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豬育種中遺傳知識(shí)手冊(cè)-資料下載頁(yè)

2025-06-28 05:07本頁(yè)面
  

【正文】 能不同,甚至與在不同環(huán)境下飼養(yǎng)的半同胞組也不同。環(huán)境相似性的效應(yīng)將會(huì)降低估計(jì)育種值的準(zhǔn)確性。使用全同胞記錄和 的環(huán)境相關(guān)(c 2)來(lái)解釋環(huán)境相關(guān)的效應(yīng)。共同的環(huán)境效應(yīng)引起了準(zhǔn)確性的下降,因?yàn)橄嗨菩缘囊徊糠质怯煞沁z傳因素引起的。表 (c 2)情況下的準(zhǔn)確度。遺傳力c2c2c2c2全同胞數(shù)0 0 0 0 1 3 5 10 后代性能記錄有些性狀不可能在兩個(gè)性別都表達(dá)出來(lái)(限性性狀),或者有些數(shù)據(jù)不能在育種個(gè)體收集到。這樣性狀的例子是公豬的產(chǎn)仔數(shù),窩重和泌乳能力。還有育種個(gè)體的胴體性狀。通常使用后裔測(cè)定來(lái)估計(jì)公豬的育種值,因?yàn)樵谳^短的時(shí)期內(nèi),公豬留下的后代要比母豬多。通常使用全同胞或同父的半同胞后裔記錄估計(jì)育種值。同父半同胞指父相同,母親不同。當(dāng)遺傳力一定時(shí),隨著后代數(shù)的增加,估計(jì)值準(zhǔn)確度也隨之增加。而增加的幅度取決于已經(jīng)有多少后代的記錄被用。如從1 增加到 5 個(gè)后代的準(zhǔn)確度的增幅大于從 60 增加到 64 個(gè)的準(zhǔn)確度的增幅。自身、同胞和后裔記錄的組合不同資料的組合也能提高 EBV 的準(zhǔn)確性,而且保持選擇反應(yīng)在可信的水平。豬的性能記錄的收集通常包括自身,全同胞和半同胞的記錄,如果它作為種豬留下來(lái),它的資料對(duì)它的全同胞和半同胞后裔都是可以利用的。表 4 給出了不同遺傳力不同記錄來(lái)源的準(zhǔn)確度情況。表 4. 不同遺傳力不同記錄來(lái)源的準(zhǔn)確度情況(環(huán)境相關(guān)假定為 0)記錄來(lái)源 h2= h2= h2=只有兩個(gè)父母 個(gè)體自身記錄 個(gè)體自身+2 個(gè)父母 24 / 79個(gè)體自身+5 個(gè)全同胞 個(gè)體自身+10 個(gè)全同胞 個(gè)體自身+10 個(gè)半同胞 個(gè)體自身+50 個(gè)半同胞 個(gè)體自身+5 個(gè)半同胞后代 個(gè)體自身+10 個(gè)半同胞后代 個(gè)體自身+40 個(gè)半同胞后代 在高遺傳力的性狀,個(gè)體本身的記錄的得到的準(zhǔn)確度相對(duì)較高。在高遺傳力的性狀,在個(gè)體記錄的基礎(chǔ)上,如果加上后代或父代的資料,除非數(shù)量很大,否則準(zhǔn)確度變化很小。在低遺傳力的性狀,加上同胞和/或后裔記錄,準(zhǔn)確度能得到顯著的提高。比較表 4 中遺傳力等于 時(shí),個(gè)體+10 個(gè)半同胞與個(gè)體+10 個(gè)半同胞后代間準(zhǔn)確度的比較。準(zhǔn)確度從 到 到 ,一個(gè)明顯的增加。然而,等待大批后代出生參加測(cè)定會(huì)花費(fèi)很多金錢(qián)和時(shí)間,延長(zhǎng)了世代間隔降低了選擇強(qiáng)度。通常,盡可能的獲得多的后代資料,把這些資料與被評(píng)估個(gè)體自身資料合到一起,對(duì)于低遺傳力(低于 )的性狀很適合。高遺傳力的性狀不需要太多的后裔或其它親屬的資料,如果個(gè)體自身的資料可以利用,準(zhǔn)確度就可以達(dá)到可以接受的水平。記住,所有的遺傳改良方案都有一個(gè)良好的記錄系統(tǒng)。在你的群體里盡可能的收集性能記錄,這樣你可以使用各種記錄的組合來(lái)評(píng)估個(gè)體而不降低遺傳進(jìn)展。當(dāng)然只有最好的記錄系統(tǒng)是不夠的,還必須使用這些記錄作出選擇決斷。25 / 79估計(jì)遺傳價(jià)值—NSIFFS8前言每個(gè)個(gè)體測(cè)定的記錄都包括兩個(gè)部分:遺傳部分和環(huán)境部分。遺傳部分是個(gè)體具有的基因作用的結(jié)果。為獲得遺傳進(jìn)展而進(jìn)行的選擇僅作用于遺傳部分,而不是總是與測(cè)定有關(guān)聯(lián)的環(huán)境部分。環(huán)境部分不能世代傳遞,所有當(dāng)決定動(dòng)物的遺傳值時(shí),需要對(duì)環(huán)境部分進(jìn)行解釋。一些環(huán)境因素可以用數(shù)學(xué)方法解釋?zhuān)缒肛i的胎次和小豬的性別。然而,其它的一些因素如健康,飼料和管理可以影響豬的性能,但不能輕易的被解釋。這些被認(rèn)為是環(huán)境變異中未知的部分。解釋未知環(huán)境效應(yīng)的最好方法是比較處于相同環(huán)境下的動(dòng)物。如果飼養(yǎng)一組動(dòng)物,想讓它們?cè)谙嗨频臈l件下反應(yīng)未知的環(huán)境效應(yīng),這就形成了同齡組。同齡組定義為具有相同的品種,性別和相似的日齡的一組被在相同的條件下管理的個(gè)體。彼此間在 30 天內(nèi)斷奶的杜洛克公豬并在一個(gè)欄位飼養(yǎng),這就是同齡組的一個(gè)例子。這些小豬日齡接近,品種性別相同,所以我們預(yù)計(jì)它們能夠相似的反應(yīng)未知的效應(yīng)。它們?cè)谝黄痫曫B(yǎng),因此有相同的飼料,氣候和健康等效應(yīng)。作為控制非遺傳效應(yīng)的一種手段,同齡組的概念對(duì)動(dòng)物育種和遺傳改良都是很基本的。離差和比率通過(guò)比較同齡組內(nèi)的每個(gè)個(gè)體與同齡組的均值,我們可以確定組內(nèi)每個(gè)個(gè)體精確的遺傳品質(zhì)的估計(jì)值。通過(guò)兩種普通的方法就很容易的作出比較:離差和比率。離差方法就是組內(nèi)個(gè)體的性能與該組的性能平均值之間的差。比率方法就是組內(nèi)個(gè)體的性能與該組的性能平均值之間的比,再把得到的結(jié)果乘以 100。例如,一個(gè)公豬的增重速度是 2 磅/天,它所在的同齡組的平均值是 磅/天。它的離差就是+ 磅/天( 磅) ,它的比率就是(247。)100=133。所以這頭公豬比它的同齡組的平均水平快 磅/天或快 33%(133100) 。離差的好處是它以測(cè)定性狀的測(cè)定單位表示,但我們必須知道這個(gè)性狀的平均值和從這個(gè)平均值得到的離差的變異。比率的好處是不必知道與這個(gè)性狀相關(guān)的可變性,平均比率總是 100。125 的比率表示無(wú)論在討論什么性狀,它比同齡組要好 25%。離差和比率應(yīng)該只在同齡組內(nèi)的個(gè)體比較,因?yàn)椴煌耐g組由不同的個(gè)體數(shù)量和不同的環(huán)境組成。而且,在兩個(gè)不同的同齡組的個(gè)體的遺傳能力也可能不同。來(lái)自兩個(gè)場(chǎng)的兩個(gè)同齡組的生長(zhǎng)速度的離差可能表示不同的意義??匆幌孪旅娴臄嗄毯笊L(zhǎng)速度的例子: 與同齡組均值的離差 同齡組的遺傳均值 實(shí)際的生長(zhǎng)速度 公豬 A + 公豬 B + 如果你根據(jù)最大的離差選擇公豬,你可能會(huì)選公豬 A。然而,因?yàn)橐驗(yàn)榈诙€(gè)同齡組的遺傳能力更強(qiáng),所以最好的公豬應(yīng)該是公豬 B。即便它的離差僅為26 / 79,但它的生長(zhǎng)速度的遺傳潛力大于公豬 A,因?yàn)楣i B 的同齡組的遺傳均值高于公豬 A 的( vs 磅/天) 。所以離差和比率只能用在所在的同齡組內(nèi)進(jìn)行選擇。在同齡組間進(jìn)行離差和比率會(huì)導(dǎo)致不正確的選擇,從而降低遺傳進(jìn)展。估計(jì)育種值真實(shí)育種值的概念在本系列資料簡(jiǎn)報(bào)中已經(jīng)討論過(guò)了。一個(gè)豬的任何性狀的真實(shí)育種值實(shí)際上是不可能知道的,因?yàn)樗豢赡鼙恢苯雍饬?。所以就需要一些預(yù)測(cè)或估計(jì)性狀育種值的方法。預(yù)測(cè)育種值眾所周知就是 EBVs,它來(lái)自遺傳理論對(duì)性能記錄的應(yīng)用。根據(jù)可利用的資料,可以使用幾種方法計(jì)算 EBVs。所有的方法都是根據(jù)個(gè)體或親屬與各自的同齡組的離差,然后再乘以加權(quán)因子。一種最簡(jiǎn)單的情況,只有個(gè)體自身的記錄,公式是:EBV=b(PPAVERAGE )b 是加權(quán)因子,在這種情況下,b 就是遺傳力(h2) ,或是遺傳變異的部分.P 是個(gè)體的記錄.PAVERAGE是個(gè)體同齡組的均值.一個(gè)例子如下,公豬 A 的校正背膘是 ,它的同齡組的均值是。設(shè)背膘的遺傳力是 ,那么公豬 A 的背膘 EBV 就是 ()=。這表明在遺傳上它要比它的同齡組背膘薄 。當(dāng)有更多的資料(全同胞,半同胞,后裔等)可以利用時(shí),公式擴(kuò)展到包括所有來(lái)源的公式:EBV=b1(P1PAVER1)+ b2(P2PAVER2)+ b3(P3PAVER3)EBV 是豬的估計(jì)育種值.b1,b 2,b 3 是與豬 1 有聯(lián)系的全同胞,半同胞和后裔記錄的加權(quán)因子.P1,P 2,P 3 是與豬 1 有聯(lián)系的全同胞,半同胞和后裔記錄或記錄均值.PAVER1,P AVER2,P AVER3 是與豬 1 有聯(lián)系的全同胞,半同胞和后裔所在的同齡組。這叫做選擇指數(shù),因?yàn)樗褂昧藥讉€(gè)來(lái)源的資料來(lái)估計(jì)一個(gè)豬的遺傳價(jià)值。加權(quán)因子變化取決于幾個(gè)因素,包括資料的來(lái)源,遺傳力,系譜相關(guān)和遺傳相關(guān)等。在親屬這個(gè)問(wèn)題上,知道親屬(同胞,后裔)所在組的均值是足夠的。對(duì)諸如產(chǎn)仔數(shù)的數(shù)據(jù),每個(gè)母豬能有 4 到 5 個(gè)記錄。盡可能多的利用記錄可以提高估計(jì)育種值的準(zhǔn)確性。資料的來(lái)源必須已知。記錄可能來(lái)自全同胞,半同胞,后裔,其它組的相關(guān)性狀。通常,遺傳力的增加,或資料數(shù)量的增加,如更多的資料來(lái)源,更大的組,個(gè)體的或相關(guān)性狀的更多的記錄都會(huì)增加估計(jì)育種值的準(zhǔn)確性。性狀的遺傳力對(duì)估計(jì)育種值是很重要的。遺傳力可以簡(jiǎn)單的定義為性狀中可觀測(cè)的遺傳控制或育種值的變異的比例。高遺傳力的性狀表明,個(gè)體自身的記錄就是育種值的一個(gè)好的估計(jì)值。低遺傳力的性狀表明,個(gè)體性能與育種值的關(guān)系要小一些,個(gè)體記錄不可能很好的代表育種值。當(dāng)親屬的記錄可以利用時(shí),系譜關(guān)系就變的很重要。這種關(guān)系度量了系譜中兩個(gè)個(gè)體育種值的相關(guān)。同胞資料對(duì)個(gè)體育種值估計(jì)的貢獻(xiàn)要大于表兄妹。兩個(gè)個(gè)體的關(guān)系越密切,彼此間的資料對(duì)估計(jì)育種值就重要。遺傳相關(guān)時(shí)有用的,因?yàn)橐粋€(gè)性狀的資料可以用來(lái)預(yù)測(cè)另一個(gè)性狀的育種值。27 / 79同那些沒(méi)有從與它有遺傳相關(guān)的性狀獲得的資料的估計(jì)相比,通過(guò)遺傳相關(guān)可以把另一個(gè)相關(guān)性狀記錄的使用作為進(jìn)一步提高估計(jì)育種值的一種有效手段。EBVs 是一頭豬的一個(gè)性狀的遺傳值的估計(jì)值,可以預(yù)測(cè)后代的性能。EBV也可以表示為離差和均值,群體的平均 EBV 是 0(表示為離差) ,或 100(比率) 。這兩個(gè)方法都可以使用,所以作出選擇決定前,要確定一種方法。期望后代差異(expected progeny difference)一個(gè)個(gè)體的總的估計(jì)遺傳值叫做 EBV,但是一個(gè)豬只能把抽樣的 1/2 的遺傳值(基因)傳遞給后代。使用期望后代差異(EPD )這個(gè)名字是表示一頭豬遺傳值的 1/2 可以傳給后代。所以 EPD 就是 EBV 的 1/2。一個(gè)群體的平均 EPDs 等于 0,EPDs 可以表示為比率,但目前的通用格式是離差。EPD 的概念很容易理解,因?yàn)樗嬲念A(yù)測(cè)了后代的性能差異。如果一頭公豬的 EPD 是+ 磅/天,就可以預(yù)計(jì)這頭公豬的后代比所有公豬后代的生長(zhǎng)速度均值要快 磅/天。EPD的另外一個(gè)特點(diǎn)是對(duì)同一個(gè)同齡組的兩個(gè)被評(píng)估個(gè)體間是可比的,對(duì)通過(guò)親屬關(guān)系聯(lián)系的兩個(gè)同齡組的評(píng)估個(gè)體也是可以比較的。例如,現(xiàn)在有兩個(gè)公豬,公豬A 的背膘的 EPD ,公豬 B 的背膘的 EPD ,公豬 B 的后代預(yù)計(jì)要比公豬 A 的后代背膘薄 。所以,EPDs 不僅在估計(jì)個(gè)體作為父本的遺傳價(jià)值是有用的,而且在比較兩個(gè)后備個(gè)體,決定留種與否也是很有用的。通過(guò)有計(jì)劃的配種,應(yīng)用 EBVs 和 EPDs 來(lái)預(yù)測(cè)后代的性能。然而,記住EBV 和 EPD 之間的不同,以便可以準(zhǔn)確的計(jì)算估計(jì)后代性能。因?yàn)橐粋€(gè)個(gè)體只傳遞育種值的 1/2 給后代,這一點(diǎn)必須考慮。下面的例子將幫助理解這一點(diǎn):假設(shè)公豬到 230 磅的 EBV 是6 天,母豬是2 天,預(yù)計(jì)它們的后代到達(dá) 230 磅的EBV 將是4 天。把公母豬的 EBV 加到一起再除以 2((6+ 2)247。2=4) 。下面通過(guò) EPD 計(jì)算。公豬的 EBV 是6 天,所以它的 EPD 是3(61/2=3) ,同理,母豬的 EPD 是1 天。因?yàn)?EPD 已經(jīng)代表了父母?jìng)鬟f給后代的 1/2,所以預(yù)測(cè)的后代性能就是它們簡(jiǎn)單的和。這個(gè)例子里,估計(jì)后代性能是4 天。所以理解EBV 或 EPD 在遺傳評(píng)估中是重要的 。準(zhǔn)確度和可能變化準(zhǔn)確度值(ACC )與 EBVs 和 EPDs 有關(guān),是一個(gè)估計(jì)值可靠性和確定性的概念。ACC 范圍從 0 到 1,值越高表示越準(zhǔn)確或越可靠。一個(gè)準(zhǔn)確度是 的EBV 不是很可靠的,可能由于收集的資料的增加而發(fā)生變化。一個(gè) 的準(zhǔn)確度值表示這個(gè)育種值的估計(jì)十分可靠,即使再增加更多的資料,預(yù)計(jì)變化很小。這說(shuō)明關(guān)于 ACC 值,還有一些別的重要的東西。通常,低的準(zhǔn)確度值是因?yàn)閷?duì)于被評(píng)估個(gè)體的可用的數(shù)據(jù)很少造成的,或是評(píng)估性狀的遺傳力很低。隨著更多的資料輸入到數(shù)據(jù)庫(kù)中,可能有全同胞,半同胞和后裔的記錄,估計(jì)值的準(zhǔn)確度或可靠性就增加了。因此,準(zhǔn)確度值表示在計(jì)算 EBV 或 EPD 的過(guò)程中使用了多少資料。ACC 值低表示用的資料很少,更大的值說(shuō)明在估計(jì)育種值的計(jì)算中永樂(lè)更多的資料??赡茏兓≒C)是另一種表示遺傳品質(zhì)估計(jì)值準(zhǔn)確性或可靠性的一種方式。PC 通常只用于 EPDs,因?yàn)樗鼈兏菀子靡噪x差形式表達(dá)的估計(jì)值解釋。一個(gè)28 / 79PC 表達(dá)為177。值。例如一個(gè)公豬到 230 磅日齡的 EPD 是12177。3 天。PC 對(duì) EPD 給出了一個(gè)上限和下限的范圍,我們可以預(yù)計(jì)它的后代的差值有 67%的可能在這個(gè)范圍內(nèi)。在這個(gè)例子里,EPD 是12 天,如果我們猜想它的后代差值是 9(12+3)到 15(123) ,它的準(zhǔn)確度就是 2/3(67%) 。PC 的一個(gè)好的特點(diǎn)是如果67%的置信水平不夠高,可以簡(jiǎn)單的是 PC 值翻倍,準(zhǔn)確度到達(dá)到 95%。如果我們猜想它的后代差值是6(12+6 )到18(126) ,它的準(zhǔn)確度就是 95/100(95%) 。PC 值強(qiáng)調(diào)這個(gè)事實(shí):EPDs 隨時(shí)間發(fā)生變化,尤其在加入了很多新的資料后。PC 值越小,后代差值的估計(jì)值就準(zhǔn)確和可靠。這與 ACC 值是相反的,ACC 值越高,就說(shuō)明越可靠??偨Y(jié)遺傳價(jià)值的估計(jì)值,無(wú)論是 EBVs 還是 EPDs,對(duì)育種者都是很有用的手段。它們是一個(gè)動(dòng)物的最佳估計(jì)值。選擇方案的進(jìn)展和成功取決于估計(jì)遺傳價(jià)值的準(zhǔn)確性和在選擇時(shí)使用這些估計(jì)值的能力。29 / 79選擇在遺傳改良中的應(yīng)用—NSIFFS9如果遺傳改良以很快的速度進(jìn)行,選擇概念的正確使用就是很必要的。所以種豬育種者和商品豬生產(chǎn)者需要完全理解選擇的原理,它直接影響著每年獲得的遺傳改良量。本篇資料簡(jiǎn)報(bào)說(shuō)明一些對(duì)理解遺傳改良有幫助的基本的,必須的概念。然后,討論一下把選擇概念應(yīng)用于遺傳改
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