[醫(yī)藥衛(wèi)生]基因識別-資料下載頁
2025-10-09 23:06本頁面
【正文】 tructure (exons, splicing sites, promotors) ? AAT (Analysis and Annotation Tool for Finding Genes in Genomic Sequences) Michigan (USA) ? AGenDA (geneprediction tool that is based on crossspecies sequence parison) Bielefeld (Germany) ? ATGpr (identifies the initiation codons in cDNA sequences) HRI (Japan) ? AUG_EVALUATOR (for start codons prediction) ITBA (Italy) ? Bacterial Promoter, Operon and Gene Finding SoftBerry ? BioProspector (Discovering Conserved DNA Motifs in Upstream Regulatory Regions of CoExpressed Genes) Stanford (USA) ? BCM Gene Finder (exons, splicing sites, promoter, coding region) BCM, see also Gene Feature Searches ? Cassandra (Recognition of proteincoding segments in eukaryotic DNA) USC (USA) ? CDS (Search Coding Regions) Pasteur, see also advanced form (French) ? CHECKTRANS (ORF property statistics) Pasteur (French) ? Cister (Ciselement Cluster Finder) Boston (USA) ? Cister (Ciselement Cluster Finder) Boston (USA) ? ConPro (consensus promoter predictor) Michigan (USA) ? CorePromoter Finder CSHL (USA) 基因識別方法存在的問題和局限性 （ 1）關(guān)于基因的定義不明確 → 統(tǒng)一定義 （ 2）目前的方法僅僅識別蛋白質(zhì)編碼基因 → 轉(zhuǎn)錄信號 （ 3）現(xiàn)有的許多方法僅檢測單個基因 → 部分基因、多重基因 （ 4）基于同源分析的方法是保守的 → 不可能發(fā)現(xiàn)新的基因 （ 5） 忽視關(guān)于基因結(jié)構(gòu)的生物學(xué)知識 → 基因表達(dá)的真實分子機(jī)制 習(xí)題 ? 簡述基于剪切比對的基因識別的方法步驟 ? 敘述候選基因位于給定的 DNA序列需滿足的一致性條件。 ? 考慮下面一條基因序列，標(biāo)出其中可能的起始密碼子和終止密碼子，并標(biāo)出可能的基因轉(zhuǎn)錄剪切位點，并做出位點圖。 cgatgttcgtcccggagaccatgggcgcgtacatcggattcgaagctctgaggct
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