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遺傳連鎖分析ppt課件-資料下載頁

2025-05-02 12:04本頁面
  

【正文】 對位置,再根據(jù)相對位置把基因標(biāo)志在染色體上,繪制成圖,這種圖稱為 連鎖遺傳圖 。 ● 基因定位的方法: 兩點(diǎn)測驗(yàn) 三點(diǎn)測驗(yàn) 166 167 ( 1)兩點(diǎn)測交與三點(diǎn)測交 摩爾根( 1911)曾提出設(shè)想,重組值可能是由 兩個基因在染色體上的距離決定的。 研究重組值問題,最容易想到的方法就是研究幾 個相互連鎖的基因間的重組值之間的關(guān)系。 例如: a — b — c 連鎖 ?? ab bc ac 要確定三個重組值,要做三次雜交試驗(yàn) 168 但摩爾根和他的學(xué)生 sturtevant 利用 三點(diǎn)測交( threepoint test cross) 即三點(diǎn)試驗(yàn): 用三雜合體 abc/+++ 或 ab+/++c 跟三隱性個體 abc/abc 測交: abc/+++ abc/abc 或 ab+/++c abc/abc 這樣可以把 3 個基因包括在同一次交配中,一次試驗(yàn)就等于三次 “ 兩點(diǎn) ” 試驗(yàn)。 169 兩個優(yōu)點(diǎn): ( 1)一次三點(diǎn)試驗(yàn)中得到的三個重組值是在同一基因型背景,同一環(huán)境條件下得到的;而三次“兩點(diǎn)試驗(yàn)”就不一定這樣。重組值既受基因背景的影響,也受各種環(huán)境條件的影響。所以只有從三點(diǎn)試驗(yàn)得到的三個重組值才嚴(yán)格地可以相互比較。 ( 2)通過三點(diǎn)試驗(yàn)還可得到三次兩點(diǎn)試驗(yàn)不能得到的關(guān)于雙交換的資料。 170 例:黑腹果蠅的三點(diǎn)試驗(yàn)三個突變基因 X連鎖 ec (echinus,棘眼 ) sc (scute,缺少某些胸部剛毛 ) cv (crossveinless,翅上橫脈缺失 ) 三雜合體 三隱性雄蠅 ec + + /+ sc cv ecsccv/Y (基因次序未知 ) 171 表 型 實(shí)得數(shù) ec + + 810 + sc cv 828 ec sc + 62 + + cv 88 + sc + 89 ec + cv 103 合計(jì) 1980 172 重組值計(jì)算: ( 1) ecsc的重組值。 暫不考慮 +/cv 將它放在括弧中, 只考慮 ecsc這兩個基因。 親組合: 810+828+89+103=1830 重組合: 62+88=150 RF( ecsc) =重組合 /(親組合+重組合 ) 100%=150/(1830+150) 100%=% 1980 173 ∵ Recsc=% ∴ 根據(jù)圖距的概念,去掉%后,就 可作為兩基因在遺傳學(xué)圖上的圖距 . 174 ( 2) eccv的重組值 這里暫不考慮 sc/+的存在: 親組合: 810+828+62+88=1788 重組合: 89+103=192 RF (eccv) =192/(1788+192) =% 175 ec與 cv在遺傳圖上的圖距是: ecsc間的圖距是 , eccv間的圖距是 這時對于 ec sc cv 這三個基因間的關(guān)系有兩種畫法: 或 176 ( 3)最后看 sccv間的重組值 親組合: 810+828=1638 重組合: 62+88+89+103=342 RF( sccv) =342/1980=% ? 圖距是 ,三個基因的線性關(guān)系我們 可以畫為: 177 三個重組值間的關(guān)系十分明確: 即 sccv的重組值等于 scec重組值與 eccv重組值之和: %+%=% 直線關(guān)系 ? 本試驗(yàn)三個基因的直線順序是 sceccv。 根據(jù)摩爾根的假設(shè),就是: 基因在染色體上按該次序作直線排列。 現(xiàn)按照 sceccv的順序,將最初的資料重新排列,算出百分?jǐn)?shù),并注明重組發(fā)生在哪兩個基因之間,這樣重組值的計(jì)算就顯得方便。 178 表型 實(shí)得數(shù) 比例 重組發(fā)生在 scec eccv sccv + ec + sc + cv 810 828 % sc ec + + + cv 62 88 % √ √ sc + + + ec cv 89 103 % √ √ 合 計(jì) 1980 100% % % % 表:三點(diǎn)試驗(yàn)中,重組值的計(jì)算 + ec +/sc + cv sc ec cv/Y 179 上面的測交后代中只有 6種表現(xiàn),因此重組值之間的關(guān)系比較簡單。在多數(shù)三點(diǎn)試驗(yàn)中,回交后代可以有 8種表型,請見下例: 三個基因是: ec (棘眼 )、 ct (cut,截翅 ) 、 cv (橫脈缺失 ) 把棘眼截翅個體與橫脈缺失個體交配,得到三雜合體: ec ct + / + + cv 然后進(jìn)行: ec ct + / + + cv ec ct cv/Y 180 181 182 根據(jù)上表: RF eccv的重組值: %+%= % RF ctcv: %+%= % RF ecct: % RF eccv+ RF ctcv ≠ RFecct %+ %=% > % 我們應(yīng)該注意到,有 8只果蠅 (+++和 eccvct),計(jì)算時用過兩次,計(jì)算 RF eccv用到它,計(jì)算 RFctcv又用到它,但計(jì)算 RF ecct 時卻沒有把它計(jì)算在內(nèi),雖然這些染色體在 ecct間已進(jìn)行過兩次交換。 183 如下圖,對 ecct 來講,雙交換的結(jié)果,對它們來說等于不交換。只有當(dāng)基因?qū)?cv/+存在時,我們才能認(rèn)識出交換。這樣 RF ecct 值在計(jì)算時,就會偏低,所以如有雙交換存在時,在計(jì)算 ecct間的距離時,一定要加上兩倍的雙交換值( 2 %),即:%+2 %=%。 184 因?yàn)槊總€雙交換包括 ecct間發(fā)生過兩次單交換,而這兩次單交換是計(jì)算 ecct間的重組值時所沒有估計(jì)在內(nèi)的。 185 從以上可知雙交換有兩個重要特點(diǎn): 雙交換的概率明顯低于單交換的概率。 如果兩次同時發(fā)生的交換它們互不干擾,各自獨(dú)立,那么按概率定律,雙交換發(fā)生的概率就是兩個單交換概率的乘積,例本例: % %=%,而實(shí)際僅為 %。 186 雙交換的結(jié)果,三個基因僅中間一個位置變動,兩邊兩個相對位置不變,但卻同時發(fā)生了兩次交換。 圖距實(shí)際上是按交換值決定的,所以在計(jì)算兩邊兩個基因的圖距時,一定要對重組值作校正,使其反映實(shí)際的交換值。校正的方法是把雙交換類型加進(jìn)去( 2倍雙交換類型的頻率)。 187 三點(diǎn)試驗(yàn)中,兩邊兩個基因?qū)﹂g的重組值一定等于另外兩個重組值之和減去兩倍的雙交換值。在本例中, ecct間的重組值是: % + %-2 %=%,該法則叫 基因直線排列定律 ,由 Sturtevent在 1913年最初確定。 三點(diǎn)試驗(yàn)中,在測交后代的 8種可能的表型中,個體數(shù)最少(甚至完全沒有)的兩種表型一定是雙交換產(chǎn)物。 根據(jù)這一點(diǎn),不必計(jì)算重組值,一眼就能正確無誤地?cái)喽ㄈ齻€基因的次序。 188 本例中: 最少的類型 最多的類型 將最多的親本型基因型與最少的雙交換型相比較,兩者基因型相同的兩個基因在兩邊,留下的一個不相同的基因則在中間,這里 cv一定位于中間,而三基因的相對順序是 ec cv ct,這樣,交配型 [ecct +/+ + cv] [ecct cv/Y](括號表示基因次序未確定)可以改寫成 ec+ ct / + cv+ eccvct /Y 189 最后我們可以將親本及其測交個體的基因型改寫為: 190 遺傳干涉與并發(fā)系數(shù) 在發(fā)生交換的時候,一個單交換的發(fā)生可 能會影響鄰近另一個單交換的發(fā)生,或者說,鄰近也發(fā)生一次交換的機(jī)會要減少一些,這種現(xiàn)象叫做 干涉( inteference) 。 上面曾說過:如果兩個單交換的發(fā)生互不干擾,從理論上講,兩個單交換同時發(fā)生的概率可用它們各自概率的乘積來表示。 191 例:在 eccvct試驗(yàn)中 單交換 : %( RF eccv) , %(RF cvct) 三點(diǎn)之間發(fā)生雙交換的理論概率: % % = % 但實(shí)驗(yàn)所得的雙交換只有:( 5+ 3) /5310= % 又例如:在 sceccv試驗(yàn)中,預(yù)期雙交換: % % =%,但實(shí)驗(yàn)中一個雙交換個體也沒有,“干涉”是完全的。 一般用 并發(fā)率 (Coincidence)來表示干擾(干涉)的大小。 192 交叉干涉 ( chiasmainterference) Ⅰ Ⅰ = 1- C 并發(fā)率(系數(shù)) = 觀察到的雙交換率 兩個單交換率的乘積 193 當(dāng) C =1, Ⅰ = 0時,表示 無干涉 ? C = 0, Ⅰ = 1時,表示存在 完全干涉 ? 1 C 0 時表示存在 正干涉 ( positive interference) ? C 1, Ⅰ 0 時,表示存在 負(fù)干涉 ( negative interference) ? 負(fù)干涉僅在微生物中發(fā)生基因轉(zhuǎn)變時才出現(xiàn)。 194 并發(fā)率愈大,干涉愈??; 并發(fā)率= 1,表示沒有干涉,干涉為 0, 在 eccvct的試驗(yàn)中, 并發(fā)率= %/% = , 干涉= 1-并發(fā)率 = 1- = 83%, ? 從一般實(shí)驗(yàn)結(jié)果來看,基因?qū)﹂g的距離縮短時,并發(fā)率降低,干涉值上升。 ? 推測染色體有某種物理學(xué)上的韌性,在某一距離范圍內(nèi)妨礙“彎曲”或交換的重復(fù)發(fā)生。 195 重組值、并發(fā)率和干涉值的運(yùn)算舉例 例題:位于同一條染色體上的三個隱性基因的連鎖圖如下: 如果并發(fā)率是 60%,在 αβγ/+++ x αβγ/αβγ雜交的 1000個子代中預(yù)期表現(xiàn)型頻率是多少? 196 解: ∵ ∴ 實(shí)際雙交換率=并發(fā)系數(shù) ╳ 理論雙交換率依次,上述交配的子代預(yù)期頻率可圖示如下: αβγ/+++ ╳ αβγ/αβγ?? 并發(fā)率 = 觀察到的雙交換率(實(shí)際雙交換率) 兩個單交換率的乘積(理論雙交換率) 197 198 關(guān)于 遺傳圖 說明二點(diǎn): ( 1)基因在遺傳學(xué)圖上有一定的位置,這個位置叫做 座位 。一般以最先端的基因位置為 0,但隨著研究進(jìn)展,發(fā)現(xiàn)有基因在更先端的位置時,把 0點(diǎn)讓給新的基因,其余的基因位置,作相應(yīng)的移動。 199 ( 2)重組值在 0到 50%之間,但在遺傳學(xué)圖上,可以出現(xiàn) 50單位以上的圖距。例如玉米第一連鎖群上, sr與 bm2間的圖距是 172,但實(shí)際上 sr與 bm2間的重組值不超過 50%,這是因?yàn)檫@兩個基因間發(fā)生了多次交換的關(guān)系,所以由實(shí)驗(yàn)得到的重組值與圖上的數(shù)值不一定一致。從而要從圖上數(shù)值知道基因間的重組值只限于鄰近的基因座位間。 200 利用作圖函數(shù)計(jì)算大圖距 兩個基因座位之間距離很近時,它們的重組頻率(重組值)代表著真實(shí)圖距。但相隔較遠(yuǎn)的兩個座位之間: 重組值 ≠ 圖距 ? 因?yàn)閮勺恢g有很多雙交換或多次交換,算重組值時往往偏低,作遺傳圖時要將所有的雙交換,多交換值都要加進(jìn)去。 201 但在同一染色體上兩個相距很遠(yuǎn)的基因,它們的重組值仍不會超過 50%,為什么? 對于任何測交來說,子代重組子的重組率百分?jǐn)?shù)不能超過 50%。如果這些基因是自由組合的,子代中可預(yù)期得到相同數(shù)目的重組子和親本型。 重組頻率= 50%,這兩個基因是不連鎖的。 202 有兩種情況說明這些基因可能是不連鎖的: ( 50%重組子) ( 1)這些基因可能位于不同的染色體上; ( 2)這些基因可能是在同一條染色體上,但 是相隔較遠(yuǎn),至少在它們中間出現(xiàn)一個 交換。 203 下圖 證明在相同染色體上相距較遠(yuǎn)的兩個基因間的重組頻率不能超過 50%。 (a) 單交換產(chǎn)生一半的親本型和一半的重組型染 色單體。 (b) 雙交換(二線,三線和四線雙交換)合在一 起考慮,也產(chǎn)生一半的親本型和一半的重組 型染色單體。 204 在同一染色體上 相隔很遠(yuǎn)的基因座位 (如圖中 a+和 b+)由于在減數(shù)分裂中在兩個座位之間至少總會出現(xiàn)一個單交換,單交換出現(xiàn)在一對非姐妹染色單體之間,結(jié)果產(chǎn)生兩個親本型染色單體
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