常見(jiàn)的生物信息學(xué)軟件的介紹和文獻(xiàn)依據(jù)(編輯修改稿)
2025-05-04 03:26 本頁(yè)面
【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 一個(gè)多用途基因組分析器和瀏覽器，識(shí)別各種微陣列和測(cè)序數(shù)據(jù)格式21596789GEOquery基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(kù)（GEO）和BioConductor間的一個(gè)橋梁17496320GIMP一個(gè)跨平臺(tái)的處理數(shù)字圖像的免費(fèi)、開(kāi)源軟件19457798GLITR基于對(duì)照數(shù)據(jù)的隨機(jī)采樣計(jì)算一個(gè)倍數(shù)變化以從ChIPSeq數(shù)據(jù)中提取轉(zhuǎn)錄因子靶點(diǎn)19553195GO::TermFinder訪問(wèn)基因本體論信息并找到與一列基因相關(guān)的顯著富集的基因本體論術(shù)語(yǔ)15297299GoBean一個(gè)GO術(shù)語(yǔ)富集可視化探索Java GUI應(yīng)用程序22360891GOGrapher一個(gè)GO圖形展示和分析Python庫(kù)19583843GOlorize一個(gè)帶有基于本體論的布局和著色的Cytoscape網(wǎng)絡(luò)可視化插件17127678gputools使得能夠在R中進(jìn)行GPU計(jì)算的一個(gè)包19850754graph2tab一個(gè)轉(zhuǎn)換實(shí)驗(yàn)流程圖為表格格式的程序庫(kù)22556367GReEn一個(gè)基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)高效壓縮工具22139935GRiP一個(gè)模擬原核生物中轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的計(jì)算工具22426343GSEA基因集合富集分析：一種解釋全基因表達(dá)譜的基于知識(shí)的方法16199517HilbertVis用希爾伯特曲線來(lái)可視化基因組數(shù)據(jù)19297348icite一個(gè)瀏覽器擴(kuò)展，增強(qiáng)了生命科學(xué)文獻(xiàn)的導(dǎo)航，及鏈接術(shù)語(yǔ)到相應(yīng)的非文本數(shù)據(jù)19767300IGB整合基因組瀏覽器：用于基因組規(guī)模數(shù)據(jù)集的發(fā)布、探索、可視化19654113Interpol一個(gè)蛋白質(zhì)序列預(yù)處理R程序包21682849interPopula一個(gè)訪問(wèn)HapMap計(jì)劃數(shù)據(jù)集的Python API21210977IntervalStatsChIPseq數(shù)據(jù)集相似性的一個(gè)有效統(tǒng)計(jì)評(píng)估22262674IVEE用基因型譜方法分析基因片段的組合模式，檢測(cè)甲型流感病毒的傳播和重組事件21824442JExpress使用Java來(lái)探索基因表達(dá)數(shù)據(jù)11301307JalviewJava多重序列比對(duì)編輯器14960472Java Treeview微陣列數(shù)據(jù)可視化，樹(shù)狀圖查看15180930JBrowse下一代基因組瀏覽器，通過(guò)平滑地動(dòng)態(tài)移動(dòng)，縮放，導(dǎo)航基因組注釋19570905jClust一個(gè)聚類(lèi)和可視化工具箱19454618JColorGrid生物學(xué)測(cè)量值可視化，繪制熱圖，顏色網(wǎng)格等16640789Jetset挑選最佳的微陣列探針集來(lái)代表一個(gè)基因22172014JSBML一個(gè)處理SBML的靈活Java庫(kù)21697129jSquid一個(gè)圖形化在線網(wǎng)絡(luò)瀏覽Java小程序18445606一個(gè)RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)可視化Java工具16220684KEGGgraph一種用R和bioconductor繪制KEGG PATHWAY的圖形方法19307239KEGGtranslator可視化并轉(zhuǎn)變KEGG PATHWAY數(shù)據(jù)庫(kù)為各種格式21700675KGMLEDKEGG通路圖的動(dòng)態(tài)瀏覽和編輯17142815LeARN檢測(cè)、聚類(lèi)和注釋非編碼RNAs的一個(gè)平臺(tái)18194551limmaGUI一個(gè)微陣列數(shù)據(jù)（雙色）線性建模圖形用戶(hù)界面15297296LogoBar帶有空位的蛋白質(zhì)logos柱狀圖可視化16269415MACS基于模型的ChIPSeq峰識(shí)別軟件18798982MAGIC Tool整合的微陣列數(shù)據(jù)分析工具，開(kāi)源，多平臺(tái)15647303MAnorm一個(gè)魯棒的ChIPSeq數(shù)據(jù)集定量比較模型22424423MapView臺(tái)式機(jī)上的短序列比對(duì)可視化軟件（大規(guī)模并行測(cè)序）19369497Mayday一個(gè)微陣列數(shù)據(jù)分析工作臺(tái)16500939medpie一個(gè)醫(yī)學(xué)留言板帖子信息提取程序包22262673MeQA一個(gè)MeDIPseq數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估和分析流程22199384MethLAB一個(gè)基于陣列的DNA甲基化數(shù)據(jù)分析的圖形用戶(hù)界面程序包22430798MethylAnalyzer一個(gè)分析全基因組DNA甲基化數(shù)據(jù)的Python包21685051Mfuzz一個(gè)微陣列數(shù)據(jù)軟聚類(lèi)軟件包18084642MicroRazerS小RNA片段的快速比對(duì)19880369miRExpress分析高通量測(cè)序數(shù)據(jù)以繪制microRNA表達(dá)譜19821977miRDeep
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