spm中文教程匯總(已整理)(編輯修改稿)
2025-09-05 00:11 本頁(yè)面
【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 I)三條軸的轉(zhuǎn)動(dòng)角度。橫坐標(biāo)代表這個(gè)序列所采集的所有圖像，縱坐標(biāo)表示的是偏移量和偏轉(zhuǎn)角度，分別以毫米和度為單位。采用SPM8，頭動(dòng)信息和空間標(biāo)準(zhǔn)化的圖形文件將以spm_“data”.ps的形式保存于matlab的工作目錄下，如我們是2009年4月30日處理的數(shù)據(jù)。我們?cè)陬A(yù)處理面板校準(zhǔn)選項(xiàng)中選擇“Realign (Est amp。 Res)”，出現(xiàn)如下對(duì)話框，我們按下面設(shè)置進(jìn)行： 選中“data”, 選擇“New Session”, 然后選中data下出現(xiàn)的 “Session”選項(xiàng)。點(diǎn)擊“Specify Files”，用spm文件選擇器選擇剛做完時(shí)間校準(zhǔn)的圖像（a*.img）。其余選項(xiàng)采用默認(rèn)設(shè)置，點(diǎn)擊上方綠色的三角開始運(yùn)行。Realign這一步也有分開進(jìn)行的，具體描述如下—— Realign: Estimate（重排參數(shù)的估計(jì)）此步驟采用最小方差原理和六參數(shù)剛體空間變換來(lái)重排從同一個(gè)被試上采集到的圖像數(shù)據(jù)。使用者所選取的第一幅圖像文件將被作為其它圖像重排的參考標(biāo)準(zhǔn)。也就是說(shuō)，你想要用哪一幅圖像作為參考標(biāo)準(zhǔn)，就先選哪一幅圖像的文件。參考圖像文件不一定非用采集到的第一幅圖像，使用最有“代表性”的一幅圖像也許更好。本步驟的目的主要是去除fMRI和PET數(shù)據(jù)中的運(yùn)動(dòng)偽影。圖像數(shù)據(jù)的頭文件會(huì)被改寫以反映數(shù)據(jù)相對(duì)空間位置的變化。此過(guò)程的具體參數(shù)會(huì)在結(jié)果窗口中以平移（translation）和旋轉(zhuǎn)（rotation）曲線圖顯示。每個(gè)session的重排參數(shù)會(huì)被存儲(chǔ)到名為 rp*.txt 的文件中。這些參數(shù)可以在最后的一般線性模型統(tǒng)計(jì)估計(jì)中作為混淆因素考慮進(jìn)去。 選擇一個(gè)被試需要進(jìn)行此步驟處理的所有sessions。注：在 coregistration 這一步，首先是對(duì)所有的session進(jìn)行重排，其具體做法是把所選每個(gè)session的第一個(gè)scan與所選第一個(gè)session的第一個(gè)scan對(duì)齊。然后再把每個(gè)session里的其它scan與該session的第一個(gè)scan進(jìn)行對(duì)齊。使用此方式進(jìn)行重排是因?yàn)楦鱾€(gè)session的數(shù)據(jù)之間可能會(huì)有較大差異。 Session選擇session里所有的scan。 Estimation Options 這里包括各種注冊(cè)參數(shù)選擇項(xiàng)，若對(duì)某一個(gè)選項(xiàng)不確定，使用軟件默認(rèn)值即可。 Quality質(zhì)量與速度的權(quán)衡。選擇高質(zhì)量以最慢的速度給出最精確的結(jié)果，低質(zhì)量以較快的速度給出較不精確的結(jié)果。此參數(shù)的設(shè)定實(shí)際影響到的是參與參數(shù)估計(jì)的象元（voxel）的數(shù)目。其依據(jù)是有些象元（voxel）其實(shí)對(duì)重排參數(shù)的估計(jì)貢獻(xiàn)不大，可以舍棄。 Separation 此參數(shù)以毫米為單位，表示對(duì)參考圖像文件進(jìn)行重采樣時(shí)采樣點(diǎn)之間的間隔。采樣點(diǎn)之間間隔越小，結(jié)果越精確，運(yùn)算速度越慢。 Smoothing (FWHM)高斯平滑的半高寬值。在估計(jì)重排參數(shù)之前一般先進(jìn)行高斯平滑。PET數(shù)據(jù)一般使用7mm。MRI數(shù)據(jù)一般使用5mm。 Num Passes Register to first: 所有圖像文件對(duì)齊注冊(cè)到第一幅圖像。 Register to mean: 使用two－pass處理將所有圖像文件對(duì)齊注冊(cè)到所有圖像文件的平均圖像。PET 數(shù)據(jù)一般注冊(cè)到平均圖像。因?yàn)镻ET數(shù)據(jù)相比f(wàn)MRI數(shù)據(jù)噪音更大，文件更少，所以時(shí)間的影響更小。MRI數(shù)據(jù)一般注冊(cè)到第一幅圖像。雖然使用two－pass處理可能更精確，但是其對(duì)效果的提高與其所損失的運(yùn)行時(shí)間相比得不償失。 Interpolation在估計(jì)最佳變換時(shí)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行重采樣的方法。高的degree提供更好的結(jié)果，但是也更慢，因?yàn)闀?huì)采樣更多的相鄰象元（voxel）[52, 53, 54]。 Wrapping此參數(shù)指示一個(gè)volume中數(shù)據(jù)wrap around in的方向（此處具體理解有待大家補(bǔ)充）。No wrapping：適用于PET數(shù)據(jù)或者已進(jìn)行過(guò)空間變換的數(shù)據(jù)。同時(shí)當(dāng)你不確定自己數(shù)據(jù)類型時(shí)，推薦使用此選項(xiàng)。Wrap in Y：適用于沒有重排（resilce）過(guò)的在Y方向上進(jìn)行相位編碼的MRI數(shù)據(jù)。 Weighting提供一個(gè)加權(quán)圖像，在估計(jì)重排參數(shù)時(shí)對(duì)參考圖像的每一個(gè)象元進(jìn)行加權(quán)。加權(quán)系數(shù)與標(biāo)準(zhǔn)差成反比。例如當(dāng)有大量額外的頭動(dòng)（如說(shuō)話或者特定區(qū)域內(nèi)的嚴(yán)重偽影）時(shí)。（此處具體理解有待大家補(bǔ)充）。 Realign: Reslice（據(jù)已估計(jì)出的參數(shù)重排） 此功能重排以上步驟中已進(jìn)行參數(shù)估計(jì)和注冊(cè)的圖像文件，使之與參考圖像文件達(dá)到象元級(jí)的匹配精確。重排后的數(shù)據(jù)被命名為：r＋原文件名。 Images選擇要重排的數(shù)據(jù)文件 Reslice Options 各種重排參數(shù)設(shè)定，若對(duì)某一個(gè)選項(xiàng)不確定，使用軟件默認(rèn)值即可。Resliced images All Images (1..n) : 重排所有數(shù)據(jù)，包括標(biāo)準(zhǔn)參考圖像（重排后還是保持原位置不變）。Images 2..n :重排除了標(biāo)
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