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正文內(nèi)容

2密度泛函理論(參考版)

2024-09-05 15:13本頁面
  

【正文】 ? 先減去長程靜電力 ? 同時求解成鍵和非成鍵作用力 共 軛 梯 度 法 求 解 力 場 極 值 ? 只有一個極小值解 ! ? Ψ 可以用于判斷最優(yōu)粗?;呗? 粗 粒 化 方 法 II: Effective Force CoarseGraining (EFCG) * * Y. Wang, W. Noid, P. Liu, G. A. Voth Phys. Chem. Chem. Phys. 11, 2020 (2020). ? 顯式計算原子間作用力 ? 具有比 MSCG 更好的可移植性 ? ?? ?? ?? ? ? ?? ?? ? ? ? ? ?? ?1111???MNij DijDDDMNij ij ij DijDr R RRRFRR R R RF r R RRR???????????? ??????? ? ??? ? ? ????????? ????????RRrR??? ? ? ?11MNij ijijrr?? ????? ??。=229。162。桫邋G變分原理 : 0ddg f禮==182。 247。247。 247。驏 247。 162。 162。231。231。= +231。231。162。v差值 : 每個粗?;c(diǎn) : 有效力場形式 : ( ) ( )dCG DF fr r dd=2,113123I CGNNI AA ICGICG Iddddd dCGdddFFNNG b cff fNaaa162。 ? 系統(tǒng)擴(kuò)散過程加快。 2,113I CGNN IAA ICGICG IFFNN aaaY= 邋 vv* W. Noid, P. Liu, Y. Wang et al. J. Chem. Phys. 128, 244115 (2020). 從全原子力場出發(fā)嚴(yán)格建立粗粒化力場,不預(yù)先設(shè)定力場的函數(shù)形式。 ? 假設(shè)中心二體力的粗?;鲂问?。我們的方法從全原子作用 勢出發(fā),通過數(shù)學(xué)變換較嚴(yán)格地得到粗?;?。 ? 一些粗?;椒俣ㄗ饔脛莸暮瘮?shù)形式,然后用全原子模擬的結(jié)果定參數(shù)。而在第一性層面 上,電子及其相互作用基本局限在相應(yīng)的原子核周圍。 ? 成鍵作用( Bonded Interactions): Bonds, Valence Angles, Dihedral Angles (Torsional Angles), Improper Dihedral Angles 3. 化學(xué)和生物體系的力場 ? 非成鍵作用( Nonbonded Interactions): 范德華力和靜電力 Pande Group in Stanford Bond Dihedral Angle Valence Angle Improper Dihedral Angle Kapton unit 4. 粗?;椒? ? 類似于從第一性原理層面到全原子層面,粗?;椒D從全原子層面進(jìn)一 步簡化到粗?;?coarsegraining, CG)層面,以期大大提高計算的時間和 空間尺度。 只適用于單一金屬。 可以用于合金體系。 因?yàn)榻饘僦械膬r電子可以自由運(yùn)動, 所以一般要用多體作用描述金屬體系的力場。 ? 約化單位的換算 ? 約化單位( reduced unit) 數(shù)值模擬時使用的內(nèi)部單位,需要乘上常數(shù)才能對應(yīng)于實(shí)際體系的真實(shí)物理單位(國際單位制, SIunits)。 氬原子之間的相互作用, wikipedia ? 截斷距離( cutoff distance) :對于短程作用,大于 cutoff 的貢獻(xiàn)是常數(shù)。 1. LennardJones ( LJ)勢 ? 最常用的描述原子間范德華力的經(jīng)驗(yàn)勢。擬合參數(shù)時,往往選擇一組最關(guān)心的物理性質(zhì)進(jìn)行擬合,以求誤差盡
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