【正文】
? 共價(jià)修飾劑是底物的類似物,可專一性地引入酶的活性中心,并具有活潑的化學(xué)基團(tuán) (如鹵素 ),可與活性中心的基團(tuán)形成穩(wěn)定的共價(jià)鍵。 木瓜蛋白酶活性中心氨基酸殘基 4 College of Life Sciences ?酶分子中的氨基酸殘基或其側(cè)鏈基團(tuán)可以分為四類 ? 1.接觸殘基 ? 2.輔助殘基 ? 3.結(jié)構(gòu)殘基 ? 4.非貢獻(xiàn)殘基 5 College of Life Sciences ? (二)酶活性中心中的化學(xué)基團(tuán)的鑒別 ? 1.非特異性共價(jià)修飾: ? 某些化學(xué)試劑能使蛋白質(zhì)中氨基酸殘基的側(cè)鏈基團(tuán)反應(yīng)引起共價(jià)結(jié)合、氧化或還原修飾反應(yīng),使基團(tuán)結(jié)構(gòu)和性質(zhì)發(fā)生變化。 ( 4)酶活性中心的催化位點(diǎn)和結(jié)合位點(diǎn)可以不止一個(gè)。 ( 2)是有一些一級(jí)結(jié)構(gòu)上可能相距較遠(yuǎn)的 氨基酸側(cè)鏈基團(tuán) 組成,有的還包含輔酶或輔基的某一部分基團(tuán)。 結(jié)合部位決定酶的專一性, 催化部位決定酶所催化反應(yīng)的性質(zhì)。College of Life Sciences 第二章 酶學(xué)基礎(chǔ) 1 College of Life Sciences 第一節(jié) 酶的結(jié)構(gòu)與功能 ?一、酶的活性中心 (active center,active site) ? (一)活性中心和必需基團(tuán) ? 與酶活性顯示有關(guān)的,具有結(jié)合和催化底物形成產(chǎn)物的空間區(qū)域,叫 酶的活性中心 ,又叫 活性部位 。 ? 活性中心可分為 結(jié)合部位 和 催化部位 。 2 College of Life Sciences 活性中心外的必需基團(tuán) 催化部位 結(jié)合部位 必需基團(tuán) 活性中心 活性中心外的必需基團(tuán)與維持整個(gè)酶分子的空間構(gòu)象有關(guān) 3 College of Life Sciences 注意: ( 1)活性中心是一個(gè) 三維實(shí)體。 ( 3)在酶分子表面 呈裂縫狀 。 ( 5)酶活性中心的基團(tuán)都是必需基團(tuán),但必需基團(tuán)還包括活性中心以外的基團(tuán)。 ? 如果某基團(tuán)修飾后不引起酶活力的變化,就可初步認(rèn)為此基團(tuán)可能是非必需基團(tuán);反之,如修飾后引起酶活力的降低或喪失,則此基團(tuán)可能是酶的必需基團(tuán)。因其作用機(jī)制是利用酶對(duì)底物類似物的親和性而將酶共價(jià)標(biāo)記的,故稱為親和標(biāo)記。 8 College of Life Sciences ? 4.蛋白質(zhì)工程 ? 這是研究酶必需基閉和活性中心的最先進(jìn)方法,即將酶蛋白相應(yīng)的互補(bǔ) DNA(cDNA)定點(diǎn)突變,此突變的 cDNA表達(dá)出只有一個(gè)或幾個(gè)氨基酸被置換的酶蛋白,再測(cè)定其活性,可以知道被置換的氨基酸是否為活力所必需。 12 ? 胰蛋白酶原 ( trypsinogen)的激活 13 College of Life Sciences ?(二)酶的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)與催化功能的關(guān)系 ? 酶的二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)是所有酶都必須具備的空間構(gòu)型。 ? 1.酶的變性和失活 ? 2.活性中心的撓性 ? 3.酶分子的結(jié)構(gòu)域 14 College of Life Sciences ?(三)酶的四級(jí)結(jié)構(gòu)與催化功能的關(guān)系 ? 具有四級(jí)結(jié)構(gòu)的酶,按其功能可分為兩類,一類與催化作用有關(guān),另一類與代謝調(diào)節(jié)關(guān)系密切。 E+S= ES= P+ E ( S: substrate, P: product) 在反應(yīng)過(guò)程中,酶首先與底物形成酶 底物中間復(fù)合物( ES, enzymesubstrate intermediates) ,再分解成酶( E)和產(chǎn)物( P), 使反應(yīng)沿一個(gè)低活化能的途徑進(jìn)行,降低反應(yīng)所需活化能 。 20 College of Life Sciences ? 2. 酸堿催化 (acid or base catalysis) 酸堿催化是通過(guò)瞬時(shí)地向反應(yīng)物提供質(zhì)子或從反應(yīng)物接受質(zhì)子以穩(wěn)定過(guò)渡態(tài)、加速反應(yīng)的一類催化機(jī)制 。 25 College of Life Sciences 7. 底物的變形( distortion)與張力作用( tensility) 26 College of Life Sciences 四、影響酶促反應(yīng)速度的因素 ? 27 College of Life Sciences ?2. 酶濃度的影響 ?反應(yīng)速度與酶濃度成正比 28 [S][E] V∝ [E] Fig. Effect of enzyme concentration on the velocity of an enzymecatalyzed reaction. College of Life Science