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大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)與蛋白表達(dá)純化(參考版)

2025-08-08 03:36本頁(yè)面
  

【正文】 。蛋白溶液的保存原則:(1)緩沖液pH 避免接近蛋白的等電點(diǎn);(2)根據(jù)每次使用的量分裝成多管,這樣可避免反復(fù)凍融;(3)加入穩(wěn)定劑如甘油,DTT, TritonX100等。目前后兩種常用的定量方法都有相關(guān)的試劑盒采用。改良的Lorry法不再排斥去污劑,相對(duì)的操作就比較復(fù)雜。一般而言,紫外吸收法適合于與色譜柱聯(lián)用,達(dá)到實(shí)時(shí)監(jiān)控,然而較不準(zhǔn)確。(3)Lorry法其原理是蛋白質(zhì)與堿性銅溶液中的Cu2+絡(luò)和使得肽鍵伸展,從而使暴露出的酪氨酸和色氨酸在堿性銅條件下與福林試劑反應(yīng),產(chǎn)生藍(lán)色,在一定濃度范圍內(nèi),其顏色的深淺與蛋白質(zhì)中的酪氨酸和色氨酸的含量成正比,由于各種蛋白質(zhì)中的酪氨酸和色氨酸的含量各不相同,因此在測(cè)定時(shí)需使用同種蛋白質(zhì)作標(biāo)準(zhǔn)。該法測(cè)定要求樣品中不能有能與考馬斯亮藍(lán)G250反應(yīng)顯色的去污劑,比如Triton、NP400、吐溫等。其原理為,蛋白質(zhì)與染料考馬斯亮藍(lán)G250結(jié)合,使得染料最大吸收峰從465nm變?yōu)?95nm,在一定的線性范圍內(nèi),反應(yīng)液595nm處吸光度的變化量與反應(yīng)蛋白量成正比,測(cè)定595nm處吸光度的增加即可進(jìn)行蛋白定量。例如,在制備酶的過程中,層析柱的流出液中有時(shí)混雜有核酸,應(yīng)予以校正。首先,對(duì)于測(cè)定那些與標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)中酪氨酸和色氨酸含量差異較大的蛋白質(zhì),有一定的誤差,故該法適于測(cè)定與標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)氨基酸組成相似的蛋白質(zhì)。因此,已在蛋白質(zhì)和酶的生化制備中廣泛采用,尤其在柱層析分離純化中,常用280nm進(jìn)行紫外檢測(cè),來(lái)判斷蛋白質(zhì)吸附或洗脫情況。(1)直接紫外吸收法由于蛋白質(zhì)中存在著含有共軛雙鍵的酪氨酸和色氨酸,所以任何一個(gè)蛋白質(zhì)都具有280nm附近的紫外吸收峰,在此波長(zhǎng)范圍內(nèi),蛋白質(zhì)溶液的光密度OD280nm與其濃度呈正比關(guān)系,我們可以對(duì)其進(jìn)行定量。蛋白質(zhì)的快速定量方法主要依靠蛋白質(zhì)本身的發(fā)色基團(tuán),或其與其它顯色劑反應(yīng)產(chǎn)生的紫外吸收來(lái)進(jìn)行定量。定量作為生物實(shí)驗(yàn)室的日常工作之一,具有非常重要的意義。根據(jù)干膠的吸水量和蛋白液需濃縮的倍數(shù)而稱取所需的干膠量。另一種是將蛋白液裝入透析袋內(nèi)置于真空干燥器的通風(fēng)口上,負(fù)壓抽氣,而使袋內(nèi)液體滲出。(3)超濾膜濃縮法此法是利用微孔纖維素膜通過高壓將水分濾出,而蛋白質(zhì)存留于膜上達(dá)到濃縮目的。干燥后的蛋白質(zhì)保存方便,應(yīng)用時(shí)可配成任意濃度使用。密閉,迅速抽空,并維持在抽空狀態(tài)。它是在冰凍狀態(tài)下直接升華去除水分。吸水劑用過后,可放入溫箱中烘干或自然干燥后,仍可再用。將要濃縮的蛋白溶液放入透析袋(無(wú)透析袋可用玻璃紙代替),結(jié)扎,把高分子(6 000~12 000)聚合物如聚乙二醇(碳蠟)、聚乙烯吡咯、烷酮等或蔗糖撒在透析袋外即可。(4)可在細(xì)胞質(zhì)或周質(zhì)中表達(dá)(pMALp2X載體):周質(zhì)表達(dá)可提高二硫鍵的形成,促進(jìn)蛋白折疊的形成?!緋MAL系統(tǒng)的優(yōu)勢(shì)】(1)75%的蛋白可獲得高效表達(dá),蛋白產(chǎn)量可達(dá)100 mg/L (2)與其他幾種常用表達(dá)系統(tǒng)研究比較,與MBP融合表達(dá)更能提高E. coli表達(dá)蛋白的可溶性。(3)預(yù)裝柱在每次使用完畢后,在柱床上方加入2~4 ml 緩沖液或水,蓋上頂端的帽子后,隨即蓋上底部的帽子,豎立放置于4℃貯存。 Amylose樹脂可以采用下述清洗步驟進(jìn)行再生水3倍柱床體積% SDS3倍柱床體積水1倍柱床體積過柱緩沖液3倍柱床體積【注意事項(xiàng)】(1)每次使用時(shí),請(qǐng)先打開頂端的帽子再移去底部的帽子,以避免氣泡進(jìn)入到預(yù)裝柱內(nèi)。再生。通常,含目的蛋白的融合蛋白在一個(gè)柱床體積內(nèi)將被洗脫下來(lái),可以通過波長(zhǎng)為280 nm的紫外吸收光或考馬斯亮藍(lán)蛋白檢測(cè)法進(jìn)行檢測(cè)。用4倍柱床體積的洗脫緩沖液洗脫與Amylose樹脂結(jié)合的MBP融合蛋白,~1 ml/min。(2)融合蛋白的親和純化:預(yù)裝柱用8~12倍柱床體積的雙蒸水沖洗;預(yù)裝柱用9倍柱床體積過柱緩沖液平衡;將上述實(shí)驗(yàn)步驟三的上清液加入到柱床內(nèi),~1 ml/min(建議每次上樣2~4ml)。添加劑:1 mM sodiμm azide;10 mM β-mercaptoethanol 或1 mM DTT。C貯存。結(jié)合容量: mg MBPParamyosin 融合蛋白。所有這些載體都含有一段編碼蛋白酶識(shí)別位點(diǎn)的序列,融合蛋白純化后,通過Factor Xa(X),Enterokinase(E)或GenenaseTM I(G)可將目的蛋白與MBP切割分離。pMALTMc2 系列載體缺失malE 信號(hào)序列,導(dǎo)致融合蛋白在細(xì)胞質(zhì)中表達(dá)?! ?此系統(tǒng)的pMAL載體含有LacZα基因,目的基因的插入導(dǎo)致其失活,通過Xgal平板可進(jìn)行藍(lán)白斑篩選。pMAL載體含有編碼麥芽糖結(jié)合蛋白(Maltose Binding Protein, MBP)的大腸桿菌malE基因,其下游的多克隆位點(diǎn)便于目的基因插入,表達(dá)N端帶有MBP的融合蛋白。操作過程中目標(biāo)蛋白降解:控制操作條件,比如嚴(yán)格4℃操作,緩沖液中加入蛋白酶抑制劑,超聲處理過度:減少超聲,避免發(fā)泡導(dǎo)致蛋白變性。洗脫條件:可已在洗脫緩沖液中加入一定量的非離子去污劑,%的Triton100 或NP40等。(3)純化的蛋白雜質(zhì)很多表達(dá)的蛋白不完整:再遇到一些稀有密碼子或者特殊的RNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)時(shí),可能使得目標(biāo)蛋白截短表達(dá),可采用一些特殊的表達(dá)宿主,如Rosetta系列。每次在臨純化前新鮮配制1X洗脫緩沖液洗脫緩沖液中谷胱甘肽濃度太低:GST?Bind樹脂的還原型谷胱甘肽濃度達(dá)到10mM就夠了。(2)蛋白難以洗脫洗脫體積太少:有時(shí)需要使用更多的緩沖液洗脫目的蛋白。采用溫和的超聲條件或改用其它的破碎方法。融合蛋白與GST?Bind樹脂會(huì)結(jié)合不充分。樹脂可以在4℃下,20%乙醇/80%水中長(zhǎng)時(shí)間存放。其它可以選用做去除污染蛋白的緩沖液還包括:6M尿素,6M鹽酸胍或低極性溶劑,如50~70%乙醇或50%乙二醇。但隨著非特異性結(jié)合的蛋白的增多和蛋白的聚集,往往會(huì)造成流速和結(jié)合載量都下降??梢詫?duì)操作過程中的每一步取樣進(jìn)行SDSPAGE分析。方法二:是純化不含GSTtag 的蛋白,按照說(shuō)明書將蛋白酶PreScission Protease(GE公司)用PBS 稀釋到到1ml,加入到(6)中的樹脂中,輕輕混勻然后4℃溫育12h,收集流出液,即為GFP的純化產(chǎn)物。根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要不同有兩種方法來(lái)收集目的蛋白。(6)重復(fù)步驟(5)一次,然后向沉淀中加入5ml 的PBS 懸浮樹脂,并將懸浮液轉(zhuǎn)移到一個(gè)10ml 的塑料層析柱,并打開閥門放掉PBS。(4)2000 rpm,離心5min,小心傾倒出上清。(2)用寬嘴吸頭吸取1ml 的脂漿,加入到裝有40ml 的PBS(整個(gè)操作過程所有的PB均需預(yù)冷) V型離心管中,輕柔顛倒數(shù)次,洗滌除去殘留的20%乙醇,2000 rpm,離心5min,小心傾倒出PBS。蛋白的誘導(dǎo)與樣品的制備方法基本同上。非常適合實(shí)驗(yàn)室小量制備大腸桿菌重組蛋白。用1ml 的樹脂純化1L ~ mg。GST 融合于目標(biāo)蛋白的N端,可以通過谷胱甘肽瓊脂糖親和層析進(jìn)行純化。(15)如果想長(zhǎng)期儲(chǔ)存,加入1倍體積的20%乙醇,4度保存,使用前需要執(zhí)行步驟14。(13)用3倍體積的去離子水洗。(11)用1倍體積的去離子水洗。(9)用1倍體積的50%乙醇洗。(7)用5倍體積的100%乙醇洗。(5)用1倍體積的50%乙醇洗。(3)用3倍體積的2% SDS洗。NTA再生步驟:(1)從層析柱下端流干所有溶液, Acetic Acid/6M gμanidine HCl 洗。注意:NTA樹脂再生前需要從層析柱下端流干所有溶液,估計(jì)出NTA的樹脂體積,按下列次序?qū)⒃偕噭┘拥綄游鲋?,在等上一再生溶液流干后,再加下一再生溶解。策略:增加洗滌的次?shù),使洗滌充分。可能原因3:雜質(zhì)和標(biāo)簽蛋白結(jié)合在一起。策略2:篩選最適合的緩沖液條件,NaCl濃度,PH的范圍都需要進(jìn)行篩選,以便決定最適的結(jié)合和洗脫條件。策略1:咪唑濃度必須優(yōu)化,以確保高純度(宿主細(xì)胞蛋白質(zhì)的低結(jié)合)和高產(chǎn)率(組氨酸標(biāo)記的目標(biāo)蛋白質(zhì)的強(qiáng)結(jié)合)之間的最佳平衡。策略:請(qǐng)?zhí)砑拥鞍酌敢种苿?,(慎用EDTA)。策略:加非離子去污劑到洗脫緩沖液(如,2%Triton X100)或增加NaCl的濃度。試用去污劑或改變NaCl的濃度,或在變性條件(去折疊)下洗脫(用4~8 M脲,或4~6 M 鹽酸胍)。
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