【正文】
聚體寡核苷酸所有可能的序列組合合成或固定于片基上,對于每一序列其在片基上的位置是預(yù)先決定好的。樣品擴(kuò)增并經(jīng)標(biāo)記后與片基上所有序列進(jìn)行雜交反應(yīng)。這樣,就會出現(xiàn)特定的雜交圖譜,有雜交信號部位的寡核苷酸片段與待測樣品序列是互補(bǔ)的最后分析產(chǎn)生雜交信號的寡核苷酸序列的重疊情況進(jìn)而推導(dǎo)出樣品的核酸序列。 1 A T AC G T T A 2 G T T AG A T C 3 AC GT T AG A 4 C G T T AG A T 5 G T T AG A T C DN A 樣品 T A T GC AA T C T AG與基因芯片上 65 , 0 0 0 種可能的八聚體進(jìn)行雜交從 而形成特定的結(jié)合圖形 計算機(jī)分析雜交圖象并由探針的重疊情況推導(dǎo)樣品的核酸序列 1 A T AC G T T A 3 T AC G T T AG 4 AC GT T AG A 2 C GT T AG A T 5 G T T AG A T C 3 T AC G T AG 4 AC GT T AG A 2 C G T T AG A T 互補(bǔ)序列為: A T AC G T T AG A T C 樣品序列為: T A T GC AA T C T AG 利用基因芯片進(jìn)行雜交測序的原理 三.芯片結(jié)果讀取與掃描儀 對于用熒光素標(biāo)記經(jīng)擴(kuò)增(也可用其他放大技術(shù))的序列或樣品,與芯片上的探針進(jìn)行雜交,然后沖洗,采集熒光圖像。 圖像的采集用落射熒光顯微鏡 或電荷偶聯(lián)裝置照相機(jī) 非共聚焦激光掃描儀等進(jìn)行。 基因芯片 熒光標(biāo)記的樣品 共聚焦顯微鏡 獲取熒光圖象 雜交結(jié)果分析 探 針 設(shè) 計 雜交 基因芯片 熒光標(biāo)記的樣品 共聚焦顯微鏡 獲取熒光圖象 雜交結(jié)果分析 探 針 設(shè) 計 雜交 四.生物芯片的軟件系統(tǒng)與數(shù)據(jù)處理 第五節(jié) 基因芯片的應(yīng)用 1.基因表達(dá)分析; 2.基因型及多態(tài)性分析; 3.雜交測序; 4.核酸和蛋白質(zhì)相互作用的研究; 5.疾病的診斷與治療; 6.藥物開發(fā); 7.在營養(yǎng)與食品衛(wèi)生領(lǐng)域的應(yīng)用; 8.在環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用。 擬南芥、酵母基因表達(dá)研究等 人類基因組單核苷酸多態(tài)性的鑒定及分型,人線粒體 究等 BRCAⅠ 基因外顯子 11]、 CFTR基因、β地中海貧血、酵母突變菌株、 HIV1逆轉(zhuǎn)錄酶及蛋白酶基因等的突變檢測等 儀 器 ? 1. 恒溫?fù)u床 ? 2. 培養(yǎng)用錐性瓶 ? 3. 超凈工作臺 ? 4. 離心機(jī) ? 5. 滅菌鍋 恒溫空氣搖床 超凈工作臺 離心設(shè)備 臺式高速冷凍離心機(jī) 1 2 對照菌 GFP誘導(dǎo)表達(dá)菌 電泳儀 儀 器 電泳槽 SDSPAGE凝膠電泳系統(tǒng) 思考題 ? 生物芯片的定義、分類及制作方法? ? 基因芯片技術(shù)與傳統(tǒng)的 Northern雜交技術(shù)有何異同? 考試題型 ?一、名詞解釋(每小題 2分,共 10分) ?二、判斷題(每小題 1分,共 10分) ?三、填空題(每空格 ,共 20分) ?四、選擇題(在下列各小題的備選答案中,請把你認(rèn)為正確答案的題號填入題干的括號內(nèi)。少選、多選不給分。每題 1分,共 20分) ?五、簡答題(每小題 6分,共 30分) ?六、問答題( 10分) 總成績 =30%平時成績 +70%考試成績