【文章內(nèi)容簡介】 的主要研究內(nèi)容。生物信息學(xué)在基因組和蛋白組研究中所起的作用主要有:（1), 研究大量非編碼區(qū)序列的信息結(jié)構(gòu)和可能的生物學(xué)意義。(2)對已完成全基因組測序的各種模式生物的基因組信息結(jié)構(gòu)進(jìn)行比較分析, 包括同源序列的搜索比較和指導(dǎo)基因克隆.(3)功能基因組的相關(guān)信息分析, 包括對基因表達(dá)圖譜及其相關(guān)算法和軟件的研究, 與功能基因組信息相關(guān)的核酸、蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)的預(yù)測模擬以及蛋白質(zhì)的功能預(yù)測。生物信息數(shù)據(jù)庫復(fù)雜的生物和生物界和日新月異的生命科學(xué)研究產(chǎn)出的大量的生物學(xué)信息，對這些信息的儲存、檢索、比較分析必須借助于計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫技術(shù), 包括各類生物學(xué)信息數(shù)據(jù)庫的建立與維護(hù)、數(shù)據(jù)的添加與注釋、更新與查詢、數(shù)據(jù)庫資料的網(wǎng)絡(luò)化等研究內(nèi)容?，F(xiàn)有的數(shù)據(jù)庫有：核酸序列數(shù)據(jù)庫（GenBank、EMBL、DDBJ）、基因組數(shù)據(jù)庫、基因圖譜數(shù)據(jù)庫、蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫（SWTSSPROT、PIR）和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫（Interpro）等。隨著生命科學(xué)的不斷發(fā)展，數(shù)據(jù)庫種類不斷增加、結(jié)構(gòu)日益復(fù)雜、使用也越來越方便。生物信息學(xué)作為一門新興學(xué)科已經(jīng)成為生命科學(xué)研究中必不可少的研究手段 本文對數(shù)據(jù)庫與數(shù)據(jù)庫搜索序列比對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測藥物設(shè)計(jì)基因芯片技術(shù)幾個(gè)方面做了介紹較為系統(tǒng)地闡述了生物信息學(xué)在這些領(lǐng)域的應(yīng)用 當(dāng)然它所涉及的內(nèi)容與方法遠(yuǎn)遠(yuǎn)不只上面提到的那些 新基因和 的發(fā)現(xiàn)與鑒定非編碼區(qū)信息結(jié)構(gòu)分析遺傳密碼的起源和生物進(jìn)化完整基因組的比較研究 大規(guī)?；蚬δ鼙磉_(dá)譜的分析等都是生物信息學(xué)研究的對象 相信不久的將來生物信息學(xué)會在生命科學(xué)領(lǐng)域扮演越來越重要的角色。參考文獻(xiàn)：現(xiàn)代生物信息學(xué)及其主要研究領(lǐng)域 蕭浪濤(湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)理學(xué)院, 湖南長沙 410128)生物信息學(xué)技術(shù)進(jìn)展 郭志云 張懷渝 梁龍 軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 生物工程研究所,北京100071。四川農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)及理學(xué)院,雅安 625014利用生物信息學(xué)技術(shù)研究蛋白功能的幾種方法 王劍利 楊章民綜述 王一理審閱 西安交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院免疫病理學(xué)研究室(西安, 710061)第四篇：生物信息學(xué)研究進(jìn)展我國生物信息學(xué)發(fā)展現(xiàn)狀及展望摘要：簡要敘述了我國生物信息學(xué)發(fā)展現(xiàn)狀，以及我國當(dāng)前生物信息學(xué)發(fā)展中的一些問題，并對生物信息學(xué)的發(fā)展前景進(jìn)行概述。關(guān)鍵詞：生物信息學(xué) 現(xiàn)狀 展望1生物信息學(xué)簡介生物信息學(xué)(Bioinformatics)是20世紀(jì)末才誕生的一門新學(xué)科，是信息技術(shù)在生物數(shù)據(jù)處理上的應(yīng)用，該學(xué)科涉及分子生物學(xué)技術(shù)、計(jì)算機(jī)信息技術(shù)、數(shù)據(jù)庫技術(shù)等多門學(xué)科，是生物學(xué)、數(shù)學(xué)、物理學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)等眾多學(xué)科交叉的新興學(xué)科。它主要利用計(jì)算機(jī)信息處理工具和軟件對分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行加工和分析，從中發(fā)現(xiàn)有價(jià)值的信息，它是生命科學(xué)的前沿學(xué)科，其數(shù)據(jù)信息主要來自于人類及各種模式生物基因組的分子數(shù)據(jù)，包括DNA、RNA和蛋白質(zhì)片斷的序列數(shù)據(jù)，也有蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)和經(jīng)過計(jì)算機(jī)處理的分子數(shù)據(jù)。2國內(nèi)生物信息學(xué)發(fā)展?fàn)顩r我國生物信息學(xué)研究近年來發(fā)展較快,相繼成立了北京大學(xué)生物信息學(xué)中心、華大基因組信息學(xué)研究中心、中國科學(xué)院上海生命科學(xué)院生物信息中心,部分高校已經(jīng)或準(zhǔn)備開設(shè)生物信息學(xué)專業(yè)。2002年國家自然科學(xué)基金委在生物化學(xué)、生物物理學(xué)與生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)學(xué)科設(shè)立了生物信息學(xué)項(xiàng)目,并列入生命科學(xué)部優(yōu)先資助的研究項(xiàng)目。國家 863計(jì)劃特別設(shè)立了生物信息技術(shù)主題,從國家需求的層面上推動我國生物信息技術(shù)的大力發(fā)展。但是由于起步較晚及諸多原因，我國的生物信息學(xué)發(fā)展水平遠(yuǎn)遠(yuǎn)落后于國外。在PubMed收錄的以關(guān)鍵詞“Bioinformatics”檢索到的歷年發(fā)表的文章數(shù)，可以看出大量的研究文獻(xiàn)出現(xiàn)在21世紀(jì)以后。%，而美國則發(fā)表2160篇占全部的39%之多（統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)截至2004年2月15日）。我國學(xué)者在生物信息學(xué)領(lǐng)域發(fā)表的有高影響力的論文只有不到美國學(xué)者發(fā)表數(shù)量的6%，差距相當(dāng)大。在生物信息學(xué)領(lǐng)域，一些著名院士和教授在各自領(lǐng)域取得了一定成績，顯露出蓬勃發(fā)展的勢頭，有的在國際上還占有一席之地。如北京大學(xué)的羅靜初和顧孝誠教授在生物信息學(xué)網(wǎng)站建設(shè)方面、中科院生物物理所的陳潤生研究員在EST序列拼接方面以及在基因組演化方面、天津大學(xué)的張春霆院士在DNA序列的幾何學(xué)分析方面、中科院理論物理所郝柏林院士、清華大學(xué)的李衍達(dá)院士和孫之榮教授、內(nèi)蒙古大學(xué)的羅遼復(fù)教授、上海的丁達(dá)夫教授等等。北京大學(xué)于1997年3月成立了生物信息學(xué)中心，這個(gè)中心在1996年歐洲EMBNet擴(kuò)大到歐洲之外時(shí)已正式成為中國結(jié)點(diǎn)(每個(gè)國家只有一個(gè)結(jié)點(diǎn))，目前已有60多種生物數(shù)據(jù)庫的經(jīng)常更新的鏡像點(diǎn)。近年來，它已組織過多次國內(nèi)和地區(qū)的培訓(xùn)班及會議，有著較廣泛的國際聯(lián)系。另外，中國科學(xué)院、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院、軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院、清華大學(xué)、天津大學(xué)、浙江大學(xué)、復(fù)旦大學(xué)、哈爾濱工業(yè)大學(xué)、東南大學(xué)、中山大學(xué)、內(nèi)蒙古大學(xué)等等都先后開展了生物信息學(xué)研究和教學(xué)工作，許多大學(xué)都設(shè)立了生物信息學(xué)專業(yè)，并同時(shí)招收本科、碩士、博士研究生。各種學(xué)術(shù)會議及論壇的召開，對于促進(jìn)我國在這一前沿領(lǐng)域的發(fā)展起著越來越重要的作用。中國科學(xué)院于1997年9月和12月召開了第80、87次香山會議，首次邀請有關(guān)專家就“DNA芯片的現(xiàn)狀與未來”和“生物信息學(xué)”進(jìn)行探討。1999年3月，清華大學(xué)生物信息學(xué)研究所、國家人類基因組北方研究中心和北京生物技術(shù)和新醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)促進(jìn)中心共同舉辦了“北方生物信息學(xué)學(xué)術(shù)研討會”。1999年4月，北京大學(xué)舉辦了“國際生物信息學(xué)講習(xí)班”。2001年4月，由北京市科技委員會、中國人類基因組北方研究中心、中國人類基因組南方研究中心、北京華大基因研究中心、軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院、北京生物工程學(xué)會生物信息學(xué)專業(yè)委員會、北京生物技術(shù)和新醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)促進(jìn)中心等共同舉辦的首屆“中國生物信息學(xué)大會”在北京召開。2003年11月2829日，中國科協(xié)“生物信息學(xué)與進(jìn)化計(jì)算”第81次青年科學(xué)家論壇在北京中國科技會堂成功召開。這次論壇是中國科協(xié)舉辦的一次多學(xué)科交叉的盛會，旨在促進(jìn)國內(nèi)青年科學(xué)家在這一全新領(lǐng)域內(nèi)的相互交流，促進(jìn)該學(xué)科的成長與發(fā)展。這是國內(nèi)首次以“生物信息學(xué)”為主題的一次多學(xué)科交叉的青年科學(xué)家論壇。與會者一致認(rèn)為系統(tǒng)生物學(xué)、非編碼區(qū)功能研究、基因調(diào)控和相互作用網(wǎng)絡(luò)等是當(dāng)前生物信息學(xué)研究的熱點(diǎn)問題。盡管如此，真正開展生物信息學(xué)具體研究和服務(wù)的機(jī)構(gòu)或公司仍相對較少，僅有的幾家科研機(jī)構(gòu)主要開展生物信息學(xué)理論研究