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蛋白質(zhì)組學(xué)ppt課件(參考版)

2025-05-06 06:01本頁面
  

【正文】 結(jié)構(gòu)基因組學(xué)( structural genomics) / 功能基因組學(xué)( functional genomics) ? 結(jié)構(gòu)基因組學(xué):以全基因組測序為目標(biāo);“ 靜態(tài)的 ” ? 功能基因組學(xué):以基因功能鑒定為目標(biāo),又稱后基因組研究; “ 動態(tài)的 ” 返 回 遺傳圖 ? 是確定基因在染色體上的位置的一種方法,根據(jù)緊密連鎖的多個基因之間的遺傳距離,決定它們之間的相對順序 ? 基因在染色體上的位置可以通過基因的交換率再轉(zhuǎn)化為遺傳圖距來表達(dá) ? 是以一段已知核苷酸序列的 DNA片段為位標(biāo),以 Mb(兆對堿基)、 Kb(千對堿基)作為圖距的基因圖 ? 物理圖有兩個要素:序列,位置 物理圖 全序列圖 ? 是全部的核苷酸序列圖譜 返 回 。蛋白質(zhì)組的研究正是探索這一領(lǐng)域的有力武器。 復(fù)雜的基因間相互作用,細(xì)胞內(nèi)活動和環(huán)境的影響都會影響基因的表達(dá)及蛋白質(zhì)的翻譯后加工 。 丹麥的一個小組利用蛋白質(zhì)組研究技術(shù)結(jié)合組織冰凍切片技術(shù)分析了 150例膀胱癌病人的組織,發(fā)現(xiàn)在所有的鱗狀細(xì)胞瘤的尿液中均能發(fā)現(xiàn)一種化學(xué)引誘劑 銀屑素( psoriasin ),推測其極可能作為這種腫瘤的早期標(biāo)志物。 癌細(xì)胞不僅有許多特異蛋白質(zhì)產(chǎn)物,而且這些產(chǎn)物還會影響其他蛋白質(zhì)的翻譯后加工及許多蛋白質(zhì)的表達(dá)水平。 在一項利用蛋白質(zhì)組研究技術(shù)進(jìn)行的酒精對人體毒性的研究中發(fā)現(xiàn),乙醇會改變血清蛋白糖基化作用,導(dǎo)致許多糖蛋白的糖基缺乏,如轉(zhuǎn)鐵蛋白。他們發(fā)現(xiàn)了一種新的蛋白質(zhì),這個蛋白質(zhì)非常相似于在乳腺癌細(xì)胞里高表達(dá)的另一種蛋白質(zhì)。 人的各種體液(血液、淋巴、脊髓、乳汁和尿等)都被用于研究與某些疾病的關(guān)系。 因此對于人類來說,一個高質(zhì)量的基本的雙向圖譜是非常有用的,它可以作為其他組織、細(xì)胞的參照圖譜。 已有的證據(jù)表明,盡管人的不同組織有著很大的功能差別, 但其中的許多蛋白質(zhì)是看家蛋白,因此它們的雙向圖譜可能也是近似的。 返 回 人類的蛋白質(zhì)組研究 人類的蛋白質(zhì)組研究吸引了最多的注意力。 返 回 果蠅的蛋白質(zhì)組研究 不同性別果蠅 (D rosophilame lanogaster)成蟲的頭、胸、腹部的蛋白質(zhì)組圖譜已被分別作出,總共約有 1200個蛋白質(zhì)被檢出。另外 11個與能量代謝、酸性核蛋白、G蛋白等對應(yīng)。其余的由于N端封閉而未能測出序列。 返 回 多細(xì)胞真核生物的蛋白質(zhì)組研究 ? 線蟲的蛋白質(zhì)組研究 ? 果蠅的蛋白質(zhì)組研究 ? 人類的蛋白質(zhì)組研究 線蟲 ()的蛋白質(zhì)組研究 利用雙向電泳技術(shù), Bini對線蟲進(jìn)行了蛋白質(zhì)組分析。大約 20%的酵母基因缺失是致死性的,另外 80%則不然,這時機體能通過調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的表達(dá)來對抗這種內(nèi)源性的變化。一些蛋白質(zhì)減少而另一些蛋白質(zhì)增多,當(dāng)然還有一些蛋白質(zhì)被加工修飾而導(dǎo)致性狀改變。 正在丹麥進(jìn)行的一項研究計劃分別作出野生型和將基因系統(tǒng)缺失的缺陷型酵母的雙向蛋白質(zhì)圖譜。它包含以下幾方面的信息: 征信息,如分子質(zhì)量、等電點、氨基酸組成、多肽片段大小等; 加工、亞細(xì)胞定位、功能分類方面的信息; 5000篇關(guān)于酵母蛋白研究的文章中獲得的有關(guān)各種蛋白質(zhì)功能、相互作用、突變表型的信息。釀酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae)基因組的完成及其蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫在互聯(lián)網(wǎng)上的建立 ,大大加速了這一工作。例如作為一種差異顯示技術(shù),這一技術(shù)已被用于比較結(jié)核分枝桿菌與牛結(jié)核分枝桿菌蛋白的不同; 結(jié)果發(fā)現(xiàn)一些在基因水平上很類似的蛋白在蛋白質(zhì)水平上有很大差別,這可能部分解釋近年來牛痘作為結(jié)核病疫苗會出現(xiàn)失敗的現(xiàn)象。 例如在研究抑制核糖體類抗生素對細(xì)菌的
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