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醫(yī)學]第16章dna的生物合成和損傷修復熊宇芳-展示頁

2025-01-13 03:00本頁面
  

【正文】 基可增強其活性 ?亞基 可能起組裝作用 核心酶由 ?、 ?和 ?亞基組成: 目 錄 2個 ?亞基 分別和 1個核心酶相互作用 , 其柔性連接區(qū)可以確保在復制叉 1個全酶分子的2個核心酶能夠相對獨立運動 , 分別負責合成前導鏈和后隨鏈 。 (三)復制時聚合酶 Ⅲ 催化 DNA合成而 聚合酶 Ⅰ 切除引物 DNA聚合酶 Ⅰ 可利用損傷尚未修復的 DNA鏈作為模板合成 DNA,但不能修復損傷。 目 錄 中 DnaB結(jié)合引發(fā)酶 DnaG,催化合成RNA引物,其序列始于 pppAG,模板鏈序列 3?GTC5?,引物長度一般 11~12個堿基。 ?DNA結(jié)合蛋白,對復制起促進作用。 DnaA蛋白 目 錄 ?5??3?解旋酶作用產(chǎn)生兩條復制模板鏈 ?激活引發(fā)酶 DnaG蛋白 ?DnaB蛋白與引發(fā)酶結(jié)合,形成引發(fā)體 DnaB蛋白 目 錄 ?使一條 DNA鏈圍繞著另一條旋轉(zhuǎn),消除解旋產(chǎn)生的張力。 DNA復制以 DNA或核苷酸為引物 目 錄 三、不同基因組 DNA通過不同的模式 進行復制 (一)真核生物基因組 DNA復制過程涉及反轉(zhuǎn)錄 (二)基因組單鏈 DNA通過復制中間體完成復制 (三)有的基因組 DNA通過 RNA中間體進行復制 (四)雙鏈環(huán)狀 DNA也有不同的復制方式 目 錄 四、不同基因組 RNA通過不同的 模式進行復制 ( 一)基因組雙鏈 RNA復制過程是雙鏈復制 (二)基因組單鏈正鏈 RNA以負鏈為模板進 行復制 (三)基因組單鏈負鏈 RNA以正鏈 RNA為模板進行復制 (四)反轉(zhuǎn)錄病毒的基因組 RNA通過 DNA中間體進行復制 目 錄 DNA復制過程 Process of DNA Replication 第二節(jié) 目 錄 一、原核生物 DNA復制體現(xiàn)了復制的基本過程和特征 (一)在復制起點解旋酶和多種因子形成復合物 1. 6種蛋白質(zhì)因子 2. 解螺旋酶激活引發(fā)酶形成引發(fā)體 3. 解旋還需要促旋酶和 SSB 目 錄 DnaA、 DnaB、 DnaC、 HU、 促旋酶( gyrase,即拓撲異構(gòu)酶 Ⅱ )、 單鏈 DNA結(jié)合蛋白 (single strand binding protein, SSB) DNA復制需要 6種蛋白因子: 目 錄 DNA復制起始 目 錄 ?結(jié)合 oriC的 4個 9bp反向重復序列形成 復制起始復合物 。 ?RNA引物 5?端的第一個核苷酸通常是 pppA( 個別為 pppG) 。 酵母復制起始點 目 錄 ?DNA聚合酶不能從 游離的核苷酸 開始合成DNA鏈 , 必須由引物 ( primer) 提供自由的3?OH末端 , 通過加入核苷酸使之不斷延伸 。 ? 元件 A(富含 A/T的共有序列 ):結(jié)合一個特異的蛋白質(zhì)復合物 ──復制起點識別復合物 (ORC)。 1 13 17 29 32 44 GATCTNTTNTATT ③ 一般富含 AT,利于雙螺旋 DNA解旋,以產(chǎn)生單鏈DNA復制模板。 目 錄 復制起點的一般特征 : ① 由多個獨特的短重復序列組成。后隨鏈中的小片段稱為 岡崎片段( Okazaki fragments)。 兩條新合成的 DNA鏈和兩條原來的復制模板鏈之間的結(jié)合方式可能性: 目 錄 ?密度梯度實驗 —— 實驗結(jié)果支持 半保留復制 方式 含重氮 DNA的細菌 培養(yǎng)于普通培養(yǎng)液 第一代 繼續(xù)培養(yǎng)于普通培養(yǎng)液 第二代 梯度離心結(jié)果 目 錄 前導鏈( leading strand) : DNA復制時,一條鏈的合成方向和復制叉前進方向相同,可以連續(xù)復制合成的新鏈。 (二)復制過程中形成復制泡和復制叉 目 錄 目 錄 從一個 DNA復制起點起始的 DNA復制區(qū)域,它是一個獨立復制單位,包括復制起點和終點。 目 錄 二、基因組 DNA復制具備一些共同特征 (一)基因組 DNA都具有固定的復制起始點 (二)復制過程中形成復制泡和復制叉 (三)復制的基本單位稱為復制子 (四)半保留復制方式保證遺傳信息的忠實傳遞 (五)半不連續(xù)復制克服了 DNA空間結(jié)構(gòu)對 DNA 新鏈合 成的制約 (六)復制起點由多個短重復序列組成 (七) DNA復制必須有引物 目 錄 復制起點( origin) :指 DNA復制所必需的一段特殊的 DNA序列。目 錄 DNA的合成及重組 DNA Biosynthesis and Rebination 第十六章 目 錄 DNA生物合成 DNA復制 ( DNA指導的 DNA合成 ) 逆轉(zhuǎn)錄 (逆轉(zhuǎn)錄病毒 RNA指導的 DNA合成 ) 校正復制中可能出現(xiàn)的錯誤,并修復受到損傷的 DNA 細胞中酶促修復系統(tǒng) 自然界 DNA重組和基因轉(zhuǎn)移的基本方式 目 錄 基因組復制的主要特點 The General features of Genome Replication 第一節(jié) 目 錄 一、基因組是細胞或病毒全部遺傳信息的總和 含有一種生物的一整套遺傳信息的遺傳物質(zhì),稱為 基因組( genome) 。在真核生物體中,基因組是指一套完整單倍體 DNA(染色體 DNA)和線粒體DNA的全部序列,既包括編碼序列,也包括非編碼序列。 (一)基因組 DNA都具有固定的復制起始點 目 錄 雙螺旋 DNA復制時,復制區(qū)生長點的結(jié)構(gòu)呈 Y形或叉形,稱之為 復制叉。 復制子( replicon) (三)復制的基本單位稱為復制子 目 錄 (四)半保留復制方式保證遺傳信息的忠實傳遞 ( 1) 全保留式( conservative) ,即恢復原來的DNA雙螺旋,并產(chǎn)生一個新的子代 DNA雙螺旋; ( 2) 半保留式( semiconservative) ,即新老搭配,由一條新合成的 DNA鏈和一條復制模板鏈配對產(chǎn)生子代雙螺旋 DNA; ( 3) 散布式( dispersive), 即復制模板鏈被分成許多小片段,散布于子代 DNA中。 后隨鏈( lagging strand) :另一條鏈的合成方向與復制叉前進方向相反,不能連續(xù)復制,只能分成若干小片段分別合成,然后連接起來形成新鏈。 (五)半不連續(xù)復制克服了 DNA空間結(jié)構(gòu) 對 DNA新鏈合成的制約 前導鏈連續(xù)復制而后隨鏈不連續(xù)復制,即 DNA半不連續(xù) 復制 。 ② 短重復序列被多亞基的復制起始因子所識別并結(jié)合。 (六)復制起點由多個短重復序列組成 目 錄 復制起始點 oriC GATTNTTTATTT GATCTCTTATTAG TGTGGATTA‖ TTATACACA‖ TTTGGATAA‖ TTATCCACA 58 66 166 174 201 209 237 245 同向重復序列 反向重復序列 5? 3? 5? 3? 目 錄 酵母復制起點為 自主復制序列( autonomously replicating sequences, ARS) : 酵母染色體含有多個復制起點。 ? 3個序列 (B B2和 B3)可以增加復制起點的效率,其中 B2的 9個堿基與上述 ARS共有序列相同。 ?所有細胞和多數(shù)病毒的 DNA復制 , 首先利用模板合成一段 RNA引物 , 這一過程為 引發(fā)( priming) 。 (七) DNA復制必須有引物 DNA復制使用 RNA引物 目 錄 ???174等噬菌體 以雙鏈 環(huán)形 DNA的一條鏈上產(chǎn)生切口處的 3?OH為引物; ?腺病毒及某些線性 DNA病毒 以結(jié)合于病毒 DNA的 5?端磷酸基團的末端蛋白上的 dCTP的 3?OH為引物開始復制。 ?作用于 oriC的 3個 13bp正向重復序列 , DNA在這 3個位點解鏈 , 形成 開放型復合物 ( open plex) 。 促旋酶 SSB蛋白 HU蛋白 ?穩(wěn)定解旋后的單鏈 DNA構(gòu)象,有助于解旋。 ?HU蛋白能夠使 DNA發(fā)生折疊。 (二)引發(fā)酶合成 RNA引物 目 錄 負責切除 RNA引物。 負責合成 DNA。 功能: ?復合物是 DNA夾子加載蛋白 , 負責將可沿 DNA鏈滑動的一對 ?亞基 ( DNA夾子 ) 加載于 DNA, 使 DNA聚合酶 Ⅲ 具有持續(xù)合成能力 。 Tus蛋白除了使復制叉停止運動以外 , 還可
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