計(jì)算機(jī)的計(jì)算能力ppt課件-展示頁(yè)
2025-05-12 07:14本頁(yè)面
【正文】 ： 序列比對(duì) ? 用于同源查找：從不同的生物中找到相似之處 ? 人類(lèi) vs. 老鼠 vs. 酵母 (以下數(shù)據(jù)來(lái)自 NCBI 疾病數(shù)據(jù)庫(kù) ) Best Sequence Similarity Matches to Date Between Positionally Cloned Human Genes and S. cerevisiae Proteins Human Disease MIM Human GenBank BLASTX Yeast GenBank Yeast Gene Gene Acc for Pvalue Gene Acc for Description Human cDNA Yeast cDNA Hereditary Nonpolyposis Colon Cancer 120436 MSH2 U03911 MSH2 M84170 DNA repair protein Hereditary Nonpolyposis Colon Cancer 120436 MLH1 U07418 MLH1 U07187 DNA repair protein Cystic Fibrosis 219700 CFTR M28668 YCF1 L35237 Metal resistance protein Wilson Disease 277900 WND U11700 CCC2 L36317 Probable copper transporter Glycerol Kinase Deficiency 307030 GK L13943 GUT1 X69049 Glycerol kinase Bloom Syndrome 210900 BLM U39817 SGS1 U22341 Helicase Adrenoleukodystrophy, Xlinked 300100 ALD Z21876 PXA1 U17065 Peroxisomal ABC transporter Ataxia Telangiectasia 208900 ATM U26455 TEL1 U31331 PI3 kinase Amyotrophic Lateral Sclerosis 105400 SOD1 K00065 SOD1 J03279 Superoxide dismutase Myotonic Dystrophy 160900 DM L19268 YPK1 M21307 Serine/threonine protein kinase Lowe Syndrome 309000 OCRL M88162 YIL002C Z47047 Putative IPP5phosphatase Neurofibromatosis, Type 1 162200 NF1 M89914 IRA2 M33779 Inhibitory regulator protein Choroideremia 303100 CHM X78121 GDI1 S69371 GDP dissociation inhibitor Diastrophic Dysplasia 222600 DTD U14528 SUL1 X82022 Sulfate permease Lissencephaly 247200 LIS1 L13385 MET30 L26505 Methionine metabolism Thomsen Disease 160800 CLC1 Z25884 GEF1 Z23117 Voltagegated chloride channel Wilms Tumor 194070 WT1 X51630 FZF1 X67787 Sulphite resistance protein Achondroplasia 100800 FGFR3 M58051 IPL1 U07163 Serine/threoinine protein kinase Menkes Syndrome 309400 MNK X69208 CCC2 L36317 Probable copper transporter 序列比對(duì)的意義 ? 在生物學(xué)的研究中，將未知序列同已知序列進(jìn)行比較分析已經(jīng)成為一種強(qiáng)有力的研究手段 ，生物學(xué)領(lǐng)域中絕大部分的問(wèn)題在計(jì)算機(jī)科學(xué)領(lǐng)域中主要體現(xiàn)為序列或字符串的問(wèn)題 。 生物信息學(xué)熱點(diǎn)問(wèn)題（ 2） ? 后基因組時(shí)期：相互作用－網(wǎng)絡(luò)－功能 – 生物芯片（ DNA芯片、蛋白質(zhì)芯片） – 相互作用網(wǎng)絡(luò) – 調(diào)控網(wǎng)絡(luò) – 藥物設(shè)計(jì) – 。 生物信息學(xué)的定義 生物信息學(xué)的研究 ? 以核酸蛋白質(zhì)等生物大分子為主要 研究對(duì)象 ? 以信息、數(shù)理、計(jì)算機(jī)科學(xué)為主要 研究手段 ? 以計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)為主要 研究環(huán)境 ? 以計(jì)算機(jī)軟件為主要 研究工具 ? 對(duì)序列數(shù)據(jù)進(jìn)行 存儲(chǔ)、管理、注釋、加工 ? 對(duì)各種數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行 查詢(xún)、搜索、比較、分析 ? 構(gòu)建各種類(lèi)型的專(zhuān)用 數(shù)據(jù)庫(kù)信息系統(tǒng) ? 研究開(kāi)發(fā)面向生物學(xué)家的 新一代計(jì)算機(jī)軟件 生物信息學(xué) – 研究方向 ? 基因組序列裝配 ? 基因識(shí)別 ? 基因功能預(yù)報(bào) ? 基因多態(tài)性分析 ? 基因進(jìn)化 ? mRNA結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) ? 基因芯片設(shè)計(jì) ? 基因芯片數(shù)據(jù)分析 ? 疾病相關(guān)基因分析 ? 蛋白質(zhì)序列分析 ? 蛋白質(zhì)家族分類(lèi) ? 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) ? 蛋白質(zhì)折疊研究 ? 代謝途徑分析 ? 轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制 ? 蛋白質(zhì)芯片設(shè)計(jì) ? 蛋白質(zhì)芯片數(shù)據(jù)分析 ? 藥物設(shè)計(jì) 生物信息學(xué) – 研究方法 ? 利用數(shù)理統(tǒng)計(jì)、模式識(shí)別、動(dòng)態(tài)規(guī)劃、密碼解讀、語(yǔ)意解析、信令傳遞、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、遺傳算法以及隱馬氏模型等各種方法 ? 對(duì)序列、結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)進(jìn)行 定性和定量分析 ，從中獲取基因編碼、基因調(diào)控、序列 結(jié)構(gòu) 功能關(guān)系等理性知識(shí) ? 闡明細(xì)胞、器官和個(gè)體的發(fā)生、發(fā)育、病變、衰亡的基本規(guī)律和 時(shí)空聯(lián)系 ? 探索生命
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