第二章微生物的分類、鑒定及命名(編輯修改稿)
2024-08-28 13:02 本頁(yè)面
【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 ococcus aureus Rosenbach 1884 ◆ 當(dāng)泛指某一屬微生物，而不特指該屬中某一種（或未定種名）時(shí)，可在屬名后加 ssp.（分別代表species 縮寫的單數(shù)和復(fù)數(shù)形式） 例如： Saccharomyces sp. 表示酵母菌屬中的一個(gè)種。 ◆ 菌株名稱 —— 在種名后面自行加上數(shù)字、地名或符號(hào)等，如： Bacillus subtilis AS=Academia Sinica Bacillus subtilis BF7658 BF=北紡 Clostridium acetobutylicum ATCC824 丙酮丁醇梭菌 ATCC＝ American Type Culture Collection美國(guó)模式菌種保藏中心 ◆ 當(dāng)文章中前面已出現(xiàn)過某學(xué)名時(shí)，后面的可將其屬名縮寫成 1~3個(gè)字母。 如： Escherichia coli 可縮寫成 Staphylococcus aureus可縮寫成 S. aureus ② 三名法 ： 用于對(duì)亞種的命名，這時(shí)在屬和種名后加寫一個(gè)subsp.，然后再附上亞種名稱（斜排體）。 如： Bacillus thuringiensis subsp. galleria 蘇云金芽孢桿菌臘螟亞種 形態(tài)結(jié)構(gòu)、生理生化、少量的化石資料、行為習(xí)性，等等 表型特征： 進(jìn)化指征的選擇 : b）形態(tài)特征在不同類群中進(jìn)化速度差異很大，僅根據(jù)形態(tài)推斷進(jìn)化關(guān)系往往不準(zhǔn)確； 缺點(diǎn)： a）由于微生物可利用的形態(tài)特征少，很難把所有生物放在同一水平上進(jìn)行比較； 蛋白質(zhì)、 RNA和 DNA序列進(jìn)化變化的顯著特點(diǎn)是進(jìn)化速率相對(duì)恒定，也就是說，分子序列進(jìn)化的改變量 (氨基酸或核苷酸替換數(shù)或替換百分率 )與分子進(jìn)化的時(shí)間成正比。 生物大分子作為進(jìn)化標(biāo)尺依據(jù) a）在兩群生物中，如果同一種分子的序列差異很大時(shí)， 進(jìn)化距離遠(yuǎn)，進(jìn)化過程中很早就分支了。 b）如果兩群生物同一來源的大分子的序列基本相同， 處在同一進(jìn)化水平上。 大量的資料表明：功能重要的大分子、或者大分子中功能重要 的區(qū)域，比功能不重要的分子或分子區(qū)域進(jìn)化變化速度低。 RNA作為進(jìn)化的指征 16S rRNA被普遍公認(rèn)為是一把好的譜系分析的 “ 分子尺 ” ： 1） rRNA具有重要且恒定的生理功能； 2）在 16SrRNA分子中，既含有高度保守的序列區(qū)域，又有中度保守和高度變化的序列區(qū)域，因而它適用于進(jìn)化距離不同的各類生物親緣關(guān)系的研究； 3） 16SrRNA分子量大小適中，便于序列分析； 4） rRNA在細(xì)胞中含量大 (約占細(xì)胞中 RNA的 90%)，也易于提??；
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