130DiscontinuedNS5BPSI938Phase 2 ClinicalNS5B★★★☆★★★☆deleobuvirPhase 3 ClinicalNS5B★★★☆★★★☆TegobuvirPhase 2 ClinicalNS5B★★★☆★★★☆、HCV RNA復(fù)制，涉及到宿主內(nèi)質(zhì)網(wǎng)以及病毒自身的BS4B和NS5A。途徑/新穎性藥物進(jìn)展備注（靶點(diǎn)等）評價(jià)風(fēng)險(xiǎn)潛力釋放★★★☆celgosivirPhase 2Glucosidase inhibitors★★★☆★★★☆、其它方式。雖如此，考慮到效價(jià)比、服藥方便性、耐藥突變等因素，還是很多優(yōu)化改進(jìn)之處。其次，丙肝廣泛的基因類型（6種基因型100多亞型）也是一大挑戰(zhàn)，尤其對非核苷類抑制劑以及第一代核苷類NS3NS4A蛋白酶抑制劑以及NS5A抑制劑。但考慮到成本優(yōu)勢，小分子的TLR7激動(dòng)劑也有其價(jià)值。第二章 基于NS5A抑制劑的創(chuàng)新藥物設(shè)計(jì)一、前言：，并且目前針對HCV最理想的治療手段是每周注射INFα并結(jié)合每天兩次口服利巴韋林（RBV）。針對直接抗菌藥物的開發(fā)主要集中在NS3B/NS4A蛋白內(nèi)抑制劑和NS5B RNA依賴的RNA聚合酶抑制劑，但是還需要其他作用機(jī)理的藥物以面對多基因型（6種），多亞型（100多種）的HCV病毒。并且此靶點(diǎn)對小分子調(diào)節(jié)劑及其敏感，BMS790052及其一系列類似物的IC50值（genotype 1b/bovine viral diarrhea virus replicon）達(dá)到皮摩爾級別。BMS0790052等抑制劑的活性雖然達(dá)到較理想水平，然而還存在易被病毒突變逃逸、潛在細(xì)胞毒性、藥代特性等方面問題有待改進(jìn)。此非結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)也參與若干細(xì)胞過程，比如干擾素抵抗以及凋亡調(diào)節(jié)。目前還沒發(fā)現(xiàn)NS5A的酶功能，研究顯示NS5A可能通過與其它的HCV蛋白或宿主細(xì)胞因子相互作用來發(fā)揮功能。區(qū)域二（250342殘基）起著調(diào)節(jié)的功能，比如和蛋白激酶PKR、PI3K以及NS5B相作用，并且，此區(qū)域也包含IFN敏感性決定區(qū)。并且，此組裝作用就是通過區(qū)域里的磷酸化作用調(diào)節(jié)的。而抗NS5A抑制劑的突變位點(diǎn)也在NS5A的氨基端附近，位于蛋白和膜之間，表明抑制劑可能就結(jié)合在二聚體結(jié)合面。區(qū)域一的分子表面，A、C兩圖顯示區(qū)域一的表面電勢，以不同顏色表示，紅色為酸性，白色為中性，藍(lán)色為堿性。圖三、NS5A區(qū)域一的二聚體結(jié)構(gòu)。B）二聚體表面電勢分布。C）NS5A結(jié)構(gòu)相對內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的位置。NS5A抑制劑的代表性化合物是BMS790052，已經(jīng)進(jìn)入3期臨床，結(jié)構(gòu)如下圖，其初步構(gòu)效關(guān)系已被報(bào)道3。目前研發(fā)較深入的NS5A抑制劑總結(jié)見表一，大部分化合物的結(jié)構(gòu)沒有披露，但根據(jù)其專利信息，可以發(fā)現(xiàn)都是BMS790052的結(jié)構(gòu)類似物。D IRELAND5NT四、BMS790052(daclatasvir)研究：、BMS790052部分活性數(shù)據(jù)：表三、代表性NS5A抑制劑BMS790052活性數(shù)據(jù)項(xiàng)目數(shù)值項(xiàng)目數(shù)值HCV replicon (pM) EC50177。t1/2 (min)(HLM)Elimination rate constant (k)Cytotoxicity, CC50 (μM) PBM19Cytotoxicity, CC50 (μM) Vero21Cytotoxicity, CC50 (μM) CEMCLint(μL/min/mg protein)CYP1A2 (μM) IC50100CYP1A2 (μM) IC90100CYP3A4 (μM) IC50177。CYP2C9 (μM) IC90100Resistance MutationsL31 V、BMS790052的結(jié)合位點(diǎn)：BMS790052的結(jié)合位點(diǎn)還未見報(bào)道，但其類似物BMS411的可能結(jié)合位點(diǎn)已被披露4。BMS411與NS5A蛋白二聚體結(jié)合模式預(yù)測圖，黃色棒球部分代表高耐藥突變殘基。 片段I的構(gòu)效關(guān)系3c：片段I被相當(dāng)密集的考察過，在通向BMS790052的道路中，對此部分的考察是通過下面化合物1進(jìn)行的：