基因組學(xué)課件9功能基因組學(xué)(參考版)
2025-05-15 18:18本頁面
【正文】 基因芯片的應(yīng)用 ? 生物信息學(xué)的工具 ? 基因相關(guān)性研究 ? 基因功能 ? 藥物設(shè)計(jì)和開發(fā) ? 潛在反義試劑開發(fā) ? 個體化醫(yī)療 ? 身份識別 ? 基因診斷 ? 其他與生物有關(guān)的領(lǐng)域 –特定基因檢測 –突變檢測 –多態(tài)性分析 –基因表達(dá)譜 。 ? 蛋白質(zhì)組學(xué)： 高通量解析蛋白質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)，是連接基因組功能研究和新藥開發(fā)的橋梁。 蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫的建立和生物信息學(xué) 數(shù)據(jù)庫的建立是蛋白質(zhì)組研究的最重要的一個方面。 B 鑒定翻譯后修飾的蛋白質(zhì) 質(zhì)譜可通過特征離子監(jiān)測的方法很快確定磷酸化肽，通過串聯(lián)質(zhì)譜確定磷酸化位點(diǎn)； 質(zhì)譜可與蛋白酶解和糖苷酶酶解結(jié)合，尋找糖肽，鑒定糖基化位點(diǎn)； 質(zhì)譜還參與糖鏈組成、結(jié)構(gòu)甚至分支情況等的分析。 ? 質(zhì)譜技術(shù)在蛋白組研究中的應(yīng)用： A 肽質(zhì)譜和肽序列分析 蛋白質(zhì)經(jīng)雙向電泳后，分離到的蛋白質(zhì)被切割下來，進(jìn)行膠內(nèi)酶解，或轉(zhuǎn)移到PVDF膜上，進(jìn)行膜上膜解，然后上樣進(jìn)行測序。 蛋白質(zhì)組研究技術(shù) 蛋白質(zhì)組主要研究技術(shù)： 雙向電泳 生物質(zhì)譜技術(shù) 蛋白質(zhì)芯片 酵母雙雜交 雙向凝膠電泳 樣品制備 （包括蛋白質(zhì)的溶解、變性及還原，從而去除非蛋白質(zhì)雜質(zhì)等） → 第一向等電聚焦 （根據(jù)蛋白質(zhì)電荷差異進(jìn)行分離） → 第二向 SDSPAGE（以蛋白質(zhì)分子量差異為基礎(chǔ)） → 蛋白質(zhì)的檢測（用考馬斯亮藍(lán)、銀染、銅染等方法）→ 圖譜數(shù)字化分析 （圖象掃描、確定每個蛋白質(zhì)點(diǎn)的等電點(diǎn)和分子量，尋找差異蛋白） 雙向電泳圖 ? 質(zhì)譜技術(shù)的基本原理： 樣品分子離子化后，根據(jù)不同離子間質(zhì)核比（ m/z）的差異來分離并確定分子量。 狹義上 , 可以指不同時期細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的變化 . ? 蛋白質(zhì)組學(xué)定義 研究蛋白質(zhì)組結(jié)構(gòu)和功能的領(lǐng)域稱為蛋白質(zhì)組學(xué) . ? 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究內(nèi)容 : 分析全部蛋白質(zhì)組所有成分以及它們的數(shù)量 。 10. 克隆到 pZErO1+里，并測序。 8. 用 Nla Ⅲ 酶切 130bp產(chǎn)物釋放 34bp雙鏈標(biāo)簽。 SAGE 步驟 6. 延伸 5秒，連接成約 130bp的雙鏈標(biāo)簽。 4. 將樣品分成兩份，連接成含有識別序列的產(chǎn)物，以備用 BsmF1消化。 2. 合成雙鏈 cDNA。 核心內(nèi)容包括 2個部分 : 1. 蛋白質(zhì)組研究體系的建立 、 完善 蛋白質(zhì)組技術(shù)體系和蛋白質(zhì)組信息學(xué)技術(shù)體系包括 :蛋白質(zhì)樣品制備和鑒定蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的研究技術(shù)等 2. 與重要的生物學(xué)問題有關(guān)的功能蛋白質(zhì)組研究 目前功能基因組研究的主要技術(shù)及應(yīng)用 ? 功能基因表達(dá)克隆 (functional cloning) ? 基因芯片 (gene chip)或基因微陣列技術(shù) (micro array) ? 基因表達(dá)系統(tǒng)分析 (serial analysis of gene expression,SAGE)或 表達(dá)序列標(biāo)簽 (expressed sequence tag,EST) ? 蛋白質(zhì)組技術(shù)
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