spm中文教程匯總(已整理)(編輯修改稿)
2025-09-05 00:11 本頁面
【文章內容簡介】 I)三條軸的轉動角度。橫坐標代表這個序列所采集的所有圖像，縱坐標表示的是偏移量和偏轉角度，分別以毫米和度為單位。采用SPM8，頭動信息和空間標準化的圖形文件將以spm_“data”.ps的形式保存于matlab的工作目錄下，如我們是2009年4月30日處理的數據。我們在預處理面板校準選項中選擇“Realign (Est amp。 Res)”，出現如下對話框，我們按下面設置進行： 選中“data”, 選擇“New Session”, 然后選中data下出現的 “Session”選項。點擊“Specify Files”，用spm文件選擇器選擇剛做完時間校準的圖像（a*.img）。其余選項采用默認設置，點擊上方綠色的三角開始運行。Realign這一步也有分開進行的，具體描述如下—— Realign: Estimate（重排參數的估計）此步驟采用最小方差原理和六參數剛體空間變換來重排從同一個被試上采集到的圖像數據。使用者所選取的第一幅圖像文件將被作為其它圖像重排的參考標準。也就是說，你想要用哪一幅圖像作為參考標準，就先選哪一幅圖像的文件。參考圖像文件不一定非用采集到的第一幅圖像，使用最有“代表性”的一幅圖像也許更好。本步驟的目的主要是去除fMRI和PET數據中的運動偽影。圖像數據的頭文件會被改寫以反映數據相對空間位置的變化。此過程的具體參數會在結果窗口中以平移（translation）和旋轉（rotation）曲線圖顯示。每個session的重排參數會被存儲到名為 rp*.txt 的文件中。這些參數可以在最后的一般線性模型統(tǒng)計估計中作為混淆因素考慮進去。 選擇一個被試需要進行此步驟處理的所有sessions。注：在 coregistration 這一步，首先是對所有的session進行重排，其具體做法是把所選每個session的第一個scan與所選第一個session的第一個scan對齊。然后再把每個session里的其它scan與該session的第一個scan進行對齊。使用此方式進行重排是因為各個session的數據之間可能會有較大差異。 Session選擇session里所有的scan。 Estimation Options 這里包括各種注冊參數選擇項，若對某一個選項不確定，使用軟件默認值即可。 Quality質量與速度的權衡。選擇高質量以最慢的速度給出最精確的結果，低質量以較快的速度給出較不精確的結果。此參數的設定實際影響到的是參與參數估計的象元（voxel）的數目。其依據是有些象元（voxel）其實對重排參數的估計貢獻不大，可以舍棄。 Separation 此參數以毫米為單位，表示對參考圖像文件進行重采樣時采樣點之間的間隔。采樣點之間間隔越小，結果越精確，運算速度越慢。 Smoothing (FWHM)高斯平滑的半高寬值。在估計重排參數之前一般先進行高斯平滑。PET數據一般使用7mm。MRI數據一般使用5mm。 Num Passes Register to first: 所有圖像文件對齊注冊到第一幅圖像。 Register to mean: 使用two－pass處理將所有圖像文件對齊注冊到所有圖像文件的平均圖像。PET 數據一般注冊到平均圖像。因為PET數據相比fMRI數據噪音更大，文件更少，所以時間的影響更小。MRI數據一般注冊到第一幅圖像。雖然使用two－pass處理可能更精確，但是其對效果的提高與其所損失的運行時間相比得不償失。 Interpolation在估計最佳變換時對數據進行重采樣的方法。高的degree提供更好的結果，但是也更慢，因為會采樣更多的相鄰象元（voxel）[52, 53, 54]。 Wrapping此參數指示一個volume中數據wrap around in的方向（此處具體理解有待大家補充）。No wrapping：適用于PET數據或者已進行過空間變換的數據。同時當你不確定自己數據類型時，推薦使用此選項。Wrap in Y：適用于沒有重排（resilce）過的在Y方向上進行相位編碼的MRI數據。 Weighting提供一個加權圖像，在估計重排參數時對參考圖像的每一個象元進行加權。加權系數與標準差成反比。例如當有大量額外的頭動（如說話或者特定區(qū)域內的嚴重偽影）時。（此處具體理解有待大家補充）。 Realign: Reslice（據已估計出的參數重排） 此功能重排以上步驟中已進行參數估計和注冊的圖像文件，使之與參考圖像文件達到象元級的匹配精確。重排后的數據被命名為：r＋原文件名。 Images選擇要重排的數據文件 Reslice Options 各種重排參數設定，若對某一個選項不確定，使用軟件默認值即可。Resliced images All Images (1..n) : 重排所有數據，包括標準參考圖像（重排后還是保持原位置不變）。Images 2..n :重排除了標
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