分子生物學(xué)第三章生物信息的傳遞上-wenkub.com
2025-01-10 08:02 本頁(yè)面
【正文】 ?核仁 RNA(snoRNAs)能通過(guò)堿基配對(duì)的方式，把 rRNA分子上需要修飾的位點(diǎn)找出來(lái)。 ? RNA編輯的另一種形式是 尿苷酸的缺失和添加 。載脂蛋白基因編碼區(qū)共有 4563個(gè)密碼子，在所有組織中其 DNA序列都相同。5OH作為親核基團(tuán)攻擊內(nèi)含子 3?位核苷酸上的磷酸二酯鍵，使內(nèi)含子被完全切開，上下游兩個(gè)外顯子通過(guò)新的磷酸二酯鍵相連。在 I類內(nèi)含子切除體系中，鳥苷或鳥苷酸的 339。 ?哺乳動(dòng)物細(xì)胞中， mRNA前體上的snRNP是從 5?向下游 “掃描 ”，選擇在分支點(diǎn)富嘧啶區(qū) 3?下游的第一個(gè) AG作為剪接的 3?受點(diǎn)。 ? mRNA﹢ snRNP→ RNARNP復(fù)合物。 ?內(nèi)含子內(nèi)部的部分序列都有可能參與內(nèi)含子的剪接。內(nèi)含子在真核基因中所占的比例很高，可超過(guò) 99%。5 內(nèi)含子的剪接、編輯 及化學(xué)修飾 3 依賴于 ρ因子的終止 ?ρ因子是 NTP酶 ，它催化 NTP的水解促使新生 RNA鏈從三元轉(zhuǎn)錄復(fù)合物中解離出來(lái)而終止轉(zhuǎn)錄。 ?寡聚 U的存在使雜合鏈的 3?端部分出現(xiàn) 不穩(wěn)定的 rU4 ?約 1/3的 poly(A)－ mRNA編碼了不同形式的組蛋白，其余 2/3的 poly(A)－ mRNA帶有與 poly(A)+組分相同的遺傳信息。 ? mRNA剛進(jìn)胞質(zhì)時(shí)其 poly(A)較長(zhǎng)，隨著時(shí)間延長(zhǎng)， poly(A)逐漸變短消失， mRNA開始降解。 ?RNA聚合酶 Ⅱ 在 poly(A)起始位點(diǎn)不終止而繼續(xù)轉(zhuǎn)錄，大多基因初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物擁有該位點(diǎn)下游 0 ?poly(A)序列是在轉(zhuǎn)錄后加上去的，是在細(xì)胞核中的不均一核 RNA階段加上的。 ?mRNA539。 ?在某些生物細(xì)胞內(nèi)， mRNA鏈上的第三個(gè)核苷酸的 2?OH位也可能被甲基化，被稱為 2號(hào)帽子（ cap2），占有帽mRNA總量的 10%～ 15%。 ? mRNA的帽子結(jié)構(gòu)常常被甲基化。OH位與下一個(gè)核苷酸的 5?磷酸基團(tuán)形成二酯鍵，轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的起始序列為 pppApNpNp…… ?但如果在體外用核酸酶處理成熟 mRNA。 ?基因 的分子生物學(xué)定義是 :產(chǎn)生一條多肽鏈的功能 RNA所必需的 全部DNA核苷酸序列 ! ?真核生物 mRNA結(jié)構(gòu)上的最大特征是 539。 3. 原核生物 mRNA的 5?端無(wú)帽子結(jié) 構(gòu)， 3?端無(wú)或者只有較短的 poly (A)結(jié)構(gòu)。 ?對(duì)第一個(gè)順?lè)醋觼?lái)說(shuō)，一旦 mRNA的 5?端被合成，翻譯起始位點(diǎn)即可與核糖體相結(jié)合，而后面幾個(gè)順?lè)醋臃g的起始就會(huì)受其上游順?lè)醋咏Y(jié)構(gòu)的調(diào)控。多順?lè)醋?mRNA是一組相鄰基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物 , 這一組基因被稱為一個(gè)操縱子。 ?因?yàn)榛蜣D(zhuǎn)錄和多鏈肽延伸的速度基本相同， 所以細(xì)胞內(nèi)某一基因產(chǎn)物 (蛋白質(zhì) )的多少?zèng)Q定于轉(zhuǎn)錄和翻譯的起始效率。轉(zhuǎn)錄開始 1 min后，降解就開始了，當(dāng) mRNA的 539。33 ?原核生物中， mRNA的轉(zhuǎn)錄和翻譯不僅發(fā)生在 同一個(gè) 細(xì)胞空間里，而且這兩個(gè)過(guò)程幾乎是 同步 進(jìn)行的，蛋白質(zhì)合成往往在 mRNA剛開始轉(zhuǎn)錄時(shí)就被引發(fā)。目前，人們己能從幾乎所有生物體內(nèi)分離純化編碼任何蛋白質(zhì)的 mRNA。 原核與真核生物 mRNA的特征比較 ? mRNA在大腸桿菌細(xì)胞內(nèi)占總 RNA的2%左右 (tRNA占 16%，而 rRNA則占80%以上 )。 ?在 TATA區(qū)和相鄰的 UPE區(qū)之間插入核苷酸也會(huì)使轉(zhuǎn)錄減弱。 ?真核基因的調(diào)控區(qū)較大， TATA A/TA區(qū)位于 20～ 30， 40～ 110區(qū)為上游激活區(qū)， CAAT區(qū) (70～ 78區(qū) )，大多基因還擁有 GC區(qū)和增強(qiáng)子區(qū)。 真核生物啟動(dòng)子對(duì)轉(zhuǎn)錄的影響 ?啟動(dòng)子是確保轉(zhuǎn)錄 精確 而 有效地起始的 DNA序列 (TATA box)。 真核生物啟動(dòng)子對(duì)轉(zhuǎn)錄的影響 ? 啟動(dòng)子是確保轉(zhuǎn)錄 精確 而 有效地起始 的 DNA序列 。 ? 保留其一或?qū)⑵洳逯?DNA分子的任何部位，可保持基因的正常轉(zhuǎn)錄。 3 ?另一類為 上升突變 (up mutation)，即增加 Pribnow區(qū)共同序列的同一性， 提高基因的轉(zhuǎn)錄水平 。 ? DNA開鏈?zhǔn)前凑?DNA模板序列正確引入核苷酸底物的必要條件。堿基中的某些基團(tuán)是氫鍵受體和氫鍵供體處于 DNA雙螺旋的大溝或小溝內(nèi)，因此都具有特定的方位 . 啟動(dòng)子區(qū)的識(shí)別 ?酶分子 中也有處于特定空間構(gòu)象的氫鍵受體與供體，當(dāng)它們與啟動(dòng)子中對(duì)應(yīng)的分子在一定距離內(nèi)互補(bǔ)時(shí)，就 形成氫鍵 ， 相互結(jié)合 。 ? 10位的 TATA區(qū)和 35位的 TGACA區(qū)是RNA聚合酶與啟動(dòng)子的結(jié)合位點(diǎn)，能與σ因子相互識(shí)別而具有很高的親和力 。 ?啟動(dòng)子區(qū)是 RNA聚合酶的結(jié)合區(qū)，啟動(dòng)子區(qū)有什么結(jié)構(gòu)特點(diǎn)呢 ? ? Pribnow設(shè)計(jì)了一個(gè)實(shí)驗(yàn)，他把 RNA聚合酶全酶與模板 DNA結(jié)合后，用 DNaseI水解DNA，然后用酚抽提，沉淀純化 DNA后得到一個(gè)被 RNA聚合酶保護(hù)的 DNA片段，約有 41~44個(gè)核苷酸對(duì)。 ?在細(xì)菌中，一個(gè)轉(zhuǎn)錄單元可以是一個(gè)基因，也可以是幾個(gè)基因。 ?轉(zhuǎn)錄的起始是基因表達(dá)的關(guān)鍵階段，而這一階段的重要問(wèn)題是 RNA聚合酶與啟動(dòng)子的相互作用。端上游的DNA序列，能活化 RNA聚合酶，使之與模板 DNA準(zhǔn)確地結(jié)合并具有轉(zhuǎn)錄起始的特異性。2 啟動(dòng)子與轉(zhuǎn)錄起始 ?大腸桿菌 RNA聚合酶與啟動(dòng)子的相互作用主要包括啟動(dòng)子區(qū)的識(shí)別、酶與啟動(dòng)子的結(jié)合及 σ因子的結(jié)合與解離。 ?轉(zhuǎn)錄延伸復(fù)合物是轉(zhuǎn)錄循環(huán)中一個(gè)十分重要的環(huán)節(jié)。核心酶的產(chǎn)物是不均一的，因?yàn)樗鼪](méi)有固定的起始位點(diǎn)，而且 DNA兩條鏈都可作為模板。 ?三元復(fù)合物可以進(jìn)入兩條不同的反應(yīng)途徑，一是合成并釋放 2～ 9個(gè)核苷酸的短 RNA轉(zhuǎn)錄物－－ 流產(chǎn)式起始 . ?二是 盡快釋放 σ亞基 ，轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物通過(guò)上游啟動(dòng)子區(qū)并生成由核心酶、 DNA和新生 RNA所組成的 轉(zhuǎn)錄延伸復(fù)合物 。2 轉(zhuǎn)錄復(fù)合物 伴隨著 DNA
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