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rna提取準(zhǔn)備工作及注意事項(xiàng)-wenkub.com

2025-05-10 22:36 本頁(yè)面
   

【正文】 取出所需組織后,立即切割成厚度小于 厘米,放入含 RNAguard 的容器中即可。RNAguard 能快速抑制樣品中的內(nèi)源酶活性,確保動(dòng)物組織/細(xì)胞中的 RNA 在 37C 一天不降解,25C 一周不降解,4C 一個(gè)月不降解,20C 一年以上不降解。抽提前先在碾缽中加入適量的液氮,再將組織從液氮中取出迅速放入已加入液氮的碾缽中碾磨。如果沒(méi)有掃描數(shù)據(jù),也一定要測(cè)定 A260/A230 比值,因?yàn)樵摫戎祵?duì)所有影響酶反應(yīng)的雜質(zhì)的殘留更敏感。有興趣的話,可以在您的 RNA 樣品中加入一點(diǎn)抽提中經(jīng)常使用的試劑,如苯酚,異硫氰酸胍,PEG 等,再測(cè) A260/A280 比值。A260/A280 是一個(gè)給大家?guī)?lái)許多困惑的指標(biāo)。理論上,完整的 RNA 擁有 28S:18S = :1 的比例,大部分資料則強(qiáng)調(diào) 28S:18S = 2:1 的比例。有時(shí)候,液氮碾磨過(guò)程中也會(huì)出現(xiàn)樣品的融化;或者冷凍樣品不經(jīng)過(guò)液氮碾磨直接加入裂解液中,在徹底勻漿前肯定會(huì)出現(xiàn)融化。目前,商品化的 RNA 抽提試劑經(jīng)過(guò)小量調(diào)整,可以適合幾乎所有的動(dòng)物組織,但卻沒(méi)有一種商品化的 RNA 抽提試劑,可以適合大部分植物組織。一般,大家都是在液氮條件下對(duì)植物進(jìn)行碾磨的,所以?xún)?nèi)源酶作用使 RNA 降解的現(xiàn)象不常見(jiàn)。多次PCI抽提可以去除更多殘留的 DNA。必須用氯仿再次對(duì)上清進(jìn)行抽提。1特殊組織的抽提1)纖維組織:心臟/骨骼肌等纖維組織抽提 RNA 關(guān)鍵在徹底破碎組織?;煸蕰r(shí)不能太溫和,也不要試圖取出全部上清。小心取上清 (8090%)。RNA 的丟失可以用反抽方法或者去除有機(jī)層后再離心的方法降低。電動(dòng)勻漿比其它勻漿方法效果更好,但也可能需要結(jié)合其它得方法,如液氮搗碎,酶消化 (Lysozyme/Lyticase)2:抽提方法的優(yōu)化。10:合適的保存方法 – 短時(shí)間可以 –20C 保存,長(zhǎng)期請(qǐng)保存于 –80C。7:降低外源酶的污染 – 不能從外面又導(dǎo)入酶。RTPCR 對(duì)純度 (酶抑制物殘留) 要求很高。10)后續(xù)實(shí)驗(yàn)所用的酶酶均有可能被 Rnase 污染。7)質(zhì)粒抽提質(zhì)粒抽提往往用到 Rnase 降解 RNA,殘留的 Rnase 要用 Proteinase K 消化,PCI 抽提。4)實(shí)驗(yàn)臺(tái)面最起碼要用 75% 的酒精棉球搽拭干凈。戴手套口罩的另外的好處是保護(hù)實(shí)驗(yàn)人員。紀(jì)律三:明確自己的抽提目的注意七:任何裂解液系統(tǒng)在接近樣品最大起始量時(shí),抽提成功率急劇下降。注意三:實(shí)驗(yàn)所涉及的試劑/溶液,尤其是水,必須確保 RNaseFree。柱離心式純化方法抽提速度快,能有效去除影響 RNA 后續(xù)酶反應(yīng)的雜質(zhì),但價(jià)格較貴;使用經(jīng)濟(jì)而經(jīng)典的純化方法,如 LiCl 沉淀等,也可以獲得滿(mǎn)意的結(jié)果,但操作時(shí)間長(zhǎng)。裂解液的選擇 – 影響操作方便程度,內(nèi)源雜質(zhì)殘留的因素常用的裂解液幾乎都能抑制 Rnase 活性,因此,選擇裂解液的重點(diǎn)是要結(jié)合純化方法一起考慮。細(xì)胞無(wú)須破碎即可直接勻漿,組織需要破碎后才能勻漿,酵母菌和細(xì)菌需要先用相應(yīng)的酶破壁后才能
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