低成本高性能計(jì)算的實(shí)現(xiàn)與測(cè)試-資料下載頁(yè)
2025-08-23 12:59本頁(yè)面
【導(dǎo)讀】是云南省在信息技術(shù)方向唯一的一所省級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。多年來(lái)，在社會(huì)各界的大力支持下，云。模和水平均已具備較強(qiáng)的實(shí)力。業(yè)務(wù)、基因測(cè)序比對(duì)處理等領(lǐng)域也越來(lái)越需要高性能計(jì)算。著要投入大量的金錢。曙光4000A，市場(chǎng)價(jià)格約為1億人民幣。兩者之間取得一個(gè)平衡點(diǎn)？解決方案由此產(chǎn)生。究顯示小型SMP平臺(tái)最適合構(gòu)建HPC集群，這種模式對(duì)每個(gè)節(jié)點(diǎn)上的性能及I/O吞吐。量提出了很高要求。AMD皓龍?zhí)幚砥鞯闹边B架。以及其相對(duì)低廉的價(jià)格，是搭建一個(gè)。低成本解決方案的重要因素。InfiniBand，Myri等高速網(wǎng)絡(luò)。務(wù)器更具有價(jià)格優(yōu)勢(shì)。比曙光服務(wù)器高至少一倍的價(jià)格。因此在較大規(guī)模集群方。管理，日常的維護(hù)工作量就會(huì)明顯增多。還可以安裝一些針對(duì)與某。MaterialStudio材料計(jì)算軟件等。虛存等多種編程模型。行并行程序的開發(fā)。性能優(yōu)化》所提供的思路，進(jìn)行了相關(guān)的測(cè)試。上，就達(dá)不到這個(gè)效率。
【正文】 短至 1個(gè)小時(shí)。 26 測(cè)試結(jié)果（續(xù)） 不同數(shù)學(xué)庫(kù)： GotoBLASMKLacmlAtlas 不同的 MPI： MPI 1 MPI 2 27 測(cè)試注意問(wèn)題 因?yàn)槲覀兪鞘褂煤诵氖?Barceiona的 AMD 四核處理器，在使用 GotoBLAS數(shù)學(xué)庫(kù)時(shí)，必須使用最新的 。 使用 GotoBLAS數(shù)學(xué)庫(kù)測(cè)試，在單節(jié)點(diǎn)上配置運(yùn)行測(cè)試參數(shù)時(shí)，只需要配置如下：mpirun –np 1 xhpl。則會(huì)同時(shí)調(diào)用 8個(gè)核心進(jìn)行計(jì)算。而使用其它數(shù)學(xué)庫(kù)，要讓 8核同時(shí)進(jìn)行計(jì)算，則需要明確配置 8進(jìn)程，如： mpirun –np 8 xhpl 。 28 相關(guān)數(shù)據(jù)對(duì)比 以單位成本上所能獲取的運(yùn)算速度作對(duì)比。 曙光 4000A： /秒 /元 曙光 5000A： /秒 /元 優(yōu)化前： /秒 /元 優(yōu)化后： /秒 /元 29 優(yōu)點(diǎn) ，運(yùn)算速度能達(dá)到中型計(jì)算的規(guī)模。 。 ，容易適應(yīng)需求的改動(dòng)。因此很容易通過(guò)擴(kuò)展，升級(jí)，獲得更好的性能。 Web進(jìn)行監(jiān)控，預(yù)計(jì)會(huì)通過(guò) web進(jìn)行遠(yuǎn)程管理等工作。 ，運(yùn)行成本低。 30 心得 ，怎樣去選擇一個(gè)合理的方案去搭建一個(gè)低價(jià)格高性能的集群需要多方面的考慮。 ，采用更好的網(wǎng)絡(luò)環(huán)境，更多的運(yùn)算節(jié)點(diǎn)和更快的 cpu是最直接的方式。 31 的效果，但是瓶頸在于 CPU訪問(wèn)內(nèi)存的帶寬并不能隨著 CPU個(gè)數(shù)的增加而有效增長(zhǎng)，所以怎樣在價(jià)格和性能上做一個(gè)很好的平衡，將是必須考慮的問(wèn)題。 ， I/O瓶頸的也是一個(gè)必須面對(duì)的問(wèn)題。 32 VO領(lǐng)域中，在數(shù)據(jù)的分析、存儲(chǔ)、圖像的處理等工作上對(duì)計(jì)算提出了很高的要求，因此這樣的集群計(jì)算環(huán)境更適用于這種研究的需要。 ，但我們?cè)诙虝r(shí)間內(nèi)，使用不到 40萬(wàn)的情況下，能達(dá)到一個(gè)中型 HPC系統(tǒng)的運(yùn)算能力，已實(shí)現(xiàn)了預(yù)期的目標(biāo)。 33 謝謝！
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