【正文】 I轉(zhuǎn)錄，究竟是由RNA聚合酶II還是Ⅲ轉(zhuǎn)錄，似乎由TATA礦的序列決定。（TFⅢB含TBP是真正的轉(zhuǎn)錄因子，A、C可被高鹽除掉，是裝配因子）RNA聚合酶Ⅲ的第Ⅲ類啟動子位于轉(zhuǎn)錄起點的上游，這類啟動子有三個上游元件，負責轉(zhuǎn)錄snRNA的基因，其元件主要包括：OctPSETATA(Oct 核苷酸八聚體；PSE近端序列元件，提高轉(zhuǎn)錄效率；TATA區(qū)。TFⅢB本身不具有結(jié)合DNA的能力，RNA聚合酶Ⅲ也不能識別特異的DNA序列。在Ⅱ類啟動子的轉(zhuǎn)錄起始過程中，首先TFⅢC結(jié)合于平boxA和boxB，然后招募真正的起始因子TFⅢB，后者招募RNA聚合酶Ⅲ。有關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子包括TFⅢA 、TFⅢB、 TFⅢC。類型Ⅰ（5SrRNA）由boxA 序列和一個隔開的boxC組成，類型Ⅱ（tRNA）由boxA和一個隔開的boxB序列組成。13. RNA聚合酶III識別的啟動子有哪幾類？其定位因子是什么？RNA聚合酶的啟動子有三種類型結(jié)構(gòu)。eg3: CAAT box約在75bp處，決定了轉(zhuǎn)錄的效率，兩個方向都有效。具有選擇定位轉(zhuǎn)錄點的功能，作為定位因子起作用的eg2: GC box通常在起始位點上游4070bp處，但在每一個啟動子中，GC盒前后的情況是不一樣的。它可以在所有真核生物中找到。它們受相應轉(zhuǎn)錄因子的識別和作用。RNA聚合酶II啟動子涉及眾多編碼蛋白質(zhì)基因表達的控制，該類型啟動子包含四類控制元件：基本啟動子、起始子、上游元件和應答元件。近啟動子有輔助因子UBFl識別，遠啟動子有SL1識別。簡單答案：（RNA聚合酶I識別的啟動子包含40~+50的近啟動子和165~40的遠啟動子兩部分。發(fā)生在兩個部位的結(jié)合因子之間相互作用的詳細情況尚不清楚。C 區(qū)結(jié)合。RNA 聚合酶Ⅰ需要UBF1和SL1兩個輔助因子。與一般啟動子相比，這兩個區(qū)域都有不尋常的組成，富含G11. RNA聚合酶I識別的啟動子包含有哪兩個部分？分別有什么蛋白因子識別？RNA聚合酶Ⅰ只轉(zhuǎn)錄編碼核糖體RNA的基因，轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物經(jīng)切割和加工后生成各種成熟rRNARNA 聚合酶I 的轉(zhuǎn)錄單位有兩段起始調(diào)控序列，核心啟動子(Core promoter)和與之相距70bp 處的上游啟動元件upstream promoter element(UPE) （舊稱上游控制元件(Upstream control element，UCE)）核心啟動子(Core promoter)位于起始位點周圍，從45 延伸到+20，它本身就足以起始轉(zhuǎn)錄。簡單終止子除能形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)外，在終點前還有一段由68個A組成的序列，所以轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的3’端為寡聚U，另外回文對稱區(qū)通常有一段富含GC的序列。所有的原核生物的終止子在終止點之前均有一個回文結(jié)構(gòu)，其產(chǎn)生的RNA可形成莖環(huán)構(gòu)成的發(fā)夾結(jié)構(gòu)。保持啟動子這二段序列及它們之間的距離是很重要的。在35區(qū)和10區(qū)之間的距離17177。在35位置，找到又以保守序列：TTGACA，稱為識別區(qū)或35序列。10. 原核生物啟動子所組成的保守序列和終止子特異序列是什么？啟動子是指RNA聚合酶識別、結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。當反轉(zhuǎn)錄病毒感染細胞時，pol基因就被宿主的RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄，產(chǎn)生pol mRNA，并在宿主核糖體上合成包括反轉(zhuǎn)錄酶、整合酶等多個病毒復制和整合所需要的酶類。反轉(zhuǎn)錄病毒復制機制：反轉(zhuǎn)錄病毒的復制是由其自身基因組上pol基因編碼的反轉(zhuǎn)錄指導完成的，該酶具有以下三種性能：①能以RNA為模板合成出第一條互補的DNA鏈（逆轉(zhuǎn)錄酶活性）；②在新和成的DNA鏈上合成另一條互補DNA鏈，形成雙鏈DNA（DNA聚合酶活性）；③水解除去RNADNA雜合分子中的RNA（Rnase活性，即核糖核酸酶活性）。易位因子：即轉(zhuǎn)座子，是存在于染色體上可自主復制和位移的基本單位。ruvC，編碼了一個末端核酸酶，它能確精地辨認出Holliday結(jié)合處，結(jié)合到Holliday中間產(chǎn)物上，將這樣的結(jié)合處分開。Chi是一個被recBCD基因編碼的酶的作用目標。它能結(jié)合到雙鏈的上并使雙鏈解旋并分開，當遇到Chi位點時，RecBCD就切開一條單鏈，并失去RecD亞單位，RecBC繼續(xù)解開雙鏈。2單鏈DNA與其互補物在雙鏈上快速配對反應，產(chǎn)生異性雙鏈連接3單鏈從雙鏈中轉(zhuǎn)移，取代了雙鏈中的一條鏈。RceA蛋白具有鏈交換，ATP酶及蛋白酶活性。引起SOS反應的信號消除后，recA蛋白的蛋白酶活力喪失，lexA蛋白又重新發(fā)揮阻遏作用。正常情況下處于不活動狀態(tài)。SOS反應是DNA受到損傷或脫氧核糖核酸的復制受阻時的一種誘導反應。SOS修復。重組修復與切除修復的最大區(qū)別在于前者不須立即從親代的DNA分子中去除受損傷的部分,卻能保證DNA復制繼續(xù)進行。重組修復從 DNA分子的半保留復制開始，在嘧啶二聚體相對應的位置上因復制不能正常進行而出現(xiàn)空缺,在大腸桿菌中已經(jīng)證實這一DNA損傷誘導產(chǎn)生了重組蛋白,在重組蛋白的作用下母鏈和子鏈發(fā)生重組,重組后原來母鏈中的缺口可以通過DNA多聚酶的作用,以對側(cè)子鏈為模板合成單鏈DNA片斷來填補,最后也同樣地在連接酶的作用下以磷酸二脂鍵連接新舊鏈而完成修復過程。切除修復功能廣泛存在于原核生物和真核生物中，也是人類的主要修復方式,嚙齒動物 (如倉鼠、小鼠)先天缺乏切除修復的功能。對于各種不同類型的堿基損傷都有特異的糖基酶加以識別。從切除的對象來看，切除修復又可以分為堿基切除修復和核苷酸切除修復兩類。最初在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)，包括一系列復雜的酶促DNA修補復制過程,主要有以下幾個階段：核酸內(nèi)切酶識別DNA損傷部位，并在5’端作一切口，再在外切酶的作用下從5’端到3’端方向切除損傷；然后在 DNA多聚酶的作用下以損傷處相對應的互補鏈為模板合成新的 DNA單鏈片斷以填補切除后留下的空隙；最后再在連接酶的作用下將新合成的單鏈片斷與原有的單鏈以磷酸二酯鏈相接而完成修復過程。7. 闡述原核生物DNA修復機制（舉3例）。它能利用端粒3′端單鏈為引物，自身的RNA為模板合成端粒重復序列添加到染色體末端，從而延長端粒的長度。端粒酶是RNA與蛋白質(zhì)組成的核糖核蛋白，是一種RNA依賴性DNA聚合酶。人類細胞中發(fā)現(xiàn)了一種端粒結(jié)合蛋白，但人類染色體末端的DNA蛋白復合體的結(jié)構(gòu)還不清楚。人類端粒由5′TTAGGG3′的重復單位構(gòu)成，長度在5～15kb范圍。端粒是真核細胞染色體末端的特殊結(jié)構(gòu)，由端粒DNA和與端粒DNA特異結(jié)合蛋白組成的核蛋白復合物，廣泛存在于真核生物細胞中，具有特殊的功能。（5）負鏈通常保持環(huán)狀，因而保留有一套完整的遺傳信息。（3）子代分子可能是連環(huán)的，即對應于每個單位基因組的相同DNA分子頭尾相連。滾環(huán)復制的特點：（1）是單方向和不對稱的半保留復制。A蛋白與環(huán)化有關(guān)。（5）A蛋白又能識別原點并進行切割，連接在新切割產(chǎn)生的末端，繼續(xù)循環(huán)。新鏈圍繞著環(huán)狀負鏈模板延伸，直到到達原點并代替原點。（2）切除原點后，A蛋白質(zhì)仍與它產(chǎn)生的5’端連接，3’端在DNA聚合酶的作用下延伸。這個過程存在于某些噬菌體的營養(yǎng)復制過程和結(jié)合質(zhì)粒的轉(zhuǎn)移復制過程。滾環(huán)式復制(rolling circle replication)是一種復制方式，復制叉沿環(huán)形模板復制一定次數(shù)，每個反應中新合成的鏈將前一反應中合成的鏈拋出，形成與環(huán)狀模板鏈互補的一系列線性序列。β二聚體自己并不能組裝到DNA 上 ,它是通過γ復合物與ATP協(xié)同作用催化ATP的水解而組裝到DNA上的。β 亞基的功能猶如夾子，兩個β亞基夾住DNA分子并可向前滑動，使聚合酶在完成復制前不再脫離DNA，從而提高了酶的持續(xù)合成能力。