常見分子生物學(xué)軟件簡介-資料下載頁
2025-04-04 23:20本頁面
【正文】 度、原子距離、氨基酸突變等數(shù)據(jù)。該軟件與SwissModel服務(wù)器（蛋白立體結(jié)構(gòu)構(gòu)建服務(wù)器）緊密關(guān)聯(lián)，可以從軟件直接連到SwissModel服務(wù)器進行理論蛋白立體結(jié)構(gòu)構(gòu)建。而且，該軟件可以調(diào)用POVRay軟件（見上）生成質(zhì)量非常高的蛋白圖像。 Molmol 主要用來進行各種分子文件的轉(zhuǎn)換，支持30種主要分子格式，也可以用來進行3維分子的簡單顯示?？蓪DB格式輸出為POV格式后，用POVRAY進行渲染，生成非常漂亮的三維圖形。演示版只支持樣板文件與原子數(shù)小于20的分子文件格式的轉(zhuǎn)換。不知是否有取巧的辦法。 十、生物顯微圖像分析 Scion Image 是一個優(yōu)秀的免費圖像處理與分析工具。是非常流行的蘋果機上的NIH（National Institutes of Health) Image的WINDOWS版，用來顯示編輯分析各種圖像。 讀取格式為 TIFF 與BMP格式,是一個專業(yè)圖像分析軟件，適用與于科學(xué)處理，這點從研發(fā)單位便可看出。生物學(xué)工作者處理圖像必備。 SigmaScan Pro 是一個有力的圖像分析軟件30天全功能演示版，進行數(shù)字圖像的分析處理，可以很容易地將圖像進行分析，得出科學(xué)結(jié)論。 ImagePro Plus Version Media Cybernetics公司的專業(yè)產(chǎn)品，不僅可以進行顯微分析，還可也進行其他科學(xué)分析。 十一、數(shù)據(jù)統(tǒng)計類軟件 SAS世界排名第一，專業(yè)性極強，能做各種統(tǒng)計，是FDA唯一批準有效的統(tǒng)計軟件。但人機對話不方便，主要是類似DOS下的命令操作，稍有改進，鼠標操作性較好，若今后能進一步改進操作的話，其應(yīng)用將大大廣泛。是專業(yè)統(tǒng)計人員的首選軟件。 SPSS，世界排名第二，其特點：功能強大，易于操作，簡單明了，人機對話方便，數(shù)據(jù)庫接口豐富，最新SPSS可以讀出SAS數(shù)據(jù)，是業(yè)余人員的首選。最新版本糾正以往的不穩(wěn)定、運行速度慢的缺點。 ，主要原因是SPSS公司將原有的內(nèi)核全部更換了。但SPSS分為不同版本，如basic版、standard版和advance版。許多復(fù)雜的統(tǒng)計功能只在advance版中才出現(xiàn)，如復(fù)雜多元相關(guān)、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)統(tǒng)計，而前兩版中許多復(fù)雜統(tǒng)計并沒有（可能為了便于安裝使用吧，standard約110M150M,而高級版本則幾百M。象SAS完成安裝則達6張CD！因而絕大多數(shù)人不可能使用它全部功能。因而常規(guī)建議是SPSS+，一個作圖，而且二者數(shù)據(jù)可以通用，效果很好！在我的主頁的站點導(dǎo)航 statisitic：，運行速度最快，模塊化操作，不同統(tǒng)計數(shù)據(jù)有不同界面風(fēng)格，使用方便，目前國內(nèi)有很多用戶。但其知名度在前二者之下，對一般用戶可以考慮選用。 Origin 是一個非常有名并且易于使用的科學(xué)用途數(shù)據(jù)繪圖與數(shù)據(jù)分析處理工具軟件，各種期刊上的統(tǒng)計圖，幾乎都是出自他的手筆。 以上的軟件過于強大，下面是一些小巧易用的數(shù)據(jù)統(tǒng)計作圖，更適合生物學(xué)的數(shù)據(jù)分析： GraphPad Prism著名的數(shù)據(jù)處理軟件,用來進行生物學(xué)統(tǒng)計、曲線擬合以及作圖。短小而功能齊全。 SigmaPlot 2002 著名的繪圖和數(shù)據(jù)分析軟件包可以根據(jù)各種數(shù)據(jù)，繪制精確的兩維或三維曲線，可以自由定制各數(shù)據(jù)軸的特性，并能進行數(shù)據(jù)的各種統(tǒng)計分析。進行一般的生物類數(shù)據(jù)處理作圖，功能足以。 Simstat 一個易于使用的智能統(tǒng)計軟件尤其適合對統(tǒng)計知識了解不多的人使用，它具有一個“專家系統(tǒng)”，引導(dǎo)你對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析?？膳cSigmaPlot結(jié)合生成高質(zhì)量數(shù)據(jù)圖。 CurveExpert ELISA標準曲線擬合、及其它各種有關(guān)的實驗數(shù) 據(jù)分析，都可以應(yīng)用CurveExpert進行數(shù)據(jù)分析。它使用非常方便， 可以說是實驗數(shù)據(jù)處理的圣手，并且可以生成漂亮的曲線應(yīng)用到論文之中。 十二、文獻管理 reference Manager ,同時保存查找的資料為本地文件。資料內(nèi)容和記錄分上下兩個屏幕，如有全文或想連接網(wǎng)絡(luò)時敲鍵盤就可以到相應(yīng)的全文文章和摘要?？梢灾苯釉赪ORD中查找資料，并插入引用。在文章中對引用的文獻可以格式化，引用的參考資料格式有很強的用戶自定義功能，可以符合各種雜志對引用格式的要求，引用時不用多窗口切換. 專業(yè)參考文獻查詢軟件，可在線查找Ineternet上的各種文獻數(shù)據(jù)庫，將查找到的資料保存入本地數(shù)據(jù)庫，并自動生成格式化的參考文獻清單插入各種文字處理軟件。 十三、進化樹分析 Phylip 最為通用的進化樹分析軟件。主要包括五個方面的功能軟件：i，DNA和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)的分析軟件。ii，序列數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)變成距離數(shù)據(jù)后，對距離數(shù)據(jù)分析的軟件。 iii，對基因頻率和連續(xù)的元素分析的軟件。iv，把序列的每個堿基/氨基酸獨立看待（堿基/氨基酸只有0和1的狀態(tài)）時，對序列進行分析的軟件。v，按照DOLLO簡約性算法對序列進行分析的軟件。vi，繪制和修改進化樹的軟件。 PUZZLE 核酸序列、蛋白序列相似性分析及進化樹構(gòu)建工具。根據(jù)序列數(shù)據(jù)的最大相似性構(gòu)建進化樹，一個軟件，并且對樹進行bootstrap評估?？蓪Υ罅繑?shù)據(jù)進行快速分析構(gòu)建，程序還包含數(shù)個統(tǒng)計測試。 Paup 一種功能強大的商業(yè)版系統(tǒng)進化分析軟件，據(jù)稱價值數(shù)千美金
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