轉(zhuǎn)錄組rnaseq術(shù)語解釋-展示頁
2025-04-17 04:52本頁面
【正文】 ence）是編碼一段蛋白產(chǎn)物的序列，是結(jié)構(gòu)基因組學(xué)術(shù)語。15. ORF（open reading frame）開放閱讀框或開放讀碼框。UTR從mRNA起點的甲基化鳥嘌呤核苷酸帽延伸至 AUG 起始密碼子，339。是信使 RNA（mRNA）分子兩端的非編碼片段。13. 基因間區(qū)(intergenic)指基因與基因之間的間隔序列，不屬于基因結(jié)構(gòu)，不直接決定氨基酸，可能通過轉(zhuǎn)錄后調(diào)控影響性狀的區(qū)域。端可變剪接。端邊界發(fā)生不同方式的剪接，這種剪接機制被稱為539。端可變剪接前體mRNA在剪接形成成熟mRNA的過程中，539。11. 539。（Exon skipping）外顯子在前體mRNA剪接形成成熟mRNA過程中被跳過，最終沒有出現(xiàn)在某些成熟mRNA上，這種剪接機制被稱為外顯子跳躍。 splice site；D) Alternative 339?？勺兗艚邮钦{(diào)節(jié)基因表達和產(chǎn)生蛋白質(zhì)組多樣性的重要機制，是導(dǎo)致真核生物基因和蛋白質(zhì)數(shù)量較大差異的重要原因。統(tǒng)計學(xué)根據(jù)顯著性檢驗方法所得到的P 值，一般以P，P。通過控制FDR來決定P值的閾值。（Fold Change）即差異表達倍數(shù)。（Fragments Per Kilobase of transcript per Million fragments mapped）每1百萬個map上的reads中map到外顯子的每1K個堿基上的fragment個數(shù)。堿基質(zhì)量值越高表明堿基識別越可靠，堿基測錯的可能性越小。RNASeq名詞解釋測序的標(biāo)簽，用于測定混合樣本，通過每個樣本添加的不同標(biāo)簽進行數(shù)據(jù)區(qū)分，鑒別測序樣品。（Quality Score或Qscore）是堿基識別（Base Calling）出錯的概率的整數(shù)映射。%。計算公式為公式中，cDNA Fragments 表示比對到某一轉(zhuǎn)錄本上的片段數(shù)目，即雙端Reads數(shù)目；Mapped Reads(Millions)表示Mapped Reads總數(shù)，以10為單位；Transcript Length(kb)：轉(zhuǎn)錄本長度，以kb個堿基為單位。（False Discovery Rate）即錯誤發(fā)現(xiàn)率，定義為在多重假設(shè)檢驗過程中，錯誤拒絕(拒絕真的原(零)假設(shè))的個數(shù)占所有被拒絕的原假設(shè)個數(shù)的比例的期望值。（Pvalue）即概率，反映某一事件發(fā)生的可能性大小。（Alternative splicing）有些基因的一個mRNA前體通過不同的剪接方式（選擇不同的剪接位點）產(chǎn)生不同的mRNA剪接異構(gòu)體，這一過程稱為可變剪接(或選擇性剪接，alternative splicing)。在生物體內(nèi)，主要存在7種可變剪接類型：A）Exon skipping；B）Intron retention；C) Alternative 539。 splice site；E) Alternative first exon；F)
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